Implementación de una metodología "top down" para identificar proteínas intactas mediante espectrometría de masas maldi-tof y decaimiento en la fuente (malhsd)

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dc.contributor.advisorMejía Ospino, Enrique
dc.contributor.authorNova Guaracao, Lucia Cristina
dc.date.accessioned2024-03-03T20:10:32Z
dc.date.available2013
dc.date.available2024-03-03T20:10:32Z
dc.date.created2013
dc.date.issued2013
dc.description.abstractCon el fin de implementar la metodología TOP DOWN, para el análisis de proteínas intactas por medio de espectrometría de masas MALDI-ISD; se realizaron pruebas preliminares para establecer un protocolo óptimo de preparación de muestras. Utilizando albúmina sérica bovina (BSA) como patrón, se probaron dos matrices: ácido 2,5 dihidroxibenzóico (DHB) y ácido sinapínico (SA), las cuáles se aplicaron con los métodos de preparación drieddropletydoublelayer. Se observó que la matriz más adecuada para este tipo de análisis fue DHB, por su mayor efectividad para producir fragmentación en la estructura primaria de las proteínas, y se aplicó siguiendo el método de preparación drieddroplet. También se observó que el método de preparación, así como la matriz, son de gran importancia en este tipo de análisis, pues tienen un marcado efecto sobre la aparición de las señales ISD y en la resolución de las mismas; factores de gran importancia para la identificación de la proteína en estudio. Por medio de un análisis espectral, para establecer los parámetros instrumentales más adecuados, se pudo establecer como fluencia óptima para este estudio un valor del 60% de la fluencia total del laser. Además se observó una relación directamente proporcional entre este parámetro y la cantidad de señales, la intensidad, la relación señal/ruido (S/R) y la resolución de las mismas. Finalmente, se establecieron los pasos, desde preparación de muestras hasta identificación, para analizar proteínas intactas por espectrometría de masas MALDI-ISD.
dc.description.abstractenglishWith the objective of implementing the top-down methodology for the analysis of intact proteins by MALDIISD, preliminary tests were conducted in order to establish a protocol for optimal sample preparation. Using bovine serum albumin (BSA) as a standard, two matrices,2,5-dihydroxybenzoic acid (DHB) and sinapinic acid (SA),were tested while applied with the double layer and dried droplet preparation methods. It was observed that the more suitable matrix for this type of analysis was DHB due to greater effectiveness in producing fragmentation in the primary structure of proteins. DHB was applied following the dried dropletpreparation method. It was also observed that both the preparation method and the matrix are of great importance in this type of analysis since they have a marked effect on the appearance of the expected signals in the ISD spectra and its resolution. This is of great importance because the proper identification of the protein depends on the quality of the data. Through spectral analysis, conducted in order to establish the most suitable instrumental parameters, it was established as optimal for this study yield a value of 60% of the total fluence of the laser. In addition a direct relationship was observed between this parameter and the number of signals, the intensity, the signal to noise ratio (S/N) and the resolution of same. Finally the steps for the analysis of intact proteins by mass spectrometry, from sample preparation to identification, were established.
dc.description.degreelevelPregrado
dc.description.degreenameQuímico
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.identifier.instnameUniversidad Industrial de Santander
dc.identifier.reponameUniversidad Industrial de Santander
dc.identifier.repourlhttps://noesis.uis.edu.co
dc.identifier.urihttps://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/29412
dc.language.isospa
dc.publisherUniversidad Industrial de Santander
dc.publisher.facultyFacultad de Ciencias
dc.publisher.programQuímica
dc.publisher.schoolEscuela de Química
dc.rightshttp://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.creativecommonsAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)
dc.rights.licenseAttribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0
dc.subjectTop Down
dc.subjectMaldi
dc.subjectEspectrometría De Masas
dc.subjectProteínas Intactas
dc.subjectFragmentación
dc.subjectDecaimiento En La Fuente.
dc.subject.keywordTop Down
dc.subject.keywordMaldi
dc.subject.keywordMass Spectrometry
dc.subject.keywordIntact Proteins
dc.subject.keywordFragmentation
dc.subject.keywordIn Source Decay.
dc.titleImplementación de una metodología "top down" para identificar proteínas intactas mediante espectrometría de masas maldi-tof y decaimiento en la fuente (malhsd)
dc.title.englishImplementation of a "top down" methodology to identify intact roteins by mass spectrometry maldi-tof and in source decay (maldi-isd)
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
dc.type.hasversionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.localTesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado
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