Estudio teórico de la formación de dímeros a partir de (50-56)b2-microglobulina

Abstract

La 2-microglobulina es una proteína que forma material amiloide en pacientes con deficiencia renal, sometidos a largos tratamientos de diálisis. Durante el proceso de oligomerización de la proteína se observa en la primera etapa, la formación de dímeros de 2m. Basados en estudios realizados por Miranker y colaboradores en los que la 2m-P32A, muestra en la interfaz del dímero formado por dos monómeros de 2m, la interacción entre los heptapéptidos formados por los aminoácidos Glu50 Œ Phe56. Con esto en mente se decidió realizar un estudio teórico mediante el cual se realizó inicialmente un análisis de docking molecular, obteniendo las conformaciones más estables de dicho dímero. Posteriormente un estudio de dinámica molecular, mostró que efectivamente este heptapéptido tenía la capacidad de formar aglomerados, esto ayudado con el hecho que los heptapéptidos en las conformaciones más estables se encontraban en posiciones antiparalelas, y posteriormente el análisis del área superficial accesible al solvente mostró que el área del monómero del heptapéptido disminuía a medida que el dímero iba siendo formado, esto indicando que los monómeros se agrupaban permitiendo la formación de puentes de hidrógeno, los cuales se observaron entre los aminoácidos Leu54(Heptapéptido 1) y Phe56(Heptapéptido 2). En este estudio también se analizó la energía libre de Gibbs observando que este proceso de presenta de manera espontánea.