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Conformación molecular en agregado de colesterol : análisis a través de la simulación de Monte Carlo

dc.contributor.advisorMorales Medina, Giovanni
dc.contributor.advisorMartinez Rey, Ramiro
dc.contributor.authorOchoa Mayorga, Fredy Martin
dc.contributor.authorJaimes Ortiz, Luz Yaneida
dc.date.accessioned2024-03-03T22:36:45Z
dc.date.available2016
dc.date.available2024-03-03T22:36:45Z
dc.date.created2016
dc.date.issued2016
dc.description.abstractEl colesterol es una molécula que posee gran importancia en la fisiología de los vertebrados ya que es la base para otros compuestos y funciones de importancia celular –síntesis de hormonas y regulación de la fluidez de las células y permeabilización de iones–. Sin embargo, sus niveles deben mantenerse dentro del margen establecido para que no cause daños en la salud; algunos estudios relacionan la deficiencia del colesterol en el organismo con ciertos trastornos mentales. Asimismo, el exceso de colesterol ocasiona el aumento en los niveles de concentración en la sangre desencadenado procesos de aglomeración y posterior precipitación debido a su tendencia a formar agregados. A pesar de su importancia, se encuentran pocos reportes sobre la agregación de colesterol en la literatura abierta. Por tal motivo, el presente trabajo fue dedicado al análisis de la agregación de moléculas de colesterol en fase gaseosa, con el objetivo de determinar las interacciones predominantes. Para ello se planteó una serie de simulaciones utilizando el software libre Towhee mediante el método de Monte Carlo con el campo de fuerza CHARMM27. Las distintas configuraciones fueron analizadas considerando número de moléculas de colesterol entre 2 y 5. Según los resultados, los valores geométricos para el colesterol utilizando Towhee, concuerdan con los reportados por mediciones de rayos X y por cálculos con CHARMM36. En los agregados, las interacciones entre átomos con baja polaridad presentan la mayor contribución en la formación de agregados de hasta 5 moléculas de colesterol. Asimismo, la contribución por puente de hidrógeno aumenta con el número de agregados, presentando una interacción apreciable en la estabilización del agregado de cinco átomos de colesterol.
dc.description.abstractenglishMolecular conformation of cholesterol aggregates: analysis through monte carlo simulation
dc.description.degreelevelPregrado
dc.description.degreenameIngeniero Químico
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.identifier.instnameUniversidad Industrial de Santander
dc.identifier.reponameUniversidad Industrial de Santander
dc.identifier.repourlhttps://noesis.uis.edu.co
dc.identifier.urihttps://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/34308
dc.language.isospa
dc.publisherUniversidad Industrial de Santander
dc.publisher.facultyFacultad de Ingenierías Fisicoquímicas
dc.publisher.programIngeniería Química
dc.publisher.schoolEscuela de Ingeniería Química
dc.rightshttp://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.creativecommonsAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)
dc.rights.licenseAttribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0
dc.subjectColesterol
dc.subjectTowhee
dc.subjectMonte Carlo
dc.subjectAgregación
dc.subjectSimulación Molecular
dc.subjectCharmm27.
dc.subject.keywordCholesterol is a molecule that has great importance in the physiology of vertebrates since it is the basis for other compounds and cell functions -synthesis of hormones and the cell’s regulation flow and ion permeabilization-. However
dc.subject.keywordcholesterol levels must be kept within the established range to maintain body’s health; some studies associate deficiency of cholesterol in the body with certain mental disorders. Likewise
dc.subject.keywordcholesterol excesses in bloodstream can cause agglomeration and subsequent precipitation processes because of their tendency to form aggregates. Despite its importance
dc.subject.keywordthere are a few open reports that deals with the process of cholesterol aggregation. The current work has been devoted to the analysis of aggregation of cholesterol in gas phase
dc.subject.keywordin order to determine the predominant interactions between cholesterol molecules. For this
dc.subject.keywordseveral Monte Carlo simulations using CHARMM27 force field were carried out in Towhee an open source molecular modeling software. Different configurations were analyzed considering between 2 and 5 cholesterol molecules. According to the results obtained in this work
dc.subject.keywordthe geometry parameters for the cholesterol molecule reported by the simulations using Towhee
dc.subject.keywordare consistent with those reported by measurements of X-ray and by theoretical calculations with CHARMM36. With respect to aggregates
dc.subject.keywordintermolecular interactions between nonpolar atoms reported the greatest contribution to the formation of aggregates of up to 5 molecules of cholesterol. In addition
dc.subject.keywordthe contribution of hydrogen bond increases with the number of aggregates
dc.subject.keywordpresenting an appreciable contribution to the stabilization for the aggregate of 5 cholesterol molecules.
dc.titleConformación molecular en agregado de colesterol : análisis a través de la simulación de Monte Carlo
dc.title.englishCholesterol, Towhee, Monte Carlo, Aggregation, Molecular Simulation, Charmm27.
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
dc.type.hasversionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.localTesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado
dspace.entity.typePublication

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