Recombination of chl-fus gene (plastid origin) downstream of hop: a locus of chromosomal instability

Salinas Castellanos, Libia Catalina

Publicación:
Recombination of chl-fus gene (plastid origin) downstream of hop: a locus of chromosomal instability

dc.contributor.advisor	Hernández Torres, Jorge
dc.contributor.advisor	Chomilier, Jacques
dc.contributor.author	Salinas Castellanos, Libia Catalina
dc.date.accessioned	2024-03-03T22:16:14Z
dc.date.available	2015
dc.date.available	2024-03-03T22:16:14Z
dc.date.created	2015
dc.date.issued	2015
dc.description.abstract	La co-chaperona Hop actúa como adaptadora en el plegamiento y maduración de Hsp70 y Hsp90. El gen hop es de origen eucariótico. Por otra parte, el factor de elongación cloraplástico G (cEF-G) cataliza el paso de translocación en la síntesis de proteínas en el cloroplasto. El gen chl-fus es de origen cloroplástico. Ambas proteínas fueron originadas por la duplicación de dominios. Fue demostrado, que el gen nuclear chl-fus, el cual codifica para la proteína cEF-G, se localiza en transcipción convergente con el gen hop en Glycine max. Analizamos 51 genomas vegetales desde Chlorophyta hasta plantas superiores, para determinar sí el gen chl-fus fue transferido directamente a la célula Proto-eucariota con hop. Ambos genes vienen de eventos de exón/modulo duplicación, exploramos la participación de los intrones en el origen y los consecutivos cambios en la estructura de los genes. Reconstruimos la historia evolutiva de los dos genes de transcripción convergente en plantas, basado en su estructura, microsintenia y microcolinealidad. A pesar del alto grado de microcolinealidad (65%) se demostró que su continuidad es producto de arreglos cromosómicos. Según, la predicción de la estructura exón-intrón se infirieron los eventos moleculares que dieron lugar a los genes actuales. Se propuso un modelo por recombinación donde los intrones fase-0 fueron esenciales para la duplicación de los dominios y los intrones fase-1 para el reclutamiento del péptido de tránsito. Finalmente, demostramos la susceptibilidad natural de la región intergénica a recombinarse o perderse, afectando seriamente la integridad del gen chl-fus en el futuro. Concluimos que el gen chl-fus fue transferido desde el cloroplasto a un cromosoma diferente al de hop en la célula eucatiótica fotosintética primitiva. Antes de aparecer en plantas superiores fue recombinado junto a hop. La recombinación mediada por la simetría de los intrones fue esencial para la evolución de los genes.
dc.description.abstractenglish	The co-chaperone Hop has been shown to act as an adaptor for protein folding and maturation, in concert with Hsp70 and Hsp90. The hop gene is of eukaryotic origin. Likewise, the chloroplast elongation factor G (cEF-G) catalyzes the translocation step in chloroplast protein synthesis. The chl-fus gene is of plastid origin. It was demonstrated that the nuclear chl-fus gene, which encodes the cEF-G protein, locates in opposite orientation to a hop gene in Glycine max. We explored fifty-one available plant genomes from Chlorophyta to higher plants, to determine whether the chl-fus gene was transferred directly downstream of the primordial hop in the proto-eukaryote host cell. Both genes came from exon/module duplication events. We reconstructed the evolutionary history of the two convergent plant genes, on the basis of their gene structure, microsynteny and microcolinearity. Despite a high degree (65%) of microcolinearity among vascular plants, our results demonstrate that their adjacency was a product of chromosomal rearrangements. Based on genes. Therefore, we propose a simple model of exon/module shuffling by intronic recombinations in which phase-0 introns were essential for domain duplication, and a phase-1 intron for transit peptide recruiting. Finally, we demonstrate a natural susceptibility of the intergenic region to recombine or delete, seriously threatening the integrity of the chl-fus gene for the future. Our results are consistent with the interpretation that the chl-fus gene was transferred from the chloroplast to a chromosome different from that of hop in the primitive photosynthetic eukaryote. Before the appearance of higher plants, it was recombined downstream of hop. Exon/module shuffling mediated by symmetric intron phases was essential for gene evolution. The intergenic region is prone to recombine, risking the integrity of both genes.
dc.description.degreelevel	Pregrado
dc.description.degreename	Biólogo
dc.format.mimetype	application/pdf
dc.identifier.instname	Universidad Industrial de Santander
dc.identifier.reponame	Universidad Industrial de Santander
dc.identifier.repourl	https://noesis.uis.edu.co
dc.identifier.uri	https://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/33572
dc.language.iso	spa
dc.publisher	Universidad Industrial de Santander
dc.publisher.faculty	Facultad de Ciencias
dc.publisher.program	Biología
dc.publisher.school	Escuela de Biología
dc.rights	http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
dc.rights.accessrights	info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.creativecommons	Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)
dc.rights.license	Attribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)
dc.rights.uri	http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0
dc.subject	Proteínas Tpr; Gen Hop; Cef-G; Gen Chl-Fus; Microsintenia; Exon Shuffling; Fase De Los Intrones
dc.subject.keyword	Tpr Proteins; Hop Gene; Cef-G; Chl-Fus Gene; Microsynteny; Exon Shuffling; Intron Phase
dc.title	Recombination of chl-fus gene (plastid origin) downstream of hop: a locus of chromosomal instability
dc.title.english	Recombination of chl-fus gene (plastid origin) downstream of hop: a locus of chromosomal instability
dc.type.coar	http://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
dc.type.hasversion	http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.local	Tesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado
dspace.entity.type	Publication