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Contribución al modelo de perdida de ADN para el estudio de la relación evolutiva de las familias de neuropéptidos: lwamida, apgwamida, hormona concentradora de pigmentos rojos, hormona adipocinetica, corazonina y hormona liberadora de gonadotropina

Resumen

Los neuropéptidos son una familia de neuromoduladores involucrados en diversos procesos fisiológicos. Uno de los modelos propuestos para explicar su evolución, es el Modelo de Pérdida de ADN (DNA-LM), el cual postula que la pérdida de codones de la LWamida de hidras y la APGW de moluscos produjeron precursores virtuales (APGW/RPCH), que originaron a la RPCH de crustáceos y las AKH 1-4 de insectos. Diversos grupos de investigación han demostrado la existencia del péptido hibrido AKH/CRZ-péptido relacionado (ACP) en insectos y crustáceos, así como su relación con la CRZ de insectos y la GnRH de vertebrados. Para validar, el DNA-LM entre estas familias y el precursor APGW/RPCH, se obtuvieron 9489 secuencias del GenBank. La implementación de tres softwares y un código de selección demostró que 511 secuencias corresponden a precursores neuropeptídicos. Con estos, se construyó una base de datos que permitió determinar RPCH, ACP y AHK 1 no caracterizadas. También permitió establecer la CRZ y la ACP en los transcriptomas de Callinectes arcuatus y C. toxotes, respectivamente. Además, se confirmó que los precursores virtuales APGW/RPCH presentan homología con sus respectivas familias y con otros phyla originalmente no asociados al modelo. La concatenación de las filogenias de cada familia con los parámetros del software Kaling y los del DNA-LM mostraron una división entre las GnRH de protostomados y deuterostomados. La primera mostró un clado de cefalópodos entre la RPCH y una secuencia AKH 4, mientras que las otras familias se agruparon en sus respectivos clados. En tanto, la filogenia con DNA-LM mostró un clado de GnRH, principalmente de vertebrados entre los grupos AKH 3 y CRZ, otro de anfibios entre AKH 1 y CRZ, mientras que los demás clados presentaron combinaciones entre las familias. El DNA-LM permite correlacionar evolutivamente familias neuropeptídicas por pérdida de ADN.