El desarrollo de competencias científicas en la Educación Básica Primaria responde a los lineamientos curriculares y a los estándares de calidad educativa que orientan la enseñanza de las ciencias naturales en el contexto escolar colombiano. En este sentido, el estudio tuvo como objetivo fortalecer las competencias científicas de uso comprensivo del conocimiento científico, explicación de fenómenos e indagación en estudiantes de tercer grado del primer nivel de educación básica primaria de la Institución Educativa Técnico Dámaso Zapata, mediante la implementación del Aprendizaje Basado en la Indagación (ABI). La investigación se desarrolló desde un enfoque cualitativo, bajo la metodología de investigación-acción, lo que permitió analizar de manera reflexiva la práctica pedagógica y las transformaciones generadas en el aula. La intervención didáctica se implementó a través de la estrategia de laboratorios domésticos, orientada a promover la experimentación, la formulación de hipótesis, la observación sistemática y la construcción de explicaciones sobre fenómenos naturales a partir de situaciones contextualizadas. Los resultados muestran que la estrategia de laboratorios domésticos, bajo el Aprendizaje Basado en la Indagación, generó un fortalecimiento en las competencias científicas y favoreció la participación activa de los estudiantes en la construcción de aprendizajes contextualizados en Ciencias Naturales. Finalmente, se concluye que el Aprendizaje Basado en la Indagación constituye una estrategia pertinente y significativa para el fortalecimiento de las competencias científicas en la educación básica primaria, al favorecer aprendizajes contextualizados y la construcción progresiva del pensamiento científico.