Synthesis and nanostructural characterization of polyacrylamide hydrogels used as sieving matrix in dna electrophoresis

Abstract

Los hidrogeles poliméricos juegan un papel importante al ser empleados como matrices porosas o tamices en electrofóresis de biomoleculas cargadas como AND y proteínas. Con el fin de seleccionar hidrogeles que posean propiedades apropiadas para estas bioseparaciones, es importante conocer y entender la morfología del poro en las redes poliméricas y los parámetros a través de los cuales este puede ser modificado. Sin embargo, la compleja reacción de polimerización puede afectar fuertemente la estructura del gel resultante y por el momento no es posible predecir la nanoestructura final y las propiedades físicas del gel a partir de las condiciones de síntesis. De otro lado, la gran cantidad de agua que pueden absorber los hidrogeles y la fragilidad mecánica de estos materiales están retando las herramientas de caracterización disponibles. Reología in-situ y termoporometría fueron empleadas como herramientas de caracterización para medir la estructura porosa (tamaño de poro promedio y distribución de poros) de hidrogeles de poliacrilamida polimerizados por polimerización química y fotopolimerización y empleando agua desionizada, solución buffer 1x-TBE y solución buffer 1x-TBE-urea como solventes de polimerización. Los hidrogeles polimerizados en presencia de buffer 1x-TBE-urea fueron completamente transparentes en todas las formulaciones de gel estudiadas y exhibían menor tamaño promedio de poro que aquellos que fueron polimerizados en agua y solución buffer 1x-TBE.