Validación de la expresión del Regulador de Información Silencioso 2 SIR2 en obreras y zánganos de Apis mellifera

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dc.contributor.advisorMartínez Pérez, Francisco José
dc.contributor.advisorAvendaño Vasquez, Leonardo
dc.contributor.authorPardo Díaz, Luis Ariel
dc.contributor.evaluatorFuentes Lorenzo, Jorge Luis
dc.date.accessioned2024-05-06T21:00:01Z
dc.date.available2024-05-06T21:00:01Z
dc.date.created2024-05-04
dc.date.embargoEnd2026-05-05
dc.date.issued2024-05-04
dc.description.abstractLa especie de abejas Apis mellifera está distribuida a nivel global, lo cual la convierte en el insecto que más participa en la polinización. Las diferencias en las esperanzas de vida de las castas que componen las colonias de abejas son de gran interés científico, se ha hipotetizado que estas diferencias pueden ser causa de factores asociados al comportamiento o a epigenética. La familia de genes Sirtunas codifican proteínas desacetilasas de histonas dependientes de NAD+ y están implicadas en el silenciamiento de la transcripción. El miembro de la familia SIR2 está asociado a la esperanza de vida en eucariotas. La secuencia de este gen se encuentra reportada en el GenBank bajo el estatus predictivo, a su vez, tres posibles variantes de procesamiento del ARNm. Se hipotetiza que puede existir expresión cualitativamente diferente entre las castas obreras y zánganos de la especie A. mellifera asociada al procesamiento alternativo. El objetivo de esta investigación, es validar la expresión del SIR2 en obreras y zánganos. Se realizó un análisis in silico de los exones de las tres posibles variantes para establecer exones comunes y únicos, se diseñaron cebadores para recuperar el marco abierto de lectura por medio de RT-PCR y analizar los amplicones por medio de electroforesis y patrones de restricción. Se pudo amplificar un nuevo patrón de RT-PCR que fue expresado exclusivamente en zánganos cuyo tamaño no coincide con secuencias anotadas en el Genbank para SIR2 de A. mellifera. Se sugiere que este nuevo patrón puede ser producto del procesamiento alternativo, dado que se ha reportado en humanos variantes de tamaños similares en el homólogo SIRT1. Además, los insectos con una estructura social tan compleja difieren entre ellos mismo por causa epigenéticas. Por lo tanto, validamos por medio de RT-PCR que SIR2 si tiene expresión diferencial entre las castas de estudio de esta investigación.
dc.description.abstractenglishThe bee species Apis mellifera is distributed globally, which makes it the insect that participates most in pollination. The differences in the life expectancies of the castes that make up the bee colonies are of great scientific interest, it has been hypothesized that these differences may be caused by factors associated with behavior or epigenetics. The Sirtunas gene family encodes NAD+-dependent histone deacetylase proteins and are involved in transcription silencing. The SIR2 family member is associated with life expectancy in eukaryotes. The sequence of this gene is reported in the GenBank under the predictive status, in turn, three possible variants of mRNA processing. It is hypothesized that there may be qualitatively different expression between the worker and drone castes of the A. mellifera species associated with alternative processing. The objective of this research is to validate the expression of SIR2 in workers and drones. An in silico analysis of the exons of the three possible variants was performed to establish common and unique exons, primers were designed to recover the open reading frame by means of RT-PCR and amplicons were analyzed by means of electrophoresis and restriction standards. It was possible to amplify a new RT-PCR pattern that was expressed exclusively in drones whose size does not match sequences annotated in the Genbank for A. mellifera SIR2. It is suggested that this new pattern may be the product of alternative processing, since variants of similar sizes in the SIRT1 homolog have been reported in humans. Moreover, insects with such a complex social structure differ from each other by epigenetic causes. Therefore, we validated by RT-PCR that SIR2 does have differential expression between the castes studied in this research.
dc.description.cvlachttps://scienti.minciencias.gov.co/cvlac/EnRecursoHumano/inicio.do
dc.description.degreelevelPregrado
dc.description.degreenameBiólogo
dc.description.orcid0009-0009-1733-1774
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.identifier.instnameUniversidad Industrial de Santander
dc.identifier.reponameUniversidad Industrial de Santander
dc.identifier.repourlhttps://noesis.uis.edu.co
dc.identifier.urihttps://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/42320
dc.language.isospa
dc.publisherUniversidad Industrial de Santander
dc.publisher.facultyFacultad de Ciencias
dc.publisher.programBiología
dc.publisher.schoolEscuela de Biología
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/embargoedAccess
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.coarhttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.creativecommonsAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)
dc.rights.licenseAtribución-SinDerivadas 2.5 Colombia (CC BY-ND 2.5 CO)
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.subjectProcesamiento del ARNm
dc.subjectExpresión de genes
dc.subjectCastas sociales de abejas
dc.subjectPurificación de ácidos nucleicos
dc.subjectSIR2
dc.subjectActina
dc.subject.keywordmRNA processing
dc.subject.keywordGene expression
dc.subject.keywordBee social castes
dc.subject.keywordNucleic acid purification
dc.subject.keywordSIR2
dc.subject.keywordActin
dc.titleValidación de la expresión del Regulador de Información Silencioso 2 SIR2 en obreras y zánganos de Apis mellifera
dc.title.englishValidation of Silent Information Regulator 2 SIR2 expression in Apis mellifera workers and drones
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.hasversionhttp://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
dc.type.localTesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado
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Biología