Publicación: Filodinamcia del virus dengue serotipo 3 en el área metropolitana de Bucaramanga, Santander durante el periodo 2001 a 2010
| dc.contributor.advisor | Ocaziones de Conde, Raquel | |
| dc.contributor.advisor | Villar Centeno, Luis Angel | |
| dc.contributor.author | Rey Caro, Luz Aida | |
| dc.date.accessioned | 2024-03-03T22:46:00Z | |
| dc.date.available | 2016 | |
| dc.date.available | 2024-03-03T22:46:00Z | |
| dc.date.created | 2016 | |
| dc.date.issued | 2016 | |
| dc.description.abstract | En Santander el dengue es problema prioritario. 70% de casos se concentran en el área metropolitana. Estudiar la dinámica de DENV-3 y factores asociados ayudaría a entender la epidemiología del dengue. Objetivo: Estudiar la relación entre factores del individuo y la población viral que contribuyen al mantenimiento del DENV-3 en el área metropolitana de Bucaramanga, Santander. Metodología: 208 sueros de pacientes con dengue se evaluaron por aislamiento viral para establecer abundancia de serotipos. Relaciones filogenéticas y diversidad genética relativa del DENV-3 de Santander se estudió en 50 secuencias del gen E completo. Tipo de infección se determinó en 254 sueros por ELISA-IgG captura. Se calculó el índice Shannon (IS) para determinar diversidad de serotipos en el tiempo. La correlación entre variables se evaluó mediante coeficiente de correlación de Spearman. Se modelaron razones de incidencia con regresión de Poisson. Resultados: Los cuatro serotipos de DENV co-circularon. DENV-3 fue predominante en el periodo (45%). No se encontró correlación entre abundancia de DENV-3 y abundancia de otros serotipos. El predominio superior al 50% de DENV-3 se correlacionó con incremento en incidencia de casos y primoinfecciones en el AMB. No obstante, no se encontró asociación entre serotipo y tipo de infección. Todas las cepas de DENV-3 de Santander agruparon en el genotipo III observándose co-circulación de dos linajes del genotipo desde 2007. Cambios en la diversidad relativa de DENV-3 coincidió con introducción o remplazo de linajes y cambios en su abundancia. Se observó relación de proporcionalidad directa entre IS e incidencia de dengue evaluados concurrentemente (incremento de 6.3% en incidencia por 0.1 unidades; IC95%: 6.16.7), que se acentuó con el IS del año inmediatamente anterior (RDI: 8.4, IC95%: 8.1-8.7). Conclusión: Los resultados revelan correlación temporal entre la dinámica de serotipos circulantes e incidencia del dengue, hallazgo potencialmente útil para modelos de predicción de epidemias en la región. 1 | |
| dc.description.abstractenglish | Phylodinamic of dengue virus serotype 3 in the metropolitan area of bucaramanga, santander during the period 2001 to 20103 | |
| dc.description.degreelevel | Maestría | |
| dc.description.degreename | Magíster en Ciencias Básicas Biomédicas | |
| dc.format.mimetype | application/pdf | |
| dc.identifier.instname | Universidad Industrial de Santander | |
| dc.identifier.reponame | Universidad Industrial de Santander | |
| dc.identifier.repourl | https://noesis.uis.edu.co | |
| dc.identifier.uri | https://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/35219 | |
| dc.language.iso | spa | |
| dc.publisher | Universidad Industrial de Santander | |
| dc.publisher.faculty | Facultad de Salud | |
| dc.publisher.program | Maestría en Ciencias Básicas Biomédicas | |
| dc.publisher.school | Escuela de Bacteriología y Laboratorio Clínico | |
| dc.rights | http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ | |
| dc.rights.accessrights | info:eu-repo/semantics/openAccess | |
| dc.rights.creativecommons | Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0) | |
| dc.rights.license | Attribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0) | |
| dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0 | |
| dc.subject | Dengue | |
| dc.subject | Virus Dengue | |
| dc.subject | Serotipos | |
| dc.subject | Abundancia Relativa | |
| dc.subject | Genotipo | |
| dc.subject | Diversidad Genética | |
| dc.subject | Tipo De Infección. | |
| dc.subject.keyword | Dengue is a priority problem in Santander. 70% of cases are concentrated in the metropolitan area. Study the dynamics of circulation of DENV-3 and associated factors would help to understand dengue epidemiology. Objective: To study the relationship between individual factors and the viral population that contributes to the maintenance of DENV-3 in the metropolitan area of Bucaramanga | |
| dc.subject.keyword | Santander. Methods: 208 sera from patients with dengue were evaluated by virus isolation to establish serotype abundance. Phylogenetic relationships and genetic diversity on the DENV-3 was studied in 50 E complete gene sequences of Santander. Type of infection was determined in 254 sera by IgG capture ELISA. Shannon index (SI) was calculated to determine diversity of serotypes over time. The correlation between variables was evaluated using Spearman's rank correlation coefficient. Incidence ratios were modeled with Poisson regression. Results: The four serotypes of DENV co-circulated. DENV-3 was predominant in the period (45%). No correlation between abundance of DENV-3 and abundance of other serotypes was found. Predominance higher to 50% of DENV-3 was correlated with increased of incidence and primary infections in the AMB. However | |
| dc.subject.keyword | no association between serotype and type of infection was found. All strains of DENV-3 from Santander evaluated grouped in genotype III with co-circulation of two lineages of genotype since 2007. Changes in the relative diversity of DENV-3 coincided with introduction or replacement of lines and changes in serotype abundance. Direct proportionality relationship between IS and dengue incidence evaluated concurrently was observed (6.3% increase in incidence by 0.1 units | |
| dc.subject.keyword | 95% CI 6.1-6.7) | |
| dc.subject.keyword | this relationship was accentuated with the IS of the previous year (RDI: 8.4 | |
| dc.subject.keyword | 95%: 8.1-8.7). Conclusion: The results reveal temporal correlation between the dynamics of circulating serotypes and dengue incidence. This find would be potentially useful to predictive models of dengue epidemics in the region. | |
| dc.title | Filodinamcia del virus dengue serotipo 3 en el área metropolitana de Bucaramanga, Santander durante el periodo 2001 a 2010 | |
| dc.title.english | Dengue, Dengue Virus Serotypes, Relative Abundance, Genotype, Genetic Diversity, Type Of Infection. | |
| dc.type.coar | http://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce | |
| dc.type.hasversion | http://purl.org/coar/resource_type/c_bdcc | |
| dc.type.local | Tesis/Trabajo de grado - Monografía - Maestria | |
| dspace.entity.type | Publication |
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