Maestría en Microbiología

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Browsing Maestría en Microbiología by browse.metadata.evaluator "Martínez Vega, Ruth Aralí"

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    Evaluación de la técnica de amplificación isotérmica mediada por bucles, como método para la caracterización de Escherichia coli asociada a infecciones del tracto urinario en pacientes pediátricos
    (Universidad Industrial de Santander, 2022-03-292022-04-19T16:43:05Z) Jaimes Caro, Elkin Johan; Machuca Pérez, Mayra Alejandra; Sosa Ávila, Luis Miguel; Martínez Vega, Ruth Aralí; Vásquez Rifo, Alejandro
    Las infecciones del tracto urinario (ITU) afectan a un alto número de pacientes pediátricos cada año y pueden ocasionar cuadros crónicos de salud cuando no se aplica un tratamiento adecuado a tiempo, por lo tanto, un diagnóstico rápido es esencial para disminuir la posibilidad de secuelas en los pacientes. La técnica de Amplificación Isotérmica Mediada por Bucles (LAMP) es una técnica molecular que ha sido implementada en el diagnóstico de algunas enfermedades infecciosas, mostrando alta sensibilidad y especificidad, y bajo costo de implementación. En este estudio se diseñaron protocolos LAMP para la identificación de Escherichia coli, el agente causal más aislado en infecciones urinarias, y la detección de betalactamasas de espectro extendido (BLEE). Utilizando herramientas bioinformáticas de libre acceso, se diseñaron iniciadores LAMP específicos para amplificar los genes blaTEM, blaSHV, blaCTX-M y el gen del ARN ribosomal 23S de Escherichia coli. Para las amplificaciones se empleó el kit WarmStart Colorimetric LAMP 2X New England Biolabs, 1,6 µM de iniciadores internos, 0,2 µM de iniciadores externos y 50 µg de ADN. La reacción de amplificación se incubó a 65 °C por 30 minutos antes de registrar el resultado. Las condiciones óptimas de amplificación fueron estandarizadas utilizando cepas de referencia como controles. Los protocolos LAMP estandarizados se emplearon para la caracterización de 15 aislamientos clínicos obtenidos de pacientes pediátricos con ITU, nueve fueron identificados como E. coli y seis aislamientos como portadores de genes codificantes para BLEE. Los protocolos LAMP desarrollados permitieron la detección molecular específica de E. coli en cada uno de los casos, incluso en presencia de ADN de otros Enterobacterales. A su vez, se detectó en las cepas control como en los aislamientos clínicos la presencia de genes codificantes para BLEE, coincidiendo con los resultados obtenidos de amplificación por PCR convencional por lo que podría ser implementada como una técnica molecular alternativa para la detección temprana de E. coli y genes de resistencia en pacientes pediátricos con ITU con miras a disminuir el tiempo de diagnóstico.
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    Prevalencia de genes de resistencia a quinolonas y fluoroquinolonas de codificación plasmídica en Salmonella spp. aislada de tres matrices alimentarias en Barrancabermeja
    (Universidad Industrial de Santander, 2022-03-30) David Castro, Alexander; Rincón Cruz, Giovanna; González Rugeles, Clara Isabel; Criado Guerrero, Libeth Yajaira; Martínez Vega, Ruth Aralí
    Introducción: La salmonelosis es un problema zoonótico y de salud pública de distribución mundial y es uno de los patógenos alimentarios más comunes transmitidos a los humanos por el consumo de productos agroalimentarios. El uso de antimicrobianos como promotores del crecimiento beneficia la productividad de la industria agropecuaria y contribuye al desarrollo de resistencia a los antimicrobianos reduciendo el uso de estos, para el tratamiento de enfermedades infecciosas en humanos y animales. Las quinolonas (Q) y fluoroquinolonas (FQ) son un grupo de antimicrobianos de amplio espectro, usado frecuentemente en infecciones gastrointestinales. Los determinantes de resistencia a quinolonas mediada por plásmidos (PMQR) han surgido como una preocupación importante en los últimos años. Objetivo: Determinar la prevalencia de genes de resistencia a quinolonas y fluoroquinolonas de codificación plasmídica en Salmonella spp., aislada de matrices alimentarias en Barrancabermeja. Métodos: Se procesaron 277 aislamientos de Salmonella spp. de origen alimentario aislados e identificados mediante la norma ISO 6579:2002 y confirmados molecularmente. Se determinó el perfil de sensibilidad de los aislamientos, presencia de genes PMQR por PCR, la estabilidad de los mismos hasta el repique 50 y las posibles relaciones clonales en los aislados con PMQR. Resultados: El 61% (169/277) de los aislamientos fueron sensibles a las Q y FQ probadas. Se halló la presencia de PMQR en el 5,4% (15/277) de los aislados, correspondientes a 12 qnrB (4.3%) y tres qnrA (1,07%); los genes oqxA, oqxB, qepA y aac(6´)-Ib-cr no fueron detectados y no determinaron posibles relaciones clonales. Conclusiones: Los aislados de pollo presentaron una menor sensibilidad a los antibióticos de este estudio, así como una baja frecuencia de aislamientos con genes PMQR. Este estudio demuestra la necesidad de caracterizar los aislamientos de una región, debido a que estos determinantes limitarán el espectro de antibióticos a utilizar en el tratamiento de esta zoonosis.