Diseño in sillico de péptidos con actividad inhibitoria sobre proteínas ras usando algoritmos de evolución molecular

Abstract

El cáncer es una enfermedad de gran relevancia en el siglo XXI. Además, esta patología es conocida por tener una de las tasas más altas de mortalidad en todo el mundo. Se conocen alrededor de 200 tipos diferentes de esta patología; por esta razón, se han adelantado muchas investigaciones para intentar hallar nuevos fármacos que logren frenar esta enfermedad. Gracias a estos estudios, han surgido nuevas áreas de investigación, como las técnicas de biología computacional. En este marco, se han usado diversos biomarcadores proteicos, como blanco para el diseño de moléculas anticancerígenas. En este trabajo, se lleva a cabo el diseño in silico de péptidos con actividad inhibitoria sobre proteínas Ras, las cuales son las proteínas capaces de controlar fenómenos como el crecimiento celular, la diferenciación y la apoptosis, y que también actúan como interruptores en la proliferación celular. Además, estas proteínas son causantes de aproximadamente 20% a 30% de los diferentes tipos de cáncer. Para resolver este problema, se seleccionaron diferentes péptidos de la base de datos de péptidos antimicrobianos (APD) con actividad anticancerígena. Luego, por medio de técnicas de alineamiento de secuencias, se determinó los dominios conservados de los péptidos, los cuales se usaron para el diseño de los péptidos anticancerígenos con actividad inhibitoria sobre las proteínas Ras. Finalmente, se obtuvo por medio de algoritmos evolutivos, nuevos y mejores péptidos, los cuales fueron evaluados en su capacidad de unión a proteínas Ras por medio de la técnica de docking molecular semiflexible.