Logotipo del repositorio

Publicación:
Estudio teórico de las interacciones entre el radical anión superóxido y el 1,4-pentadieno

dc.contributor.advisorDaza Espinosa, Martha Cecilia
dc.contributor.authorZarate Bonilla, Ximena Del Pilar
dc.date.accessioned2024-03-03T17:04:15Z
dc.date.available2008
dc.date.available2024-03-03T17:04:15Z
dc.date.created2008
dc.date.issued2008
dc.description.abstractEn la presente tesis de pre-grado se exploró la superficie de energía potencial de la supermolécula constituida por el anión superóxido y el 1,4-pentadieno, molécula modelo de un lípido 1,4 poli-insaturado. Sobre la superficie de energía potencial (SEP) del 1,4-pentadieno se localizaron tres estructuras energéticamente estables con simetría C2, CS y C1 utilizando UB3LYP y las bases 6-31G(d), 6-31+G(2d,p) y 6-311+G(3df,2p). Se exploró la SEP de estas estructuras en la interacción con el radical anión superóxido y se localizaron doce mínimos. Se calculó la energía de interacción de estos complejos y el error de superposición de bases por el método de Contrapeso de Boys y Bernardi. Los complejos son estabilizados por interacciones C-H···O y se aplicó la teoría de Átomos en Moléculas (AIM) para el análisis de la superficie de densidad de carga electrónica utilizando la función de onda UB3LYP/6-311+G(3df,2p) para su caracterización. De acuerdo con la energía de formación de los complejos (rango -8,0 y -12,0 kcal/mol), los valores para la densidad de carga (r), el laplaciano de la densidad de carga, 2(r), en los puntos críticos de enlace intermoleculares (3,-1), y los criterios propuestos por Popelier, las interacciones C-H···O son puentes de hidrógeno débiles. Puesto que el radical anión superóxido puede abstraer hidrógenos lábiles, se estudio este tipo de reacción. Se construyeron tres perfiles de la coordenada de reacción para la abstracción de un hidrógeno metilénico del 1,4-pentadieno por el anión superóxido; los estados de transición se localizaron usando el método de Tránsito Sincrónico Cuadrático cuasi-Newton de segundo orden (QST2). Además, se realizó un análisis comparativo de los
dc.description.abstractenglishThe 1,4-pentadiene was used as model of a 1,4 poli-insaturated lipid. First, the 1,4-pentadiene potential energy surface was characterized, in order to consider the symmetry effect. Then, the interactions between superoxide anion and the three different energetically stable configurations of 1,4-pentadiene ŒC2, CS and C1 symmetry- were explored, using UB3LYP with the 6-31G(d), 6-31+G(2d,p) and 6-311+G(3df,2p) basis sets. The characterization of the potential energy surface of the superoxide anion and 1,4-pentadiene yielded twelve different complexes. Basis superposition error (BSSE) was corrected by counterpoise procedure of Boys and Bernardi. A hydrogen bond analysis in the complexes were done using the Atoms in Molecules theory (AIM) with the UB3LYP/6-311+G(3df,2p) wave functions. According with the values of binding energies (between -8.0 and -12.0 kcal/mol), the electronic charge density (r), the laplacian of the charge density, 2(r) and other criteria proposed by Popelier to characterize hydrogen bonds, the C-H···O hydrogen bonds can be classified as weak. Superoxide anion can be an oxidant and abstract labile hydrogen; we study this reaction. Were build three possible coordinate profiles for the methylenic H-abstraction reaction of 1,4-pentadiene by superoxide anion; the transition states were located using the Quadratic Synchronous Transit cuasi-Newton method (QST2). Each reaction profiles presents 9,06, 14,84 and 11,17 kcal/mol G values. In addition, there was realized a comparative analysis of the structural changes of 1,4-pentadiene in the hydrogen abstraction process and we conclude that this reaction may be a concerted hydrogen atom abstraction by superoxide anion and that the reaction is
dc.description.degreelevelPregrado
dc.description.degreenameQuímico
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.identifier.instnameUniversidad Industrial de Santander
dc.identifier.reponameUniversidad Industrial de Santander
dc.identifier.repourlhttps://noesis.uis.edu.co
dc.identifier.urihttps://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/21123
dc.language.isospa
dc.publisherUniversidad Industrial de Santander
dc.publisher.facultyFacultad de Ciencias
dc.publisher.programQuímica
dc.publisher.schoolEscuela de Química
dc.rightshttp://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.creativecommonsAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)
dc.rights.licenseAttribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0
dc.subjectAnión superóxido
dc.subjectSuperficie de energía potencial (PES)
dc.subjectTeoría de Átomos en Moléculas (AIM)
dc.subjectDensidad de carga
dc.subject.keywordSuperoxide anion
dc.subject.keywordPotential Energy Surface (PES)
dc.subject.keywordAtoms in Molecules theory (AIM)
dc.subject.keywordElectronic charge
dc.titleEstudio teórico de las interacciones entre el radical anión superóxido y el 1,4-pentadieno
dc.title.englishTheoretical study of the interactions between superoxide anion radical and 1,4-pentadiene
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
dc.type.hasversionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.localTesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado
dspace.entity.typePublication

Archivos

Bloque original

Mostrando 1 - 2 de 2
Cargando...
Miniatura
Nombre:
Documento.pdf
Tamaño:
1.38 MB
Formato:
Adobe Portable Document Format
Cargando...
Miniatura
Nombre:
Nota de proyecto.pdf
Tamaño:
222.76 KB
Formato:
Adobe Portable Document Format

Colecciones

VIGILADA MINEDUCACIÓN

Ordenanza No. 83 de 1.944 (junio 22)

Carácter académico: Universidad

Notificaciones judiciales: notjudiciales@uis.edu.co 

.

Código SNIES: 1204   Nit: 890.201.213-4

Línea Anticorrupción:  +57 (601) 562 9300 EXT: 3633

Línea transparente: +57 (607) 630 3031