Estandarización de la amplificación por pcr de los sistemas microsatélites rcaaag14 y asu15 en aves del género ramphocelus presentes en el departamento de Santander, Colombia

Abstract

La biología molecular y las herramientas estadísticas permiten la posibilidad de identificar y utilizar la variación genómica, la cual puede explorarse a partir del uso de marcadores moleculares tipo microsatélites dado el elevado nivel de polimorfismo que estos detectan. El genotipado de estos marcadores ayuda a cuantificar la diversidad genética y a definir el grado de subdivisión presente en poblaciones de organismos, entre otros aspectos. El objetivo de la presente pasantía de trabajo de grado fue estandarizar la amplificación mediante el uso de la Reacción en Cadena de la Ramphocelus (Ramphocelus icteronotus y R. dimidiatus), presentes en el departamento de Santander (Colombia). Estos marcadores fueron caracterizados originalmente en Ramphocelus costaricenses (RcAAAG14) y Ammodramus savannarum estudiar la diversidad genética de especies simpátricas de Ramphocelus en otras regiones de Colombia. Los dos marcadores amplificaron en muestras de R. icteronotus y R. dimidiatus. Se concluye que los productos de PCR de ambos sistemas estuvieron mejor definidos con 2,5mM de MgCl2, 52°C de temperatura de hibridación y 10 minutos de extensión final a 72°C.