Computational tool for the analysis of HIV mutations associated with susceptibility or resistance to drugs
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Universidad Industrial de Santander
Abstract
Description
This paper presents the development and implementation of the system that serves as a tool for the study and exploration of Human Immunodefciency Virus (HIV) from computational analysis of these mutations, taking genetic information itself. The analysis is performed using the information contained in the HIV genetic sequence and comparing it to reference sequences. Descriptions of the algorithms for alignment, mutation identifcation and resistance analysis applied to the genetic sequence of the virus are presented.
Este artículo presenta el desarrollo e implementación de un sistema que sirva como herramienta para el estudio y exploración del VIH a partir del análisis computacional de sus mutaciones, teniendo en cuenta la información genética del mismo. El análisis se realiza empleando la información contenida en la secuencia genética del VIH y comparándola con secuencias de referencia. Se presenta una descripción de algoritmos para alineamiento, identifcación de mutaciones y análisis de resistencia aplicados a la secuencia genética del virus.
Este artículo presenta el desarrollo e implementación de un sistema que sirva como herramienta para el estudio y exploración del VIH a partir del análisis computacional de sus mutaciones, teniendo en cuenta la información genética del mismo. El análisis se realiza empleando la información contenida en la secuencia genética del VIH y comparándola con secuencias de referencia. Se presenta una descripción de algoritmos para alineamiento, identifcación de mutaciones y análisis de resistencia aplicados a la secuencia genética del virus.
Keywords
Bioinformatics, resistance, DNA, amino acid, nucleotiden, protease, reverse transcriptase, Bioinformática, resistencia, ADN, aminoácido, nucleótido, proteasa, transcriptasa inversa