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Localización y clasificación de regiones asociadas con mutaciones genómicas de nódulos pulmonares en imágenes PET y CT

dc.contributor.advisorMartinez Carrillo, Fabio
dc.contributor.advisorMoreno Tarazona, Alejandra
dc.contributor.advisorGuayacan Chaparro, Luis Carlos
dc.contributor.authorCallejas Mandon, Isabella
dc.contributor.authorPatiño Jaimes, Joan Sebastian
dc.contributor.authorVillarreal Parra, Cristian Stivens
dc.contributor.evaluatorGalvis Carreño, Laura Viviana
dc.contributor.evaluatorGonzales Ramirez, Luis Ignacio
dc.date.accessioned2025-11-18T17:47:08Z
dc.date.available2025-11-18T17:47:08Z
dc.date.created2025-11-12
dc.date.issued2025-11-12
dc.description.abstractEl cáncer de pulmón (CP) es el tipo de cáncer más frecuente y letal a nivel mundial, reportando 2.4 millones de incidencias y 1.8 millones de muertes en 2022 respectivamente. Los nódulos pulmonares (NP) son los principales biomarcadores de esta enfermedad, típicamente observados y caracterizados morfológicamente en tomografías computarizadas (CT). De forma complementaria y especializada, las tomografías por emisión de positrones (PET) brindan información funcional con alta correlación respecto a su malignidad. Además de su identificación y caracterización radiológica, la asociación con mutaciones genómicas específicas son claves para la definición de un tratamiento con pronóstico favorable. Sin embargo, este flujo de trabajo utilizando información morfológica (CT), funcional (PET) y genómica es poco común en la rutina clínica, debido a los altos costos, la exposición a la radiación en PET, el uso de biopsias invasivas y la poca disponibilidad de dispositivos para su captura. Además, persisten desafíos en la identificación y caracterización de los NP, debido a la alta subjetividad, variabilidad morfológica y la similitud con otras estructuras del parénquima. En este trabajo de investigación, se abordó un flujo de trabajo para la localización y clasificación de NP, considerando estudios imagenológicos de CT, PET, así como su mutación genómica. Para la localización de NP se empleó una arquitectura YOLO sobre CT, utilizando la información de PET como reducción de falsos positivos. Para la clasificación de mutaciones genómicas se implementó un modelo multimodal basado en Transformers, además de un enfoque autosupervisado que extrajo representaciones latentes mediante traducción CT–PET. El flujo completo se entrenó y validó en NSCLC-Radiogenomics (104 estudios). En localización, el modelo alcanzó un mAP50 de 73.30% ± 4.30. Para clasificación, el enfoque multimodal obtuvo un AUC de 94.14% ± 8.00, y el método autosupervisado logró un AUC de 84.60% ± 9.00.
dc.description.abstractenglishLung cancer (LC) is the most common and lethal cancer worldwide, reporting 2.4 million cases and 1.8 million deaths in 2022, respectively. Pulmonary nodules (PNs) are the main biomarkers for this disease, typically observed and morphologically characterized using computed tomography (CT) scans. Complementarily, and in a specialized manner, positron emission tomography (PET) scans provide functional information with a high correlation to malignancy. In addition to their identification and radiological characterization, the association with specific genomic mutations is key to defining a treatment with a favorable prognosis. However, this workflow using morphological (CT), functional (PET), and genomic information is uncommon in routine clinical practice due to high costs, radiation exposure during PET scans, the use of invasive biopsies, and the limited availability of data acquisition devices. Furthermore, challenges persist in the identification and characterization of NPs due to high subjectivity, morphological variability, and their similarity to other parenchymal structures. In this research, a workflow for the localization and classification of NPs was developed, considering CT and PET imaging studies, as well as their genomic mutations. A YOLO architecture on CT was used for NP localization, utilizing PET information to reduce false positives. A multimodal Transformers-based model was implemented for genomic mutation classification, along with a self-supervised approach that extracted latent representations through CT-PET translation. The complete workflow was trained and validated in NSCLC-Radiogenomics (104 studies). For localization, the model achieved an mAP50 of 73.30 ± 4.30. For classification, the multimodal approach achieved an AUC of 94.14% ± 8.00, and the self-supervised method achieved an AUC of 84.60% ± 9.00.
dc.description.degreelevelPregrado
dc.description.degreenameIngeniero de Sistemas
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.identifier.instnameUniversidad Industrial de Santander
dc.identifier.reponameUniversidad Industrial de Santander
dc.identifier.repourlhttps://noesis.uis.edu.co
dc.identifier.urihttps://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/46520
dc.language.isospa
dc.publisherUniversidad Industrial de Santander
dc.publisher.facultyFacultad de Ingeníerias Fisicomecánicas
dc.publisher.programIngeniería de Sistemas
dc.publisher.schoolEscuela de Ingeniería de Sistemas e Informática
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.coarhttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.creativecommonsAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)
dc.rights.licenseAtribución-NoComercial-SinDerivadas 2.5 Colombia (CC BY-NC-ND 2.5 CO)
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nd/4.0/
dc.subjectCáncer de pulmón
dc.subjectNódulos pulmonares
dc.subjectMutación genómica
dc.subjectCT
dc.subjectPET
dc.subjectLocalización
dc.subjectSíntesis.
dc.subject.keywordLung cancer
dc.subject.keywordLung nodules
dc.subject.keywordGenomic mutation
dc.subject.keywordCT
dc.subject.keywordPET
dc.subject.keywordLocalization
dc.subject.keywordSynthesis.
dc.titleLocalización y clasificación de regiones asociadas con mutaciones genómicas de nódulos pulmonares en imágenes PET y CT
dc.title.englishLocalization and classification of regions associated with genomic mutations of pulmonary nodules in PET and CT images
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.hasversionhttp://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
dc.type.localTesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado
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