Escuela de Biología

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Browsing Escuela de Biología by browse.metadata.evaluator "Hernandez Torres, Jorge"

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    Diseño de un sistema CRISPR/LbCas12a y su evaluación en detección por corte de los genes 18s, H2A y Cytb de Trypanosoma cruzi en Rhodnius pallescens silvestres (Hemiptera: Reduviidae: Triatominae).
    (Universidad Industrial de Santander, 2024-04-23) Ortiz Rodriguez, Luis Alejandro; Duque Luna, Jonny Edward; Hernandez Torres, Jorge; Fuentes Lorenzo, Jorge Luis
    La enfermedad de Chagas causada por el parásito Trypanosoma cruzi es una dolencia de importancia en la salud pública. En la actualidad, los sistemas de diagnóstico del agente etiológico son diversos, abarcando desde enfoques sencillos, como la observación de frotis sanguíneo, pruebas serológicas, hasta pruebas moleculares, como la qPCR y PCR. En la búsqueda de alternativas de diagnosis que combinen eficiencia, bajo coste y precisión, se ofrece la aplicación de la tecnología CRISPR en la detección de secuencias específicas como análisis diagnóstico. El objetivo del presente trabajo consistió en diseñar un sistema de detección de ADN por corte específico utilizando la tecnología CRISPR/LbCas12a dirigido los genes Citocromo B, Subunidad ribosomal 18s y el gen de histona H2A de Trypanosoma cruzi en muestras de intestino de Rhodnius pallescens. Para ello, se implementó el sistema de corte colateral dirigido por guías de ARN diseñadas, usando amplificación por PCR y en ADN directo. La visualización del corte del amplificado, se realizó en gel de agarosa. Adicionalmente, empleando un reportero fluorescente, se evaluó el corte por espectrofotometría y confirmación visual bajo luz ultravioleta. Los resultados revelaron una eficiente capacidad de clivaje con la guía del gen Cytb, permitiendo una determinación efectiva y sensible incluso en concentraciones bajas como por ejemplo 1 ng/uL del amplificado. En contraste, en las pruebas en ADN sin preamplificación no hay evidencia del corte. El sistema CRISPR/LbCas12a con amplificación por PCR demuestró ser efectivo para la detección de Trypanosoma cruzi en el vector Rhodnius pallecens. Para que el sistema sea asequible a cualquier necesidad de laboratorio se sugiere la implementación de técnicas de amplificación isotérmica que permita reducir el tiempo de detección y la necesidad de equipamiento técnico.
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    Evaluación de las propiedades antibacterianas del veneno de una población de Lachesis Acrochorda Garcia,1986 (serpentes:viperidae) del Carmen del Chucurí, Santander.
    (Universidad Industrial de Santander, 2022-05-16) Sepúlveda González, David Arturo; Cano Calle, Herminsul de Jesús; Bayona Serrano, Juan David; Hernandez Torres, Jorge
    Las infecciones bacterianas son causa de mortalidad y morbilidad en todo el mundo. Debido a seis décadas de uso indiscriminado de antibióticos, las bacterias se han vuelto cada vez más resistentes a medida que avanza el tiempo. La resistencia a antibióticos se ha llevado a la OMS a clasificar las infecciones bacterianas dentro de las 10 principales causas de muerte en todo el mundo. Para combatir esta problemática se han investigado nuevas fuentes de agentes microbianos de origen natural. Entre ellos, los venenos de serpiente destacan por tener una alta cantidad de sustancias farmacológicamente activas debido a su composición proteica inusual y compleja. Entre las serpientes, los miembros de la familia Viperidae son conocidos por su diversidad de componentes del veneno lo que las ha llevado a ser los protagonistas en estos estudios de inhibición bacteriana. En Colombia hay 6 géneros de vipéridos, entre los cuales destaca el género Lachesis; entre sus miembros están las víboras más grandes del mundo, habitan en zonas boscosas remotas haciéndolas difícil de encontrar y mantener en cautiverio por lo que solo hay pocos estudios caracterizando la composición de su veneno, así como su perfil de inhibición bacteriano. En Santander se encuentra la especie L. acrochorda, la cual no cuenta con estudios de actividad antimicrobiana. El objetivo de este trabajo fue caracterizar la actividad antimicrobiana del veneno crudo de la serpiente L. acrochorda. El veneno liofilizado se evaluó en cuatro cepas bacterianas, dos Gram positivas y dos Gram negativas. Además, se realizó un análisis composicional del veneno mediante las técnicas de RP-HPLC y SDS-PAGE tanto unidimensional como bidimensional. El veneno pudo inhibir exitosamente las bacterias Gram positivas S. aureus y SARM. Los resultados encontrados aportan al conocimiento de la búsqueda de nuevos agentes antibacterianos en el veneno de serpiente
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    Prevalencia e identificación por microscopía de haemosporidios en aves silvestres en bosques húmedos cercanos al río Magdalena en Santander, Colombia
    (Universidad Industrial de Santander, 2024-10-28) Duarte Alvarado, María José; Rondón González, Fernando; Beltrán Toledo, Tiana Glemarjenni; Hernandez Torres, Jorge
    Los haemosporidios son parásitos sanguíneos de distribución global, transmitidos principalmente por dípteros hematófagos, que infectan vertebrados. En aves los géneros comunes son Haemoproteus, Plasmodium y Leucocytozoon; estos tienen efectos negativos en sus hospederos y se identifican mediante microscopía o técnicas moleculares. En Colombia, los estudios se han centrado en zonas de alta diversidad aviar a diferentes elevaciones, son escasos en los bosques húmedos de Santander, departamento donde las investigaciones se han enfocado en evaluar su presencia en agroecosistemas. Dado que se desconoce la prevalencia de parásitos haemosporidios en aves de bosques húmedos de Santander, el objetivo principal del presente trabajo de grado modalidad pasantía de investigación fue determinar su prevalencia de infección en 436 frotis sanguíneos de 241 individuos de aves silvestres muestreadas en el marco del proyecto VIE-UIS 3707. Para esto se empleó microscopía óptica y cámara digital para toma de medidas morfométricas y su respectivo análisis con el software ImageJ. La identificación taxonómica de los parásitos siguió el uso de guías especializadas. La prevalencia de infección se estimó en P = 14,95%, siendo el género Plasmodium el más frecuente. La intensidad de infección en general fue baja y en muestras de cinco especies de aves se visualizó en nivel medio. Este trabajo, enfocado en identificar morfológicamente haemosporidios de aves silvestres en bosques del departamento de Santander, constituye el primer reporte de Plasmodium cathemerium y P. elongatum en este departamento del nororiente colombiano.