Logotipo del repositorio

Publicación:
Estudio de la diversidad genetica de ramphocelus (aves: thraupidae) presente en el departamento de Santander, implementado cebadores disenados para el analisis de la region de control del adn mitocondrial

dc.contributor.advisorRondón González, Fernando
dc.contributor.advisorMoreno Patino, Jose Gregorio
dc.contributor.authorArchila Davila, Jahiber Eduardo
dc.date.accessioned2024-03-03T20:46:45Z
dc.date.available2014
dc.date.available2024-03-03T20:46:45Z
dc.date.created2014
dc.date.issued2014
dc.description.abstractLos ecosistemas de los Andes Colombianos han sufrido una destrucción paulatina que ha conllevado a la ruptura de las dinámicas naturales de especies nativas. Dicho fenómeno ha afectado a la tángara Ramphocelus icteronotus, especie representativa del Chocó biogeográfico, quien en la actualidad está presente en áreas montañosas del departamento de Santander. El proceso de desplazamiento puede conducir a la diferenciación y al aislamiento genético entre distintas poblaciones de la especie. En Colombia, los estudios genético poblacionales que involucran a R. icteronotus, han sido realizados predominantemente con marcadores genéticos conservados, los cuales son más apropiados para análisis filogenéticos. Con el objetivo de analizar la diversidad genética de las poblaciones de Ramphocelus icteronotus presentes en el departamento de Santander, se implementaron cebadores diseñados a partir del modelo de pérdida de ADN; con estos se amplificó y se secuenció dos dominios de la región control (D-loop) de ADNmt. Se caracterizaron 22 sitios polimórficos definidos en 12 haplotipos. Al comparar entre los componentes subpoblacionales la diversidad haplotípica observada fue alta y la diversidad nucleotídica fue baja. El Análisis Molecular de Varianza (AMOVA) mostró ausencia de estructura genética entre las subpoblaciones estudiadas (ST=-0,0496), lo cual permite establecer que los componentes subpoblacionales analizados se comportan como una sola unidad reproductiva, soportada por infinitos migrantes efectivos por generación. Los hallazgos de este estudio indican que Ramphocelus icteronotus en el departamento de Santander, carece de estructura genética poblacional con base en el marcador molecular evaluado y permite hipotetizar que presenta características típicas de la diversidad genética de una especie en expansión.
dc.description.abstractenglishThe natural ecosystems in the Colombian Andes have suffered gradual destruction broking down the natural dynamic of native species. This phenomenon has affected the tanager Ramphocelus icteronotus, representative specie of Chocó biogeographic region, which currently inhabiting mountain areas of Santander department. The displacement process can lead to the differentiation and the genetic isolation between different populations of the species. In Colombia, genetic population studies involving R. icteronotus have been predominantly carried out using conserved gene markers, which are more suitable for phylogenetic analysis. The aim of this study was to analyze the genetic diversity of R. icteronotus populations present in the department of Santander. Were implemented primers designed from the DNA loss model, which allowed to amplify and sequence two domains of the control region (D-loop) from mtDNA. Were characterized 22 polymorphic sites defined in 12 haplotypes from HV1 region. A comparison between subpopulation components showed high haplotype diversity and low nucleotide diversity. The Analysis Molecular Variance (AMOVA) showed no genetic structure among the subpopulations studied (ST=-0,0496). This allowed establish that the subpopulation components analyzed behave as a single reproductive unit, supported by infinite effective migrants per generation. Based on the molecular marker evaluated, the findings of this study indicate that Ramphocelus icteronotus lack of population genetic structure. This result allows us to hypothesize that Ramphocelus icteronotus present typical characteristics of genetic diversity of a specie in expansion.
dc.description.degreelevelPregrado
dc.description.degreenameBiólogo
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.identifier.instnameUniversidad Industrial de Santander
dc.identifier.reponameUniversidad Industrial de Santander
dc.identifier.repourlhttps://noesis.uis.edu.co
dc.identifier.urihttps://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/30970
dc.language.isospa
dc.publisherUniversidad Industrial de Santander
dc.publisher.facultyFacultad de Ciencias
dc.publisher.programBiología
dc.publisher.schoolEscuela de Biología
dc.rightshttp://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.creativecommonsAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)
dc.rights.licenseAttribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0
dc.subjectRamphocelus
dc.subjectAdn Mitocondrial
dc.subjectCebadores Aves
dc.subjectRegión Control
dc.subjectDiversidad Genética
dc.subjectSantander.
dc.subject.keywordRamphocelus
dc.subject.keywordMitochondrial Dna
dc.subject.keywordAvian Primers
dc.subject.keywordControl Region
dc.subject.keywordGenetic Diversity
dc.subject.keywordSantander.
dc.titleEstudio de la diversidad genetica de ramphocelus (aves: thraupidae) presente en el departamento de Santander, implementado cebadores disenados para el analisis de la region de control del adn mitocondrial
dc.title.englishStudy of genetic diversity of ramphocelus icteronotus (aves: tanager) present in the Santander department implementing primers designed for the analysis of mitochondrial dna control region
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
dc.type.hasversionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.localTesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado
dspace.entity.typePublication

Archivos

Bloque original

Mostrando 1 - 3 de 3
Cargando...
Miniatura
Nombre:
Carta de autorización.pdf
Tamaño:
434.52 KB
Formato:
Adobe Portable Document Format
Cargando...
Miniatura
Nombre:
Documento.pdf
Tamaño:
1.99 MB
Formato:
Adobe Portable Document Format
Cargando...
Miniatura
Nombre:
Nota de proyecto.pdf
Tamaño:
443.79 KB
Formato:
Adobe Portable Document Format

Colecciones

VIGILADA MINEDUCACIÓN

Ordenanza No. 83 de 1.944 (junio 22)

Carácter académico: Universidad

Notificaciones judiciales: notjudiciales@uis.edu.co 

.

Código SNIES: 1204   Nit: 890.201.213-4

Línea Anticorrupción:  +57 (601) 562 9300 EXT: 3633

Línea transparente: +57 (607) 630 3031