Estudio de dinamica molecular de un modelo de bicapa lipidica del estrato corneo constituido por cer[np] y cer[ap]

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dc.contributor.advisorOliver Doerr, Markus Hans
dc.contributor.advisorDaza Espinosa, Martha Cecilia
dc.contributor.authorRivero Arenas, Natalia
dc.date.accessioned2023-04-06T20:50:44Z
dc.date.available2023
dc.date.available2023-04-06T20:50:44Z
dc.date.created2019
dc.date.issued2019
dc.description.abstractLa matriz lipídica del estrato córneo (SC) es esencial para la supervivencia humana, puesto que actúa como una barrera que previene la deshidratación rápida, manteniendo al mismo tiempo al cuerpo protegido frente a virus, bacterias y radiación UV. Muchas enfermedades cutáneas, como psoriasis, dermatitis atópica e ictiosis se derivan de alteraciones en la concentración de las ceramidas en la matriz extracelular lipídica del SC. La compleja estructura del SC presenta un reto para la comunidad científica, ya que es difícil determinar experimentalmente la relación entre su organización molecular y sus propiedades. Por lo tanto, en este trabajo de investigación, para estudiar el efecto de -hidroxifitosfingosina (CER[AP]) sobre las propiedades de la matriz lipídica, se desarrolló un modelo de bicapa con colesterol (CHOL, cholesterol) y ácido lignocérico (LA, lignoceric acid), variando la proporción CER[NP]/CER[AP] en 1:2 y 2:1, adicionalmente, se realizaron simulaciones de dinámica molecular usando el programa GROMACS 2019. Los resultados de este estudio muestran que la CER[NP] y la CER[AP] tienen un impacto diferente sobre la estructura del modelo de bicapa lipídica. En ambas proporciones la CER[NP] mostró una evidente superposición, mientras que la CER[AP] no. Además, las cadenas acilo de los lípidos no presentaron un único ángulo de inclinación durante la simulación, por el contrario, este osciló considerablemente y la CER[AP] exhibió un mayor número de enlaces de hidrógeno de tipo agua-lípido y lípido-lípido en comparación a la CER[NP]. En consecuencia, la solvatación de la CER[NP] es menor, por tanto, se favorecen las interacciones hidrofóbicas con las cadenas acilo de la capa opuesta.
dc.description.abstractenglishThe lipid matrix of the stratum corneum (SC) is essential for human survival, as it acts as a barrier that prevents rapid dehydration while keeping the body protected against viruses, bacteria and UV radiation. Many skin diseases such as psoriasis, atopic dermatitis and ichthyosis result from alterations in the concentration of ceramides in the extracellular lipid matrix of SC. The complex structure of SC presents a challenge to the scientific community, as it is difficult to determine experimentally the relationship between its molecular organization and its properties. Therefore, in this research work, to study the effect of the concentration of non-hydroxyphitosphingosine ceramide (CER[NP]) and hydroxyphitosphingosine ceramide (CER[AP]) on the properties of the lipid matrix, a membrane model with cholesterol and lignoceric acid was developed, varying the CER[NP]/CER[AP] ratio in 1:2 and 2:1, and molecular dynamics simulations were performed using the GROMACS 2019 program. The results of this study show that CER[NP] and [AP] have a different influence on the structure of the lipid bilayer model. In both proportions CER[NP] showed an evident overlap while CER[AP] did not. Furthermore, the acylo chains of the lipids did not have a single angle of inclination during the simulation, on the contrary, it oscillated considerably. CER[AP] exhibited a higher number of water-lipid and lipid-lipid type hydrogen bonds compared to CER[NP]. Consequently, CER[NP] solvation is lower, therefore hydrophobic interactions with the acylo chains of the opposite layer are favored. *
dc.description.degreelevelPregrado
dc.description.degreenameQuímico
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.identifier.instnameUniversidad Industrial de Santander
dc.identifier.reponameUniversidad Industrial de Santander
dc.identifier.repourlhttps://noesis.uis.edu.co
dc.identifier.urihttps://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/14158
dc.language.isospa
dc.publisherUniversidad Industrial de Santander
dc.publisher.facultyFacultad de Ciencias
dc.publisher.programQuímica
dc.publisher.schoolEscuela de Química
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.coarhttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.creativecommonsAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)
dc.rights.licenseAttribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.subjectCeramidas
dc.subjectSimulación
dc.subjectMembrana Celular
dc.subjectMatriz Lipídica.
dc.subject.keywordCeramides
dc.subject.keywordSimulation
dc.subject.keywordCell Membrane
dc.subject.keywordLipid Matrix.
dc.titleEstudio de dinamica molecular de un modelo de bicapa lipidica del estrato corneo constituido por cer[np] y cer[ap]
dc.title.englishStudy of molecular dynamics of a lipidic bilayer model of the stratum corneum made up of cer[np] and cer[ap]*
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
dc.type.hasversionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.localTesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado
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