Análisis de balance de fluxes (FBA) de la producción de 1,3-propanodiol por clostridium butyricum a partir de glicerol

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dc.contributor.advisorGarcía Sánchez, Carlos Eduardo
dc.contributor.authorBlanco Mantilla, Kevin Andres
dc.contributor.authorDiaz Cañas, Edith Johana
dc.date.accessioned2024-03-03T23:14:30Z
dc.date.available2017
dc.date.available2024-03-03T23:14:30Z
dc.date.created2017
dc.date.issued2017
dc.description.abstractEl Análisis de Balance de Flux (Flux Balance Analysis - FBA) busca predecir cuantitativamente el comportamiento de los fluxes en un microrganismo. La eficacia de los análisis en el comportamiento metabólico celular de la especie en estudio depende del modelo metabólico, de la función objetivo y de la calidad de los datos experimentales disponibles. En este trabajo, se evaluó la capacidad predictiva del FBA por medio de la selección de la mejor función objetivo, entre varias funciones objetivos propuestas, para Clostridium butyricum con glicerol como sustrato. Como dato de entrada para analizar la eficacia del FBA en este microorganismo se utilizó únicamente la ingesta de glicerol. Como base del análisis comparativo para el poder predictivo del FBA, se emplearon 23 experimentos reportados en la literatura, en los cuales se determinaron valores de ingesta y excreción de diversos metabolitos en el crecimiento de Clostridium butyricum. El resultado del estudio computacional de los fluxes metabólicos evaluados en este trabajo arrojó -. Este resultado se obtuvo por medio del análisis de las diferencias euclidianas entre los valores predichos por la técnica y una serie de datos experimentales reportados en la literatura, y usando un modelo de metabolismo central. Adicionalmente, se evaluó el efecto de varias modificaciones genéticas propuestas para incrementar la producción de 1,3-Propanodiol, usando -. Se evidenció que las deleciones propuestas conducían a idénticos resultados del FBA respecto al caso base (sin deleciones).
dc.description.abstractenglishThe Flux Balance Analysis (FBA) seeks to quantitatively predict the behavior of fluxes in a microorganism. The efficacy of the analyzes on the cellular metabolic behavior of the species under study depends on the metabolic model, the objective function and the quality of the available experimental data. In this work, the predictive capacity of FBA was evaluated by selecting the best objective function, among several objective functions proposed, for Clostridium butyricum with glycerol as substrate. As input data to analyze the efficacy of FBA in this microorganism was used only the intake of glycerol. As a basis of the comparative analysis for the predictive power of the FBA, 23 experiments reported in the literature were used, in which values of ingestion and excretion of several metabolites in the growth of Clostridium butyricum were determined. The result of the computational study of the metabolic fluxes evaluated in this work showed that the best objective function is "optimization of 1,3-Propanediol". This result was obtained by analyzing the Euclidean differences between the values predicted by the technique and a series of experimental data reported in the literature, and using a central metabolism model. Additionally, the effect of several proposed genetic modifications to increase the production of 1,3-Propanediol was evaluated using the objective functions "optimize 1,3-propanediol" and "optimize biomass production". It was evidenced that the proposed deletions led to identical FBA results with respect to the base case (no deletions).
dc.description.degreelevelPregrado
dc.description.degreenameIngeniero Químico
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.identifier.instnameUniversidad Industrial de Santander
dc.identifier.reponameUniversidad Industrial de Santander
dc.identifier.repourlhttps://noesis.uis.edu.co
dc.identifier.urihttps://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/35751
dc.language.isospa
dc.publisherUniversidad Industrial de Santander
dc.publisher.facultyFacultad de Ingenierías Fisicoquímicas
dc.publisher.programIngeniería Química
dc.publisher.schoolEscuela de Ingeniería Química
dc.rightshttp://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.creativecommonsAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)
dc.rights.licenseAttribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0
dc.subjectFlux Metabólico
dc.subjectModelamiento Estequiométrico
dc.subjectFba
dc.subjectFunción Objetivo
dc.subjectClostridium Butyricum.
dc.subject.keywordMetabolic Fluxes
dc.subject.keywordModeling Stoichiometric
dc.subject.keywordFba
dc.subject.keywordObjective Function
dc.subject.keywordClostridium Butyricum.
dc.titleAnálisis de balance de fluxes (FBA) de la producción de 1,3-propanodiol por clostridium butyricum a partir de glicerol
dc.title.englishFlux balance analisis (fba) of production of 1,3-propanediol by clostridium butyricum from glycerol.
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
dc.type.hasversionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.localTesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado
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