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Protein engineering of formate dehydrogenase h (fdh-h) to enhance hydrogen production via error-prone pcr

dc.contributor.advisorRamirez Garcia, Alvaro
dc.contributor.advisorWood, Thomas K.
dc.contributor.authorRamírez Angulo, Jessica Paola
dc.date.accessioned2024-03-03T17:28:57Z
dc.date.available2009
dc.date.available2024-03-03T17:28:57Z
dc.date.created2009
dc.date.issued2009
dc.description.abstractEl complejo Liasa para producir Hidrógeno del Formato (FHL) de la Escherichia coli es el responsable de la conversión del formato en dióxido de carbono (CO2) e hidrógeno (H2) bajo condiciones anaeróbicas y en la ausencia de receptores de electrones. El principio activo del complejo consta de siete proteínas, seis provenientes de la hidrogenada 3 codificada por el operador hyc (HycBCDEFG) y uno de la deshidrogenasa del formato H (Fdh-H). Fdh-H, codificada por el gen fdhF, es una proteína citoplasmática de 79 kDa y contiene selenocisteina, molibdeno y un grupo de [4Fe-4S] en su sitio activo. En este estudio, aplicamos ingeniería a la fdhF (715 amino ácidos) para aumentar la producción de hidrógeno por un proceso de error-prone y reacción en cadena de la polimerasa (epPCR) usando un huésped que carecía de actividad de la hidrogenada 1 (hyaB codifica la subunidad mas grande) y la hidrogenada 2 (hybC codifica la subunidad mas grande) y de la deshidrogenasa del formato H a través de las mutaciones hyaB hybC fdhF. Para generar las mutaciones aleatorias mediante la implementación de la técnica de epPCR, se utilizo como plantilla el plasmido pCA24N-fdhF. Una variante mejorada de la fdhF se obtuvo con una membrana chemochromica que detecta directamente la producción de hidrógeno a partir de colonias individuales. La variante obtenida a travéz de epPCR tiene una mutación (Y513H) y produce 12 veces más hidrógeno que la cepa sin mutaciones de la fdhF. Además, realizamos mutagénesis saturada en esta variante para obtener una mutante (H513Q) que produce 6 veces más hidrógeno que la mutante (Y513H).
dc.description.abstractenglishThe formate hydrogen lyase (FHL) complex of Escherichia coli is responsible for the conversion of formate to carbon dioxide (CO2) and hydrogen (H2) under anaerobic conditions and in the absence of electron acceptors. The active complex consists of seven proteins, six from the hydrogenase 3 encodes by the hyc operon (HycBCDEFG) and formate dehydrogenase H (Fdh-H). Fdh-H, encoded by the fdhF gene, is a 79 kDa cytoplasmic protein and contains selenocysteine, molybdenum and a [4Fe-4S] cluster at its active site. In this study, we engineered fdhF (715 amino acids) for enhanced hydrogen production by an error-prone polymerase chain reaction (epPCR) using a host that lacked hydrogenase 1 (hyaB encodes the large subunit) and hydrogenase 2 (hybC encodes the large subunit) activity and the formate dehydrogenase H via the hyaB hybC fdhF mutations. To generate random mutations we use the plasmid pCA24N-fdhF as the template to perform the epPCR. One enhanced fdhF variant was obtained with a novel chemochromic membrane screen that directly detected hydrogen from individual colonies. The epPCR variant contained one mutation (Y513H) and had 12-fold higher hydrogen-producing activity than wildtype fdhF. In addition, we perform saturation mutagenesis in this variant to obtain one mutant (H513Q) that had 6-fold higher hydrogen-producing activity than mutant (Y513H).
dc.description.degreelevelPregrado
dc.description.degreenameIngeniero Químico
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.identifier.instnameUniversidad Industrial de Santander
dc.identifier.reponameUniversidad Industrial de Santander
dc.identifier.repourlhttps://noesis.uis.edu.co
dc.identifier.urihttps://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/21947
dc.language.isospa
dc.publisherUniversidad Industrial de Santander
dc.publisher.facultyFacultad de Ingenierías Fisicoquímicas
dc.publisher.programIngeniería Química
dc.publisher.schoolEscuela de Ingeniería Química
dc.rightshttp://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.creativecommonsAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)
dc.rights.licenseAttribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0
dc.subjectIngeniería de las Proteínas. Complejo Liasa para producir Hidrógeno del Formato (FHL). Transducción P1. Error-prone PCR. Mutagénesis Saturada.
dc.subject.keywordProtein engineering. Formate hydrogen lyase (FHL) complex. P1 transduction. Errorprone PCR. Saturation mutagenesis
dc.titleProtein engineering of formate dehydrogenase h (fdh-h) to enhance hydrogen production via error-prone pcr
dc.title.englishProtein engineering of formate dehydrogenase h (fdh-h) to enhance hydrogen production via error-prone pcr
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
dc.type.hasversionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.localTesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado
dspace.entity.typePublication

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