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Uso de fenilenvinilenos como matrices maldi para procesos de decaimiento en la fuente de péptidos modelo

dc.contributor.advisorCastellanos García, Laura Juliana
dc.contributor.authorRamírez Granados, Judith Raquel
dc.contributor.authorCombariza Montañez, Marianny Yajaira
dc.date.accessioned2024-03-03T22:16:30Z
dc.date.available2015
dc.date.available2024-03-03T22:16:30Z
dc.date.created2015
dc.date.issued2015
dc.description.abstractCon el objetivo de determinar el desempeño de una serie de moléculas tipo fenilenvinileno (FV) como matrices MALDI de decaimiento en la fuente (ISD) para la ionización de péptidos modelo, se realizaron pruebas espectroscópicas y de espectrometría de masas a tres moléculas de fenilenvinileno. Las propiedades espectroscópicas de los FV se compararon con los valores registrados para matrices MALDI convencionales. Las absortividades molares a 355 nm para estos sistemas presentaron resultados superiores a la matriz de referencia CHCA, lo que implica una mayor capacidad de interacción de las moléculas FV con el láser MALDI. Los estudios de espectrometría de masas (EM) MALDI-ISD realizados a la insulina y al citocromo c con matrices convencionales mostraron mejores resultados para la matriz 1,5-DAN. Con esta molécula se pudo determinar una mayor cobertura en la secuenciación de los aminoácidos del péptido/proteína en comparación al sDHB y al CHCA. La fragmentación de péptidos y proteínas por ISD trascurre a través de un proceso radicalario, en donde la matriz brinda hidrogeno radical para iniciar la fragmentación en la fuente. Los FV estudiados registran la pérdida de un radical OH en el espectro de masas. Se buscó aprovechar esta capacidad para inducir la fragmentación de péptidos y proteínas modelo. Sin embargo, la reactividad de los radicales OH es muy baja en comparación con la de los radicales H y los resultados arrojaron que no se indujo fragmentación en péptidos y proteínas usando matrices FV por ISD. ______________________________
dc.description.abstractenglishSpectroscopic and mass spectrometry tests were performed in three phenylenevinylene (PV) molecules in order to determine their performance as In Source Decay (ISD) MALDI matrices for the ionization of model peptides. The spectroscopic properties of PVs were compared with those reported for conventional MALDI matrices. Molar absorptivities at 355 nm are higher for PVs than CHCA reference matrix, this fact implies a higher interaction between PVs with MALDI Nd:YAG laser wavelength. Mass spectrometry experiments MALDI-ISD with different conventional ISD matrices, showed better results using 1,5-DAN. Experiments were performed using insulin and cytochrome C. 1,5-DAN allowed to increase the amino acid sequence coverage of insulin and cytochrome C compared to sDHB and CHCA. MALDI-ISD is performed through a radical mediated mechanism, in which the ISD matrix gives radical hydrogen to begin the In-Source fragmentation. The PVs studied showed radical OH loss in the mass spectrometry spectrum. We used this property to induced ISD peptides and proteins fragmentation, however radical OH reactivity is very low compared with the reactivity of H radicals. Results showed that no ISD fragmentation can be induced in peptides and proteins using FV matrices.
dc.description.degreelevelPregrado
dc.description.degreenameQuímico
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.identifier.instnameUniversidad Industrial de Santander
dc.identifier.reponameUniversidad Industrial de Santander
dc.identifier.repourlhttps://noesis.uis.edu.co
dc.identifier.urihttps://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/33612
dc.language.isospa
dc.publisherUniversidad Industrial de Santander
dc.publisher.facultyFacultad de Ciencias
dc.publisher.programQuímica
dc.publisher.schoolEscuela de Química
dc.rightshttp://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.creativecommonsAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)
dc.rights.licenseAttribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0
dc.subjectEspectrometría De Masas Maldi. Matrices Maldi
dc.subjectDecaimiento En La Fuente (Isd).
dc.subject.keywordMaldi Mass Spectrometry
dc.subject.keywordMaldi Matrices
dc.subject.keywordMaldi
dc.subject.keywordIn Source Decay (Isd).
dc.titleUso de fenilenvinilenos como matrices maldi para procesos de decaimiento en la fuente de péptidos modelo
dc.title.englishUse of phenylvinylene as maldi matrices for in source decay processes of models peptides
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
dc.type.hasversionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.localTesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado
dspace.entity.typePublication

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