Publicación: Estudio teórico de las interacciones entre el radical anión superóxido y el 1,4-pentadieno
| dc.contributor.advisor | Daza Espinosa, Martha Cecilia | |
| dc.contributor.author | Zarate Bonilla, Ximena Del Pilar | |
| dc.date.accessioned | 2024-03-03T17:04:15Z | |
| dc.date.available | 2008 | |
| dc.date.available | 2024-03-03T17:04:15Z | |
| dc.date.created | 2008 | |
| dc.date.issued | 2008 | |
| dc.description.abstract | En la presente tesis de pre-grado se exploró la superficie de energía potencial de la supermolécula constituida por el anión superóxido y el 1,4-pentadieno, molécula modelo de un lípido 1,4 poli-insaturado. Sobre la superficie de energía potencial (SEP) del 1,4-pentadieno se localizaron tres estructuras energéticamente estables con simetría C2, CS y C1 utilizando UB3LYP y las bases 6-31G(d), 6-31+G(2d,p) y 6-311+G(3df,2p). Se exploró la SEP de estas estructuras en la interacción con el radical anión superóxido y se localizaron doce mínimos. Se calculó la energía de interacción de estos complejos y el error de superposición de bases por el método de Contrapeso de Boys y Bernardi. Los complejos son estabilizados por interacciones C-H···O y se aplicó la teoría de Átomos en Moléculas (AIM) para el análisis de la superficie de densidad de carga electrónica utilizando la función de onda UB3LYP/6-311+G(3df,2p) para su caracterización. De acuerdo con la energía de formación de los complejos (rango -8,0 y -12,0 kcal/mol), los valores para la densidad de carga (r), el laplaciano de la densidad de carga, 2(r), en los puntos críticos de enlace intermoleculares (3,-1), y los criterios propuestos por Popelier, las interacciones C-H···O son puentes de hidrógeno débiles. Puesto que el radical anión superóxido puede abstraer hidrógenos lábiles, se estudio este tipo de reacción. Se construyeron tres perfiles de la coordenada de reacción para la abstracción de un hidrógeno metilénico del 1,4-pentadieno por el anión superóxido; los estados de transición se localizaron usando el método de Tránsito Sincrónico Cuadrático cuasi-Newton de segundo orden (QST2). Además, se realizó un análisis comparativo de los | |
| dc.description.abstractenglish | The 1,4-pentadiene was used as model of a 1,4 poli-insaturated lipid. First, the 1,4-pentadiene potential energy surface was characterized, in order to consider the symmetry effect. Then, the interactions between superoxide anion and the three different energetically stable configurations of 1,4-pentadiene ŒC2, CS and C1 symmetry- were explored, using UB3LYP with the 6-31G(d), 6-31+G(2d,p) and 6-311+G(3df,2p) basis sets. The characterization of the potential energy surface of the superoxide anion and 1,4-pentadiene yielded twelve different complexes. Basis superposition error (BSSE) was corrected by counterpoise procedure of Boys and Bernardi. A hydrogen bond analysis in the complexes were done using the Atoms in Molecules theory (AIM) with the UB3LYP/6-311+G(3df,2p) wave functions. According with the values of binding energies (between -8.0 and -12.0 kcal/mol), the electronic charge density (r), the laplacian of the charge density, 2(r) and other criteria proposed by Popelier to characterize hydrogen bonds, the C-H···O hydrogen bonds can be classified as weak. Superoxide anion can be an oxidant and abstract labile hydrogen; we study this reaction. Were build three possible coordinate profiles for the methylenic H-abstraction reaction of 1,4-pentadiene by superoxide anion; the transition states were located using the Quadratic Synchronous Transit cuasi-Newton method (QST2). Each reaction profiles presents 9,06, 14,84 and 11,17 kcal/mol G values. In addition, there was realized a comparative analysis of the structural changes of 1,4-pentadiene in the hydrogen abstraction process and we conclude that this reaction may be a concerted hydrogen atom abstraction by superoxide anion and that the reaction is | |
| dc.description.degreelevel | Pregrado | |
| dc.description.degreename | Químico | |
| dc.format.mimetype | application/pdf | |
| dc.identifier.instname | Universidad Industrial de Santander | |
| dc.identifier.reponame | Universidad Industrial de Santander | |
| dc.identifier.repourl | https://noesis.uis.edu.co | |
| dc.identifier.uri | https://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/21123 | |
| dc.language.iso | spa | |
| dc.publisher | Universidad Industrial de Santander | |
| dc.publisher.faculty | Facultad de Ciencias | |
| dc.publisher.program | Química | |
| dc.publisher.school | Escuela de Química | |
| dc.rights | http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ | |
| dc.rights.accessrights | info:eu-repo/semantics/openAccess | |
| dc.rights.creativecommons | Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0) | |
| dc.rights.license | Attribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0) | |
| dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0 | |
| dc.subject | Anión superóxido | |
| dc.subject | Superficie de energía potencial (PES) | |
| dc.subject | Teoría de Átomos en Moléculas (AIM) | |
| dc.subject | Densidad de carga | |
| dc.subject.keyword | Superoxide anion | |
| dc.subject.keyword | Potential Energy Surface (PES) | |
| dc.subject.keyword | Atoms in Molecules theory (AIM) | |
| dc.subject.keyword | Electronic charge | |
| dc.title | Estudio teórico de las interacciones entre el radical anión superóxido y el 1,4-pentadieno | |
| dc.title.english | Theoretical study of the interactions between superoxide anion radical and 1,4-pentadiene | |
| dc.type.coar | http://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce | |
| dc.type.hasversion | http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f | |
| dc.type.local | Tesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado | |
| dspace.entity.type | Publication |
