Análisis metagenómico e identificación de microorganismos indicadores de la alteración de la calidad del agua en el embalse de Bucaramanga

Abstract

El objetivo del presente estudio se centró en establecer la composición y abundancia de las comunidades microbianas totales y de bioindicadores asociados a la alteración de la calidad microbiológica y fisicoquímica del agua en el embalse de Bucaramanga, utilizando un abordaje metagenómico. Para ello Se realizaron muestreos mensuales durante tres meses en cuatro puntos del embalse, recolectando 500 ml de agua por muestra. Las muestras fueron filtradas al vacío mediante membranas de 0,2 µm y se extrajo el ADN utilizando un kit comercial. A partir del ADN extraído se prepararon librerías compatibles con la química R10.4.1, secuenciándose 12 muestras en un secuenciador MinION MK1B, generándose un aproximado de 4 Gb de datos. Los datos fueron analizados mediante el pipeline SqueezeMeta y procesados en R Studio con herramientas bioinformáticas para su análisis gráfico y estadístico. Se describió por primera vez la estructura de las comunidades microbianas del Embalse de Bucaramanga, identificándose 675 géneros microbianos dominados por bacterias y eucariotas, detectandose bioindicadores de alteración microbiológica y fisicoquímica, destacando géneros como Escherichia, Pseudomonas, Synechococcus y Chrysochromulina, que se encuentran asociados a infecciones emergentes de interés en salud pública, floraciones tóxicas de cianobacterias y algas. Se evidenció correlación estadísticamente significativa entre variables fisicoquímicas como el oxígeno disuelto, concentración de carbono orgánico total y la abundancia microbiana, destacando los géneros Terrimonas y Anaerolinea como bioindicadores ambientales de este sistema de agua embalsada, subrayando la utilidad del enfoque metagenómico para el monitoreo ecológico de fuentes hídricas.