Optimisation of the DNA extraction protocol in Vaccinium meridionale Swartz

Abstract

Vaccinium meridionale es una especie de la familia Ericaceae con una importante relevancia económica y para la salud, y recientemente ha despertado un creciente interés en su estudio. Sin embargo, la extracción de ADN de alta calidad en esta especie representa un desafío debido a sus altos niveles de polisacáridos y compuestos fenólicos. Este estudio tuvo como objetivo optimizar un protocolo de extracción de ADN para V. meridionale. Se compararon tres protocolos de extracción de ADN y, posteriormente, se evaluó la eficiencia del protocolo optimizado bajo diferentes tiempos de almacenamiento y métodos de conservación de las muestras en campo. La calidad y cantidad del ADN se evaluaron mediante electroforesis en gel de agarosa, un espectrofotómetro NanoDrop One y fluorometría Qubit 4. El protocolo optimizado, que incluye un tampón de prelavado a base de sorbitol y un tampón de extracción con altas concentraciones de β-mercaptoetanol, NaCl y CTAB, produjo una mayor calidad y cantidad de ADN en comparación con un kit comercial y el protocolo de Doyle (1991). Además, se obtuvo ADN de alta calidad en los diferentes métodos de conservación en campo y tiempos de almacenamiento evaluados. Estos resultados sugieren que el protocolo optimizado propuesto en este estudio constituye un método confiable y eficaz para la extracción de ADN en V. meridionale, facilitando futuros estudios genéticos en esta especie.