Structures assembly in the mesoscale: non-symmetric trimers formation
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Universidad Industrial de Santander
Abstract
Description
Structures assembly takes place from molecular to cosmological scale. The building of structures comes up from fundamental and discrete components. In this work we study the formation of molecular non-symmetric trimers at the mesoscale. The assembly process is modeled by a set of Fokker-Planck type equations coupled through the boundary conditions. The mathematical model is solved in the space of trajectories where the probability of assembling is evaluated. Obtained results show how the assembly process depends on the boundary conditions and the shape of energy barriers.
El ensamble de estructuras se observa desde la escala molecular hasta la cosmológica. El ensamble de componentes discretos fundamentales puede llevar a la formación de una amplia variedad de estructuras, desde simples hasta complejas. En este trabajo estudiamos el ensamble de bloques moleculares fundamentales que forman trímeros nosimétricos en la mesoescala. El proceso de ensamble se modela mediante un sistema de ecuaciones tipo Fokker-Planck acopladas en la frontera. El modelo matemático se resuelve en un espacio de estados, donde las trayectorias dan información de la probabilidad de formar diferentes trímeros por difusión a través de una barrera de potencial de energía no simétrica. Los resultados muestran que las condiciones de frontera no-homogéneas y la configuración de la barrera de potencial determinan cual estructura ensamblada, trímero, tiene la mayor probabilidad de formarse.
El ensamble de estructuras se observa desde la escala molecular hasta la cosmológica. El ensamble de componentes discretos fundamentales puede llevar a la formación de una amplia variedad de estructuras, desde simples hasta complejas. En este trabajo estudiamos el ensamble de bloques moleculares fundamentales que forman trímeros nosimétricos en la mesoescala. El proceso de ensamble se modela mediante un sistema de ecuaciones tipo Fokker-Planck acopladas en la frontera. El modelo matemático se resuelve en un espacio de estados, donde las trayectorias dan información de la probabilidad de formar diferentes trímeros por difusión a través de una barrera de potencial de energía no simétrica. Los resultados muestran que las condiciones de frontera no-homogéneas y la configuración de la barrera de potencial determinan cual estructura ensamblada, trímero, tiene la mayor probabilidad de formarse.
Keywords
Fokker-planck, mesoscale, non-equilibrium thermodynamics, structures assembly, Ensamble de estructura, fokker-planck, mesoescala, termodinámica de no-equilibrio