Variabilidad genética del virus dengue 2 y desenlace clínico durante la epidemia del 2009 - 2010 en Colombia

Abstract

El desenlace severo obedece a un proceso multifactorial dado por el huésped y el virus. Los objetivos de este estudio fueron determinar el serotipo más asociado a severidad considerando el efecto que introduce el tipo de infección y establecer la variación del gen NS4B y E entre cepas de virus dengue serotipo 2 (VDEN-2) aisladas de pacientes con diferente desenlace clínico en ciudades endémicas de Colombia. La hipótesis fue evaluada mediante un estudio de casos y controles anidado a cohorte. Se incluyeron pacientes febriles con diagnóstico de infección por virus dengue (RT-PCR, PCR-Tiempo Real, ELISA NS1, ELISA IgM o IgG anti-dengue). Los casos fueron pacientes que desarrollaron el desenlace compuesto (hemorragia mayor o hipotensión) en línea de base o en el seguimiento. El serotipo infectante se determinó por RT-PCR o PCR-Tiempo Real. El aislamiento viral fue en células C6/36 HT. La amplificación genómica fue realizada por PCR convencional. La reconstrucción filogenética se realizó por Máximum Likelihood. El soporte estadístico de las ramas se obtuvo aplicando de 1000 réplicas. La determinación de polimorfismos se hizo por Sequence Data Explorer (MEGA v6.06). Se evaluaron 198 pacientes en línea de base como en el seguimiento. El VDEN-2 mostró asociación con los pacientes complicados (OR 6.06; IC95%: 2.10, 17.5). El tipo de infección, no se asoció con la presencia del desenlace compuesto (OR 1.58; IC95%: 0.83, 3.00). Se evaluaron 54 secuencias genómicas, en donde el genotipo fue asiático-americano; distinguiéndose el linaje 1, 2 y 3. Los polimorfismos del gen NS4B y E no se asociaron al desenlace clínico, pero sí a la procedencia. En conclusión, durante el periodo de estudio en Colombia circuló el genotipo Asiático-Americano del VDEN-2. El serotipo asociado al desarrollo de formas severas de la enfermedad fue el VDEN-2. Los polimorfismos presentes en el gen E y gen NS4B del virus dengue no se asociaron a severidad, pero sí con la procedencia del virus.