Publicación: Evaluación de la diversidad genética a partir de secuencias del gen nd2 en poblaciones simpátricas de ramphocelus dimidiatus y r. icteronotus presentes en el departamento de Santander, Colombia
| dc.contributor.advisor | Rondon Gonzalez, Fernando | |
| dc.contributor.advisor | Rodrigues Dos Santos, Fabricio | |
| dc.contributor.author | Vargas Nuñez, Lizeth Carolina | |
| dc.date.accessioned | 2024-03-03T23:20:58Z | |
| dc.date.available | 2017 | |
| dc.date.available | 2024-03-03T23:20:58Z | |
| dc.date.created | 2017 | |
| dc.date.issued | 2017 | |
| dc.description.abstract | La progresiva degradación ambiental por causas antrópicas, pueden afectar la biodiversidad de la avifauna colombiana. Esta degradación ha posibilitado la ampliación del rango distribucional de Ramphocelus icteronotus, especie presente, actualmente, en el departamento de Santander, Colombia. Como consecuencia, dicha especie se encuentra actualmente en simpatría con R. dimidiatus, posibilitando la alteración de la diversidad genética en esta, dado que podría dificultar el flujo génico y conducir a su pérdida de variabilidad de presentarse hibridación. Con el objetivo de evaluar la diversidad y el grado de estructura genética, se secuenció el gen NADH deshidrogenasa subunidad 2 (ND2) del DNA mitocondrial (mtDNA) en 47 muestras de R. dimidiatus y 25 muestras de R. icteronotus, presentes en cinco localidades de Santander. Las secuencias resultantes fueron analizadas y alineadas con base en secuencias ND2 de cada especie registradas en el GenBank. Los resultados obtenidos a partir de 983pb genotipados en R. dimidiatus y 920pb en R. icteronotus, permitieron caracterizar 19 y 10 haplotipos, respectivamente. En las dos especies se detectó un patrón de elevada diversidad haplotípica y baja diversidad nucleotídica, además de baja diferenciación genética en R. dimidiatus (ST=0,0254) y moderada en R. icteronotus (ST=0,0584). El flujo génico entre las dos especies fue restringido (Nm<0,256), soportado por la ausencia de haplotipos compartidos entre ellas. A partir de los resultados se concluye que, pese a la simpatría, existe un elevado grado de diferenciación genética entre R. dimidiatus y R. icteronotus (ST= 0,9421), sin alteración de la diversidad haplotípica y nucleotídica de la especie históricamente residente en Santander, la cual es mayor que en la especie en expansión; esto no conduce a ubicar a R. dimidiatus en un status especial de conservación | |
| dc.description.abstractenglish | The progressive environmental degradation due to anthropic causes, can affect the biodiversity of Colombian avifauna. This degradation has made it possible to expand the distributional range of Ramphocelus icteronotus, a species currently present in the department of Santander, Colombia. Consequently, this species currently is in sympatry with R. dimidiatus, allowing the alteration of the genetic diversity in this species, because could hinder the gene flow and lead to its loss of variability, if them present hybridization. In order to evaluate the diversity and degree of genetic structure, the gene NADH dehydrogenase 2 (ND2) of mitochondrial DNA (mtDNA) was sequenced in 47 samples of R. dimidiatus and 25 samples of R. icteronotus present in five localities of Santander. The resulting sequences were analyzed and aligned based on ND2 sequences from each species recorded on GenBank. The results obtained from 983pb genotyped in R. dimidiatus and 920pb in R. icteronotus allowed to characterize 19 and 10 haplotypes respectively. In both species were detected a pattern of high haplotype diversity and low nucleotide diversity, as well as low genetic differentiation in R. dimidiatus ST=0,0254) and moderate in R. icteronotus ST=0,0584). The gene flow among the two species was restricted (Nm<0.256), supported by the absence of haplotypes shared between them. From the results, it is concluded that despite the sympatry, there is a high degree of genetic differentiation between R. dimidiatus and R. icteronotus ST=0,9421), without alteration of the haplotype and nucleotide diversity of the historically resident species in Santander, which is greater than the expanding species; this does not lead to locate R. dimidiatus in a special conservation status. | |
| dc.description.degreelevel | Pregrado | |
| dc.description.degreename | Biólogo | |
| dc.format.mimetype | application/pdf | |
| dc.identifier.instname | Universidad Industrial de Santander | |
| dc.identifier.reponame | Universidad Industrial de Santander | |
| dc.identifier.repourl | https://noesis.uis.edu.co | |
| dc.identifier.uri | https://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/36467 | |
| dc.language.iso | spa | |
| dc.publisher | Universidad Industrial de Santander | |
| dc.publisher.faculty | Facultad de Ciencias | |
| dc.publisher.program | Biología | |
| dc.publisher.school | Escuela de Biología | |
| dc.rights | http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ | |
| dc.rights.accessrights | info:eu-repo/semantics/openAccess | |
| dc.rights.creativecommons | Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0) | |
| dc.rights.license | Attribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0) | |
| dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0 | |
| dc.subject | Diversidad Haplotípica | |
| dc.subject | Diversidad Nucleotídica | |
| dc.subject | Estructura Genética | |
| dc.subject | Nd2 | |
| dc.subject | Ramphocelus. | |
| dc.subject.keyword | Haplotype Diversity | |
| dc.subject.keyword | Nucleotide Diversity | |
| dc.subject.keyword | Genetic Structure | |
| dc.subject.keyword | Nd2 | |
| dc.subject.keyword | Ramphocelus. | |
| dc.title | Evaluación de la diversidad genética a partir de secuencias del gen nd2 en poblaciones simpátricas de ramphocelus dimidiatus y r. icteronotus presentes en el departamento de Santander, Colombia | |
| dc.title.english | Evaluation of genetic diversity from sequences of nd2 gene in sympatric populations of ramphocelus dimidiatus and r. icteronotus present in the department of santander, colombia | |
| dc.type.coar | http://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce | |
| dc.type.hasversion | http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f | |
| dc.type.local | Tesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado | |
| dspace.entity.type | Publication |
Archivos
Bloque original
1 - 3 de 3
Cargando...
- Nombre:
- Carta de autorización.pdf
- Tamaño:
- 370.13 KB
- Formato:
- Adobe Portable Document Format
Cargando...
- Nombre:
- Nota de proyecto.pdf
- Tamaño:
- 266.53 KB
- Formato:
- Adobe Portable Document Format
