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Estructura y características del bacterioma intestinal del gusano barrenador la caña Diatraea saccharalis (Lepidoptera: Crambidae)

Resumen

La caña de azúcar es un cultivo importante en la economía colombiana para la producción de azúcar y etanol, entre otros. El barrenador de la caña de azúcar, Diatraea saccharalis, causa pérdidas económicas sustanciales. Las larvas del insecto perforan galerías dentro de los tallos y además facilitan la infección con hongos y bacterias. En las plantas jóvenes ocasionan la muerte del tejido apical y al final de toda la planta. Las bacterias del tracto digestivo cumplen, entre otros, un rol activo en la asimilación de los nutrientes ingeridos por los insectos. El presente trabajo de grado tiene como objetivo caracterizar los bacteriomas del tracto digestivo de D. saccharalis en estado larval, en función de dos tipos de dieta, natural y artificial. Mediante caracterización metataxonómica se identificaron los grupos taxonómicos presentes en el intestino de las larvas tratadas con dichas dietas, revelando que los géneros Wolbachia y Microbacterium son comunes entre los tratamientos, además de cinco familias ya reportadas en el intestino de otros lepidópteros. Adicionalmente, se establecieron perfiles funcionales con HUMAnN2, evidenciándose discrepancia en la estructura de las comunidades tratadas con cada tipo de alimento. A partir de microbiología tradicional, se identificaron 12 cepas con características biotecnológicas relevantes para futuros proyectos. Se secuenció el genoma completo de aquella que presentó mayor actividad celulolítica según pruebas cualitativas (GCEP-101). El análisis del genoma cerrado reveló que GCEP-101 tiene identidades 16S rRNA y valores ANI y dDDH que lo ubican dentro del género Pseudomonas. La anotación del genoma de esta probable nueva especie reveló la aparición de genes asociados con la degradación de la celulosa, revelando el potencial de D. saccharalis como reservorio de microorganismos biotecnológicamente relevantes.