Simulación de Montecarlo para el análisis de las interacciones entre el colesterol y el dppc

Abstract

Se presenta un modelo de simulación molecular del sistema colesterol-DPPC en medio continúo con el propósito de observar sus interacciones y las fuerzas involucradas en ellas. Las simulaciones de las moléculas se desarrollan por el método Monte Carlo utilizando el campo de fuerza Charmm 27 a condiciones de 300 K y una atmosfera de presión. La etapa inicial se centra en la optimización de las estructuras de colesterol-DPPC en vacío y en medio acuoso, con el propósito de seleccionar las configuraciones de menor energía para luego incluirlas en un mismo medio de simulación; seguidamente se procede a simular sistemas de 1 molécula de colesterol con 1 a 5 moléculas de DPPC y el sistema 2-3 moléculas de colesterol-DPPC, utilizando el método de solvatación implícita que representa al agua como un medio continuo. Se obtuvo que la energía más representativa para los sistemas en vacío fue la de coulomb. Para el sistema acuoso las de van der Waals, mientras la energía tipo Coulomb resulto prácticamente despreciable. Para los sistemas 1-3 y 1-4 moléculas colesterol-DPPC se presentó un valor de delta de energía de interacción negativa, que indica estabilidad de los complejos debido al aporte entálpico. Para los otros sistemas, la energía de interacción es positiva por lo que resultan inestables. Se concluye que los conglomerados de moléculas de DPPC y colesterol indican requerimiento energético para lograr las posiciones de estabilidad.