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Genetic diversity and spatial genetic structure within a population of an aromatic shrub, lippia origanoides (verbenacea), in the Chicamocha Canyon, northeastern Colombia

dc.contributor.advisorChacon Sanchez, Maria Isabel
dc.contributor.advisorCastillo Villamizar, Genis Andres
dc.contributor.authorSuarez González, Adriana
dc.date.accessioned2024-03-03T17:02:03Z
dc.date.available2008
dc.date.available2024-03-03T17:02:03Z
dc.date.created2008
dc.date.issued2008
dc.description.abstractEn las poblaciones, la escala de la estructura genética depende directamente del sistema de reproducción y la capacidad de dispersión, y su conocimiento es importante para el estudio de la dinámica de las poblaciones y para propósitos de conservación. En este estudio, la diversidad genética y la escala de la estructura geográfica fueron analizadas en una población natural de una planta aromática promisoria, Lippia origanoides, nativa del Cañón del Chicamocha en el noreste Colombiano utilizando cebadores ISSR. La diversidad genética, descrita como P (86.21%) y cuantificada usando I (0.453) y HB (0. 484), reveló altos niveles relativos de variación genética. Estos niveles de diversidad genética son mayores o comparables con los niveles en otras especies de plantas alogamas y con otras especies relacionadas de la familia Verbenaceae. Análisis de agrupamiento (PCO y UPGMA) revelaron un bajo nivel de diferenciación entre los individuos de dos localidades del Cañón del Chicamocha. Análisis de autocorrelación espacial a escala fina, realizados para toda la región, y por separado para cada localidad, mostraron resultados consistentes con el clásico modelo de aislamiento por distancia, en donde hay una disminución en la símilaridad genética al incrementar la distancia geográfica. Estos resultados sugieren un patrón moderado pero significativo de estructura genética espacial en L. origanoides. Las causas de este patrón son desconocidas y puede estar influenciado por muchos factores contemporáneos como una dispersión limitada de semillas y/o un movimiento de polen a cortas distancias, entre otros. Nuestros resultados sugieren que el muestreo de individuos a distancias mayores de 1.4 km puede resultar en la colecta de diferentes genotipos lo cual ayudaría a conservar lo niveles de diversidad genética en programas de propagación.
dc.description.abstractenglishThe geographic scale of genetic structure in a population is highly dependent on its breeding system and dispersion capabilities, and this knowledge, in turn, is important for the study of population dynamics and conservation purposes. In this study, the genetic diversity and the scale of geographic structure was studied in a natural population of a prominent aromatic plant, Lippia origanoides, native to the Chicamocha Canyon in northeastern Colombia by means of ISSR markers. Genetic diversity, described as P (86.21%) and quantified using I (0.453) and HB (0. 484), showed relatively high levels of genetic variation. These levels of genetic diversity are comparable or higher to other plant species with allogamous breeding systems and to other related Verbenaceae species. Cluster (PCO and UPGMA) analyses revealed a low level of differentiation among individuals from two localities of the Chicamocha Canyon. Fine scale autocorrelation analyses, done for the entire region and also separately for each of the two localities, showed results consistent with the classical model of isolation by distance, where there is a decline of genetic similarity with increasing geographical distance. These results suggest a pattern of moderate but significant levels of local spatial structure in L. origanoides. The causes of this pattern are currently unknown and could be influenced by many contemporary factors such as restricted seed dispersal and/or short-distance pollen movement, among others. Our results suggest that sampling individuals at distances greater than 1.4 km may result in the collection of different genotypes, which could help preserve the levels of genetic diversity in a propagation programme.
dc.description.degreelevelPregrado
dc.description.degreenameBiólogo
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.identifier.instnameUniversidad Industrial de Santander
dc.identifier.reponameUniversidad Industrial de Santander
dc.identifier.repourlhttps://noesis.uis.edu.co
dc.identifier.urihttps://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/20865
dc.language.isospa
dc.publisherUniversidad Industrial de Santander
dc.publisher.facultyFacultad de Ciencias
dc.publisher.programBiología
dc.publisher.schoolEscuela de Biología
dc.rightshttp://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.creativecommonsAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)
dc.rights.licenseAttribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0
dc.subjectAnálisis Bayesiano
dc.subjectAislamiento por Distancia
dc.subjectISSR
dc.subjectNeotrópicos
dc.subjectAutocorrelación Espacial
dc.subject.keywordBayesian Analysis
dc.subject.keywordIsolation by distance
dc.subject.keywordISSR
dc.subject.keywordNeotropics
dc.subject.keywordSpatial autocorrelation
dc.titleGenetic diversity and spatial genetic structure within a population of an aromatic shrub, lippia origanoides (verbenacea), in the Chicamocha Canyon, northeastern Colombia
dc.title.englishGenetic diversity and spatial genetic structure within a population of an aromatic shrub, lippia origanoides (verbenacea), in the chicamocha canyon, northeastern colombia
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
dc.type.hasversionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.localTesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado
dspace.entity.typePublication

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