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Caracterización de la historia demográfica del tiburón ballena (Rhincodon typus) a partir de ADN mitocondrial

dc.contributor.advisorMarchant Rojas, Sergio Andres
dc.contributor.advisorBarragán Barrera, Dalia
dc.contributor.authorLopez Lizarazo, Katherin
dc.contributor.evaluatorLópez Delgado, Edwin Olando
dc.date.accessioned2026-06-10T15:49:00Z
dc.date.created2026
dc.date.issued2026
dc.description.abstractEl tiburón ballena (Rhincodon typus) es una especie altamente migratoria y amenazada, cuya estructura poblacional global y conectividad histórica han sido objeto de debate. Para llenar vacíos de información críticos, se secuenció la Región Control de ADN mitocondrial (ADNmt) de muestras provenientes del Santuario de Fauna y Flora Malpelo (Pacífico colombiano) integrándolos con secuencias globales. Metodológicamente, se combinaron análisis de genética poblacional clásica (distribución de discordancias y pruebas de neutralidad) con inferencia coalescente utilizando el Espectro de Frecuencias Alélicas multidimensional (mSFS). Los resultados revelaron que el Océano Atlántico está fuertemente diferenciado del Indo-Pacífico, exhibiendo firmas genéticas propias de una población estable. El modelo coalescente óptimo rechazó contundentemente la hipótesis de panmixia en el Indo-Pacífico, demostrando que la especie se estructura en cuatro unidades demográficas independientes: Atlántico, Índico, Pacífico Occidental y Pacífico Oriental. Adicionalmente, se detectaron firmas de expansiones poblacionales masivas en las cuencas del Indo-Pacífico. Las reconstrucciones demográficas indican que las expansiones y las subsecuentes fragmentaciones poblacionales están intrínsecamente ligadas a las barreras oceanográficas impuestas por los ciclos glaciales del Pleistoceno, destacando un reciente efecto fundador en el Pacífico Oriental asociado al Último Máximo Glacial. Estos hallazgos descartan la conectividad global reciente, redefinen las unidades evolutivas de R. typus y proveen un marco evolutivo esencial para orientar estrategias de manejo y conservación regionalizadas.
dc.description.abstractenglishThe whale shark (Rhincodon typus) is a highly migratory and threatened species, whose global population structure and historical connectivity have been the subject of debate. To fill critical information gaps, the Mitochondrial Control Region (ADNmt) of samples from the Malpelo Fauna and Flora Sanctuary (Colombian Pacific) was sequenced and integrated with global sequences. Methodologically, classical population genetics analyses (mismatch distribution and neutrality tests) were combined with coalescent inference using the multidimensional allele frequency spectrum (mSFS). The results revealed that the Atlantic Ocean is strongly differentiated from the Indo-Pacific, exhibiting genetic signatures typical of a stable population. The optimal coalescent model strongly rejected the hypothesis of panmixia within the Indo-Pacific, demonstrating that the species is structured into four independent demographic units: Atlantic, Indian, Western Pacific, and Eastern Pacific. Additionally, signatures of massive population expansions were detected across the Indo-Pacific basins. Demographic reconstructions indicate that population expansions and subsequent fragmentations are intrinsically linked to oceanographic barriers imposed by Pleistocene glacial cycles, highlighting a recent founder effect in the Eastern Pacific associated with the Last Glacial Maximum. These findings rule out recent global connectivity, redefine the evolutionary units of R. typus, and provide an essential evolutionary framework to guide regionalized management and conservation strategies.
dc.description.degreelevelPregrado
dc.description.degreenameBiólogo
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.identifier.instnameUniversidad Industrial de Santander
dc.identifier.reponameUniversidad Industrial de Santander
dc.identifier.repourlhttps://noesis.uis.edu.co
dc.identifier.urihttps://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/47863
dc.language.isospa
dc.publisherUniversidad Industrial de Santander
dc.publisher.facultyFacultad de Ciencias
dc.publisher.programBiología
dc.publisher.schoolEscuela de Biología
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.coarhttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.creativecommonsAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)
dc.rights.licenseAtribución-NoComercial-SinDerivadas 2.5 Colombia (CC BY-NC-ND 2.5 CO)
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.subjectUnidades evolutivas
dc.subjectHistoria demográfica
dc.subjectFrecuencia de alelos
dc.subjectTeoría coalescente
dc.subject.keywordEvolutionary units
dc.subject.keywordDemographic history
dc.subject.keywordAllele frequency
dc.subject.keywordCoalescent theory
dc.titleCaracterización de la historia demográfica del tiburón ballena (Rhincodon typus) a partir de ADN mitocondrial
dc.title.englishDemographic history characterization of Whale shark (Rhincodon typus) using mitochondrial DNA
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.hasversionhttp://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
dc.type.localTesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado
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