Modelamiento de complejos de Michaelis entre la lipasa b de Cándida Antárctica y el (r,s)-atenolol. análisis comparativo: autodock4.2 y vina

Abstract

El acoplamiento molecular (Molecular Docking) se puede utilizar para analizar detalles de los mecanismos de reacción catalizados por enzimas. En el Grupo de Bioquímica Teórica, el acoplamiento molecular se ha utilizado para el estudio de los complejos entre la lipasa B de Candida antarctica (CalB) y el propranolol. Este aminoalcohol se usa como medicamento contra la hipertensión y se vende como mezcla racémica. Uno de los dos isómeros presenta efectos colaterales. De ahí la importancia de contribuir a comprender el mecanismo de la acilación de los enantiómeros de aminoalcoholes catalizado por CalB. En este trabajo de grado para optar al título de Química se realizó un estudio comparativo de los complejos entre CalB y el (R,S)-atenolol obtenidos utilizando los programas AutoDock4.2 y Vina. El (R,S)-atenolol es otro aminoalcohol utilizado como antihipertensivo. Los complejos de Michaelis entre CalB y el (R,S)-atenolol se modelaron utilizando un enfoque rígido. Para el análisis se tuvo en cuenta la población de complejos de Michaelis obtenida con cada programa, la energía libre de unión, los modos de unión del (R,S)-atenolol en el sitio activo de CalB y las interacciones no covalentes entre el sustrato y la enzima. Los resultados de este estudio indican que los complejos de Michaelis (MCCs) obtenidos con Vina tienen una energía libre de unión mayor que los obtenidos con AutoDock4.2. Con ambos programas se obtiene un número de MCCs similar y dos tipos de modos de unión del atenolol en el sitio activo de CalB. Esto permite concluir que tanto Autodock4.2 como Vina pueden utilizarse de manera indistinta para predecir la formación de complejos de Michaelis entre la lipasa B de Candida antarctica y los aminoalcoholes (R,S)-atenolol y (R,S)-propranol.