Publicación: Estudio de la diversidad genetica de ramphocelus (aves: thraupidae) presente en el departamento de Santander, implementado cebadores disenados para el analisis de la region de control del adn mitocondrial
| dc.contributor.advisor | Rondón González, Fernando | |
| dc.contributor.advisor | Moreno Patino, Jose Gregorio | |
| dc.contributor.author | Archila Davila, Jahiber Eduardo | |
| dc.date.accessioned | 2024-03-03T20:46:45Z | |
| dc.date.available | 2014 | |
| dc.date.available | 2024-03-03T20:46:45Z | |
| dc.date.created | 2014 | |
| dc.date.issued | 2014 | |
| dc.description.abstract | Los ecosistemas de los Andes Colombianos han sufrido una destrucción paulatina que ha conllevado a la ruptura de las dinámicas naturales de especies nativas. Dicho fenómeno ha afectado a la tángara Ramphocelus icteronotus, especie representativa del Chocó biogeográfico, quien en la actualidad está presente en áreas montañosas del departamento de Santander. El proceso de desplazamiento puede conducir a la diferenciación y al aislamiento genético entre distintas poblaciones de la especie. En Colombia, los estudios genético poblacionales que involucran a R. icteronotus, han sido realizados predominantemente con marcadores genéticos conservados, los cuales son más apropiados para análisis filogenéticos. Con el objetivo de analizar la diversidad genética de las poblaciones de Ramphocelus icteronotus presentes en el departamento de Santander, se implementaron cebadores diseñados a partir del modelo de pérdida de ADN; con estos se amplificó y se secuenció dos dominios de la región control (D-loop) de ADNmt. Se caracterizaron 22 sitios polimórficos definidos en 12 haplotipos. Al comparar entre los componentes subpoblacionales la diversidad haplotípica observada fue alta y la diversidad nucleotídica fue baja. El Análisis Molecular de Varianza (AMOVA) mostró ausencia de estructura genética entre las subpoblaciones estudiadas (ST=-0,0496), lo cual permite establecer que los componentes subpoblacionales analizados se comportan como una sola unidad reproductiva, soportada por infinitos migrantes efectivos por generación. Los hallazgos de este estudio indican que Ramphocelus icteronotus en el departamento de Santander, carece de estructura genética poblacional con base en el marcador molecular evaluado y permite hipotetizar que presenta características típicas de la diversidad genética de una especie en expansión. | |
| dc.description.abstractenglish | The natural ecosystems in the Colombian Andes have suffered gradual destruction broking down the natural dynamic of native species. This phenomenon has affected the tanager Ramphocelus icteronotus, representative specie of Chocó biogeographic region, which currently inhabiting mountain areas of Santander department. The displacement process can lead to the differentiation and the genetic isolation between different populations of the species. In Colombia, genetic population studies involving R. icteronotus have been predominantly carried out using conserved gene markers, which are more suitable for phylogenetic analysis. The aim of this study was to analyze the genetic diversity of R. icteronotus populations present in the department of Santander. Were implemented primers designed from the DNA loss model, which allowed to amplify and sequence two domains of the control region (D-loop) from mtDNA. Were characterized 22 polymorphic sites defined in 12 haplotypes from HV1 region. A comparison between subpopulation components showed high haplotype diversity and low nucleotide diversity. The Analysis Molecular Variance (AMOVA) showed no genetic structure among the subpopulations studied (ST=-0,0496). This allowed establish that the subpopulation components analyzed behave as a single reproductive unit, supported by infinite effective migrants per generation. Based on the molecular marker evaluated, the findings of this study indicate that Ramphocelus icteronotus lack of population genetic structure. This result allows us to hypothesize that Ramphocelus icteronotus present typical characteristics of genetic diversity of a specie in expansion. | |
| dc.description.degreelevel | Pregrado | |
| dc.description.degreename | Biólogo | |
| dc.format.mimetype | application/pdf | |
| dc.identifier.instname | Universidad Industrial de Santander | |
| dc.identifier.reponame | Universidad Industrial de Santander | |
| dc.identifier.repourl | https://noesis.uis.edu.co | |
| dc.identifier.uri | https://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/30970 | |
| dc.language.iso | spa | |
| dc.publisher | Universidad Industrial de Santander | |
| dc.publisher.faculty | Facultad de Ciencias | |
| dc.publisher.program | Biología | |
| dc.publisher.school | Escuela de Biología | |
| dc.rights | http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ | |
| dc.rights.accessrights | info:eu-repo/semantics/openAccess | |
| dc.rights.creativecommons | Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0) | |
| dc.rights.license | Attribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0) | |
| dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0 | |
| dc.subject | Ramphocelus | |
| dc.subject | Adn Mitocondrial | |
| dc.subject | Cebadores Aves | |
| dc.subject | Región Control | |
| dc.subject | Diversidad Genética | |
| dc.subject | Santander. | |
| dc.subject.keyword | Ramphocelus | |
| dc.subject.keyword | Mitochondrial Dna | |
| dc.subject.keyword | Avian Primers | |
| dc.subject.keyword | Control Region | |
| dc.subject.keyword | Genetic Diversity | |
| dc.subject.keyword | Santander. | |
| dc.title | Estudio de la diversidad genetica de ramphocelus (aves: thraupidae) presente en el departamento de Santander, implementado cebadores disenados para el analisis de la region de control del adn mitocondrial | |
| dc.title.english | Study of genetic diversity of ramphocelus icteronotus (aves: tanager) present in the Santander department implementing primers designed for the analysis of mitochondrial dna control region | |
| dc.type.coar | http://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce | |
| dc.type.hasversion | http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f | |
| dc.type.local | Tesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado | |
| dspace.entity.type | Publication |
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