La enseñanza de la evolución biológica presenta desafíos significativos para los estudiantes de secundaria, y los museos de historia natural son espacios con un gran potencial educativo, aunque a menudo subutilizados para este fin. Este trabajo presenta el diseño, implementación y evaluación de una experiencia de aprendizaje sobre evolución, dirigida a estudiantes de noveno grado, en la Sala de Exhibición del Museo de Historia Natural de la Universidad Industrial de Santander (MHN-UIS). La estrategia utiliza como caso de estudio el género de peces Trichomycterus, presente en ecosistemas de cueva y de superficie en Santander, para ilustrar conceptos como la selección natural, la adaptación y la evolución regresiva. El diseño metodológico se basó en una revisión de herramientas pedagógicas empleadas en otros museos y una fundamentación teórica sobre la biología evolutiva en ambientes cavernícolas. La experiencia, de 75 minutos, se implementó con 12 estudiantes e incluyó recursos como videos de autoría propia, discusiones guiadas, material fotográfico y una actividad lúdica. La efectividad de la intervención se evaluó cuantitativamente mediante un pretest y un postest, analizando los datos con una prueba t-student para muestras relacionadas. Los resultados demostraron un incremento estadísticamente significativo (p < 0.05) en la comprensión de los conceptos evolutivos por parte de los participantes tras la intervención. Se concluye que la experiencia diseñada es una herramienta didáctica efectiva que no solo mejora la asimilación de conceptos abstractos de la evolución, sino que también fomenta la apropiación del patrimonio biológico local. El trabajo aporta un modelo metodológico validado que puede ser replicado y adaptado por educadores en el MHN-UIS y otros contextos museales.