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Variación genética y morfológica del nematodo quiste de la papa Globodera pallida (Nematoda: Heteroderidae) en el Centro y Nororiente de Colombia

dc.contributor.advisorHolguín Aranzazu, Claudia María
dc.contributor.advisorMarchant Rojas, Sergio Andrés
dc.contributor.authorVillalba Campos, Leonardo
dc.contributor.evaluatorCortes Vera, Andrés Javier
dc.contributor.evaluatorHazzi Campo, Nicolas
dc.date.accessioned2026-06-03T11:19:34Z
dc.date.created2026-05-28
dc.date.embargoEnd2026-05-28
dc.date.issued2026-05-28
dc.description.abstractLos nematodos formadores de quiste (Globodera spp.) representan una de las principales amenazas para el cultivo de la papa a nivel mundial debido a las severas pérdidas económicas que ocasionan. En Colombia, la exclusión de Globodera pallida del listado de plagas de control oficial en 2004 coincide con reportes recientes de su expansión hacia nuevas áreas agrícolas. El objetivo de este estudio fue evaluar la variación morfológica, estimar la diversidad genética y reconstruir la historia demográfica de poblaciones de G. pallida provenientes de cuatro departamentos (Boyacá, Cundinamarca, Santander y Norte de Santander). Se implementó un enfoque multivariado (PCA) para los caracteres biométricos, mientras que la estructura genética y la biogeografía se evaluaron utilizando secuencias de los genes mitocondriales COI y CytB, empleando Análisis Discriminan-te de Componentes Principales (DAPC) y simulaciones coalescentes (fastsimcoal2) bajo tres escenarios evolutivos alternativos. Los resultados confirmaron un incremento sustancial en las densidades de quistes respecto a reportes históricos. Morfológicamente, el PCA evidenció un profundo solapamiento fenotípico entre los linajes, lo cual sugiere un posible estasis evolutivo o una alta plasticidad adaptativa que limita la resolución de la biometría clásica para la delimitación poblacional. A nivel molecular, se detectó una alta diversidad haplotípica y una estructuración geográfica robusta. El modelado demográfico favoreció un escenario de aislamiento secuencial, sugiriendo que las poblaciones septentrionales conforman un “Clado Norte” estructurado. Los patrones de diversidad y las topologías de las redes haplotípicas indican que el linaje invasor habría experimentado un severo cuello de botella seguido de una rápida expansión demográfica (efecto fundador). Este escenario postula que el norte de los Andes podría haber actuado como un puente evolutivo y fuente inmediata para el establecimiento del clado global, ofreciendo una perspectiva complementaria a la hipótesis de dispersión directa desde los Andes centrales. Estos hallazgos subrayan la urgencia de reactivar protocolos de vigilancia fitosanitaria basados en genómica y resaltan la importancia de esta diversidad regional para los programas de mejoramiento de variedades resistentes.
dc.description.abstractenglishPotato cyst nematodes (Globodera spp.) represent one of the main threats to potato cultivation worldwide due to the severe economic losses they cause. In Colombia, the exclusion of Globodera pallida from the official quarantine pest list in 2004 coincides with recent reports of its expansion into new agricultural areas. The objective of this study was to evaluate the morphological variation, estimate the genetic diversity, and reconstruct the demographic history of G. pallida populations from four departments (Boyacá, Cundinamarca, Santander, and Norte de Santan-der). A multivariate approach (PCA) was implemented for biometric traits, while genetic structure and biogeography were assessed using sequences from the COI and CytB mitochondrial genes, employing Discriminant Analysis of Principal Components (DAPC) and coalescent simulations (fastsimcoal2) under three alternative evolutionary scenarios. The results confirmed a substantial increase in cyst densities compared to historical re-ports. Morphologically, the PCA revealed a profound phenotypic overlap among lineages, suggesting possible evolutionary stasis or high adaptive plasticity that limits the resolution of classical biometry for population delimitation. At the molecular level, high haplotype diversity and robust geographic structuring were detected. Demographic modeling favored a sequential isolation scenario, suggesting that northern populations form a structured “Northern Clade”. Diversity patterns and haplotype network topologies indicate that the invasive lineage likely experienced a severe bottleneck followed by rapid demographic expansion (founder effect). This scenario postulates that the northern Andes might have acted as an evolutionary bridge and immediate source for the establishment of the global clade, offering a complementary perspective to the hypothesis of direct dispersal from the central Andes. These findings underscore the urgent need to reactivate genomics-based phytosanitary surveillance protocols and highlight the importance of this regional diversity for breeding programs aimed at developing resistant varieties
dc.description.degreelevelMaestría
dc.description.degreenameMagíster en Biología
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.identifier.instnameUniversidad Industrial de Santander
dc.identifier.reponameUniversidad Industrial de Santander
dc.identifier.repourlhttps://noesis.uis.edu.co
dc.identifier.urihttps://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/47668
dc.language.isospa
dc.publisherUniversidad Industrial de Santander
dc.publisher.facultyFacultad de Ciencias
dc.publisher.programMaestría en Biología
dc.publisher.schoolEscuela de Biología
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.coarhttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.creativecommonsAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)
dc.rights.licenseAtribución-NoComercial-SinDerivadas 2.5 Colombia (CC BY-NC-ND 2.5 CO)
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.subjectNematodos quiste de la papa
dc.subjectGlobodera pallida
dc.subjectCoalescencia
dc.subjectDAPC
dc.subjectBiogeografía evolutiva
dc.subjectGenoma mitocondrial
dc.subject.keywordPotato cyst nematodes
dc.subject.keywordGlobodera pallida
dc.subject.keywordCoalescence
dc.subject.keywordDAPC
dc.subject.keywordEvolutionary biogeography
dc.subject.keywordMitochondrial genome
dc.titleVariación genética y morfológica del nematodo quiste de la papa Globodera pallida (Nematoda: Heteroderidae) en el Centro y Nororiente de Colombia
dc.title.englishGenetic and morphological variation of the potato cyst nematode Globodera pallida (Nematoda: Heteroderidae) in Central and Northeastern Colombia
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/resource_type/c_bdcc
dc.type.hasversionhttp://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
dc.type.localTesis/Trabajo de grado - Monografía - Maestría
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