Publicación: Estudio computacional de los procesos de absorción, fluorescencia, fosforescencia y entrecruzamiento de sistemas del trimetil éster de clorina e6 y sus derivados con zinc y piridina
| dc.contributor.advisor | Doerr, Markus | |
| dc.contributor.advisor | Daza Espinosa, Martha Cecilia | |
| dc.contributor.author | Suarez Ruiz, Marlon Daniel | |
| dc.contributor.evaluator | Pérez Torres, Jhon Fredy | |
| dc.contributor.evaluator | Mejía Ospino, Enrique | |
| dc.date.accessioned | 2026-03-02T12:10:14Z | |
| dc.date.available | 2026-03-02T12:10:14Z | |
| dc.date.created | 2026-02-26 | |
| dc.date.issued | 2026-02-26 | |
| dc.description.abstract | El desarrollo de nuevos fotosensibilizadores requiere su caracterización fotofísica detallada, la cual actualmente puede realizarse mediante estudios computacionales, como el que se presenta en este documento. En este estudio se calcularon y compararon las propiedades de absorción, fluorescencia, fosforescencia y entrecruzamiento de sistemas (ISC) de tres fotosensibilizadores: trimetil éster de clorina e6, su derivado con zinc y con piridina. La síntesis de estas moléculas fue estudiada previamente como parte de varios trabajos de investigación de pregrado en la UIS. Inicialmente, se realizó una exploración conformacional de las moléculas, y se determinó el confórmero de menor energía. A partir de estas estructuras, se optimizó la geometría de su estado basal, y luego de sus estados excitados usando una metodología CAM-B3LYP(CPCM)/def2-SVP. Las frecuencias vibracionales confirmaron que las estructuras optimizadas corresponden a mínimos en sus superficies de energía potencial (PES). Posteriormente, se analizó su estructura electrónica usando el mismo funcional y base, y con estos datos se calcularon espectros y constantes de velocidad mediante el módulo Excited States Dynamics de ORCA 5.0.4 usando el modelo del Hessiano Adiabático (AH). Los resultados muestran que la estructura electrónica calculada es consistente con el modelo de 4 orbitales de Gouterman, en concordancia con estudios previos de sistemas similares. Los espectros calculados reproducen adecuadamente las bandas Qy, y aunque las bandas Qx reproducen bien sus posiciones, presentan discrepancias respecto a las intensidades experimentales. Las constantes de velocidad calculadas están en el mismo orden de magnitud de los datos experimentales encontrados en la literatura, sin embargo, parecen estar subestimadas al compararlas con los mismos. Cabe destacar que los efectos Herzberg-Teller, también conocidos como efectos vibracionales, necesarios para los cálculos cuando se tienen acoplamientos espín-orbital pequeños, contribuyen notablemente a las constantes calculadas, aportando entre del 15-28 % en fluorescencia y entre 40-99 % en ISC, resaltando la importancia de incluir éstos efectos vibracionales en los cálculos. Con la metodología implementada, fue posible obtener espectros con resolución vibracional y constantes de velocidad razonables, que replican las tendencias relacionadas con la adición de zinc y piridina en la estructura del trimetil éster de clorina e6. Aunque los resultados aún presentan limitaciones, son congruentes con estudios computacionales recientes, constituyen un avance hacia el diseño racional de nuevos fotosensibilizadores de origen natural y pueden ser útiles para orientar futuros proyectos de síntesis. | |
| dc.description.abstractenglish | The development of new photosensitisers requires their detailed photophysical characterisation, which can nowadays be performed by computational studies, such as the one presented in this document. In this study, photophysical properties as absorption, fluorescence, phosphorescence and intersystem crossing (ISC) were calculated and compared for a set of three potential photosensitizers of natural origin: chlorin e6 trimethyl ester, its derivatives with zinc and pyridine. The synthesis of these molecules has previosly been studied experimentally in undergraduate research projects at UIS. Initially, a conformational exploration was carried out, and the lowest energy conformer was determined. From these structures, the geometry of their basal state, and then of their excited states were optimized using a CAM-B3LYP(CPCM)/def2-SVP methodology. Vibrational frequencies confirmed that the optimized structures correspond to minima in their potential energy surfaces (PES). Subsequently, their electronic structure was calculated using the same functional and basis, and with these data, spectra and rate constants were determinated using the Excited States Dynamics module implemented in ORCA 5.0.4 using the Adiabatic Hessian (AH) model. The results show that the calculated electronic structure is consistent with the Gouterman 4-orbital model, in agreement with previous studies of similar systems. The calculated spectra adequately reproduce the Qy bands, and although the Qx bands reproduce their positions well, there are discrepancies with the experimental intensities. The calculated rate constants are in the same order of magnitude as those reported experimentally, however, they seem to be underestimated to them. It should be noted that Herzberg-Teller effects, also known as vibrational effects, necessary for the calculations when small spin-orbit couplings, such as those treated here, contribute significantly to the calculated rates, contributing between 15-28% in fluorescence and between 40-99% in ISC, highlighting the importance of including vibrational effects in these calculations. With the implemented methodology, it was possible to obtain reasonable spectra with vibrational resolution and rate constants, which replicate the trends related to zinc and pyridine addition to chlorin e6 trimethyl ester. Although the results still present limitations, they are congruent with recent computational studies, constitute an advance towards the rational design of new photosensitisers of natural origin and could serve as guide to future synthesis projects. | |
| dc.description.cvlac | scienti.minciencias.gov.co/cvlac/visualizador/generarCurriculoCv.do?cod_rh=0001802729 | |
| dc.description.degreelevel | Maestría | |
| dc.description.degreename | Magíster en Química | |
| dc.description.orcid | 0009-0001-2177-7666 | |
| dc.format.mimetype | application/pdf | |
| dc.identifier.instname | Universidad Industrial de Santander | |
| dc.identifier.reponame | Universidad Industrial de Santander | |
| dc.identifier.repourl | https://noesis.uis.edu.co | |
| dc.identifier.uri | https://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/47244 | |
| dc.language.iso | spa | |
| dc.publisher | Universidad Industrial de Santander | |
| dc.publisher.faculty | Facultad de Ciencias | |
| dc.publisher.program | Maestría en Química | |
| dc.publisher.school | Escuela de Química | |
| dc.rights | info:eu-repo/semantics/openAccess | |
| dc.rights.accessrights | info:eu-repo/semantics/openAccess | |
| dc.rights.coar | http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 | |
| dc.rights.creativecommons | Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0) | |
| dc.rights.license | Atribución 2.5 Colombia (CC BY 2.5 CO) | |
| dc.rights.uri | https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ | |
| dc.subject | Propiedades fotofísicas | |
| dc.subject | fotosensibilizadores | |
| dc.subject | constantes de velocidad | |
| dc.subject | TDDFT | |
| dc.subject | trimetil éster de clorina e6 | |
| dc.subject | espectroscopía computacional | |
| dc.subject | efectos Herzberg-Teller | |
| dc.subject.keyword | Photophysical properties | |
| dc.subject.keyword | photosensitizers | |
| dc.subject.keyword | computational spectroscopy | |
| dc.subject.keyword | transition rate constant | |
| dc.subject.keyword | chlorin e6 trimethyl ester | |
| dc.subject.keyword | Herzberg-Teller effects | |
| dc.subject.keyword | TDDFT | |
| dc.title | Estudio computacional de los procesos de absorción, fluorescencia, fosforescencia y entrecruzamiento de sistemas del trimetil éster de clorina e6 y sus derivados con zinc y piridina | |
| dc.title.english | Computational study of absorption, fluorescence, phosphorescence and intersystem crossing proccesses of chlorin e6 trimethyl ester and its derivatives with zinc and pyridine | |
| dc.type.coar | http://purl.org/coar/resource_type/c_bdcc | |
| dc.type.hasversion | http://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce | |
| dc.type.local | Tesis/Trabajo de grado - Monografía - Maestría | |
| dspace.entity.type | Publication |
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