Estandarización de la amplificación por pcr de los sistemas microsatélites rcaaag14 y asu15 en aves del género ramphocelus presentes en el departamento de Santander, Colombia

Cornejo Bautista, Jose Pablo

Publicación:
Estandarización de la amplificación por pcr de los sistemas microsatélites rcaaag14 y asu15 en aves del género ramphocelus presentes en el departamento de Santander, Colombia

dc.contributor.advisor	Rondon Gonzalez, Fernando
dc.contributor.advisor	Fuentes Lorenzo, Jorge Luis
dc.contributor.author	Cornejo Bautista, Jose Pablo
dc.date.accessioned	2024-03-03T22:36:08Z
dc.date.available	2016
dc.date.available	2024-03-03T22:36:08Z
dc.date.created	2016
dc.date.issued	2016
dc.description.abstract	La biología molecular y las herramientas estadísticas permiten la posibilidad de identificar y utilizar la variación genómica, la cual puede explorarse a partir del uso de marcadores moleculares tipo microsatélites dado el elevado nivel de polimorfismo que estos detectan. El genotipado de estos marcadores ayuda a cuantificar la diversidad genética y a definir el grado de subdivisión presente en poblaciones de organismos, entre otros aspectos. El objetivo de la presente pasantía de trabajo de grado fue estandarizar la amplificación mediante el uso de la Reacción en Cadena de la Ramphocelus (Ramphocelus icteronotus y R. dimidiatus), presentes en el departamento de Santander (Colombia). Estos marcadores fueron caracterizados originalmente en Ramphocelus costaricenses (RcAAAG14) y Ammodramus savannarum estudiar la diversidad genética de especies simpátricas de Ramphocelus en otras regiones de Colombia. Los dos marcadores amplificaron en muestras de R. icteronotus y R. dimidiatus. Se concluye que los productos de PCR de ambos sistemas estuvieron mejor definidos con 2,5mM de MgCl2, 52°C de temperatura de hibridación y 10 minutos de extensión final a 72°C.
dc.description.abstractenglish	Standardization of the amplification by pcr of the ramphocelus genus located in colombia's santander department
dc.description.degreelevel	Pregrado
dc.description.degreename	Biólogo
dc.format.mimetype	application/pdf
dc.identifier.instname	Universidad Industrial de Santander
dc.identifier.reponame	Universidad Industrial de Santander
dc.identifier.repourl	https://noesis.uis.edu.co
dc.identifier.uri	https://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/34259
dc.language.iso	spa
dc.publisher	Universidad Industrial de Santander
dc.publisher.faculty	Facultad de Ciencias
dc.publisher.program	Biología
dc.publisher.school	Escuela de Biología
dc.rights	http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
dc.rights.accessrights	info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.creativecommons	Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)
dc.rights.license	Attribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)
dc.rights.uri	http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0
dc.subject	Pcr
dc.subject	Poliacrilamida
dc.subject	Temperatura De Hibridación
dc.subject	Mgcl2.
dc.subject.keyword	Molecular biology and statistical tools allow the possibility of identifying and utilizing the genomic variation
dc.subject.keyword	which can be explored by the use of microsatellite-type molecular markers
dc.subject.keyword	given the elevated level of polymorphism that these detect. The genotyping of this markers help quantify the genetic diversity and to define the subdivision grade present in organism populations
dc.subject.keyword	among other aspects. The objective of the present internship was to standardize the amplification via the chain-reaction use of of the Ramphocelus genus (Ramphocelus icteronotus y R. dimidiatus)
dc.subject.keyword	located in Colombia's Santander department. This marker was originally characterized in Ramphocelus costaricenses (RcAAAG14) and Ammodramus savannarum sympatric species of Ramphocelus genetic diversity in other regions of Colombia. The two markers increasingly amplified in R. icteronotus and R. dimidiatus samples. It is concluded that the PCR products of both systems were better defined using these parameters: 2
dc.subject.keyword	5mM of MgCl2dNTPs
dc.subject.keyword	Taq DNA polymerase
dc.subject.keyword	52°C hybridization temperature; 10 minutes of final extension at 72°C.
dc.title	Estandarización de la amplificación por pcr de los sistemas microsatélites rcaaag14 y asu15 en aves del género ramphocelus presentes en el departamento de Santander, Colombia
dc.title.english	Pcr, Polyacrylamide Hybridization Temperature, Mgcl2.
dc.type.coar	http://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
dc.type.hasversion	http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.local	Tesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado
dspace.entity.type	Publication