Análisis espacial de dendrímeros de base amino con diferentes ligandos en presencia de agua, utilizando simulaciones de dinámica molecular

Abstract

La búsqueda de nuevos materiales abre la oportunidad del empleo de dendrímeros como soporte para diversas aplicaciones, tales como la catálisis. La comprensión del comportamiento de estas estructuras se hace necesaria, motivando su estudio mediante métodos que sean representativos del comportamiento de las estructuras bajo diversas condiciones. El presente estudio plantea el uso de las simulaciones de dinámica molecular como herramienta, permitiendo la determinación de valores de distancia dentro de la estructura y la comprensión de su conformación al realizar cambios en la misma. Se encontró que la alteración de la estructura al modificar los ligandos entre las generaciones ocasiona cambios en comportamiento, de forma que al extender el tamaño de la estructura mediante la adición de ligandos de mayor longitud la estabilidad estructural disminuye y la movilidad de las formaciones dendríticas aumenta. Adicional a esto la conformación espacial extendida tiende a ser menor, ya que se observó que las terminaciones presentan una tendencia a plegarse sobre sí mismas, siendo esto perjudicial para la accesibilidad de los posibles sitios activos que se presentarían como sustituyentes de los grupos funcionales terminales. Se determinó que esos cambios son debidos a la mayor flexibilidad obtenida por la estructura al poseer ligandos más extensos y flexibles, y que la misma se puede ver reducida con la presencia de un medio que limite su movimiento.