Efecto electrostático de la inclusión de la región MM de la proteína sobre las interacciones entre (R,S)-propranolol y lipasa B de Candida antarctica

Amado Tavera, Luisa Fernanda

Efecto electrostático de la inclusión de la región MM de la proteína sobre las interacciones entre (R,S)-propranolol y lipasa B de Candida antarctica

dc.contributor.advisor	Doerr, Markus Hans Oliver
dc.contributor.advisor	Rincón Daza, David Alejandro
dc.contributor.author	Amado Tavera, Luisa Fernanda
dc.contributor.evaluator	Blanco Tirado, Cristian
dc.contributor.evaluator	Pérez Torres, Jhon Fredy
dc.date.accessioned	2022-04-19T16:41:39Z
dc.date.available	2022-04-19T16:41:39Z
dc.date.created	2022-03-30
dc.date.issued	2022-03-30
dc.description.abstract	En este trabajo se continuó con el estudio del mecanismo de reacción de la acetilación catalizada por lipasa B de Candida antárctica, la cual permite la resolución cinética de los enantiómeros del (R,S)-propranolol, un compuesto de interés farmacéutico. Para esto, se realizó un estudio computacional empleando métodos teóricos como: cálculos combinados de mecánica cuántica (QM) y mecánica molecular (MM), que permiten dividir la región activa de la proteína en una región QM y una región MM; y la teoría cuántica de átomos en moléculas (QTAIM), que permite evaluar las interacciones intermoleculares del sistema. El proyecto consistió en realizar un análisis QTAIM de los complejos de interés presentes en la reacción para determinar las propiedades químicas y topológicas de estos cuando se incluye la región MM y cuando no es incluida. Se evaluó el efecto de la región MM sobre las cargas atómicas, las energías de la región QM y los enlaces de hidrógenos más relevantes para la reacción. La inclusión de la región MM afecta las cargas atómicas de los átomos de hidrógeno ubicados en la frontera con la región QM e incrementa la carga de la histidina catalítica 224. Además, el efecto de la inclusión de la región MM sobre los perfiles de energía QM produce cambios menores que 8 kcal/mol, mientras que, la inclusión de esta región no afecta las propiedades topológicas de los enlaces de hidrógeno relevantes en el proceso catalítico.
dc.description.abstractenglish	This work continued with the study of the reaction mechanism of acetylation catalyzed by Candida antarctica lipase B, which allows the kinetic resolution of the enantiomers of (R, S)-propranolol, a compound of pharmaceutical interest. For this, a computational study was carried out using theoretical methods such as combined calculations of quantum mechanics (QM) and molecular mechanics (MM), which allow dividing the active region of the protein into a QM region and a MM region; and the quantum theory of atoms in molecules (QTAIM), which allows evaluating the intermolecular interactions of the system. The project consisted of performing a QTAIM analysis of the complexes of interest present in the reaction to determine their chemical and topological properties when the MM region is included and when it is not. The effect of the MM region on the atomic charges, the energies of the QM region, and the most relevant hydrogen bonds for the reaction were evaluated. The inclusion of the MM region affects the atomic charges of the hydrogen atoms located on the border with the QM region and increases the charge of the catalytic histidine 224. In addition, the effect of the inclusion of the MM region on the QM energy profiles produces changes of less than 8 kcal/mol, while the inclusion of this region does not affect the topological properties of the relevant hydrogen bonds in the catalytic process.
dc.description.degreelevel	Pregrado
dc.description.degreename	Químico
dc.format.mimetype	application/pdf
dc.identifier.instname	Universidad Industrial de Santander
dc.identifier.reponame	Universidad Industrial de Santander
dc.identifier.repourl	https://noesis.uis.edu.co
dc.identifier.uri	https://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/10011
dc.language.iso	spa
dc.publisher	Universidad Industrial de Santander
dc.publisher.faculty	Facultad de Ciencias
dc.publisher.program	Química
dc.publisher.school	Escuela de Química
dc.rights	info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.accessrights	info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.coar	http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.creativecommons	Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)
dc.rights.license	Attribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)
dc.rights.uri	http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.subject	región MM
dc.subject	QTAIM
dc.subject	enlaces de hidrógeno
dc.subject	CalB
dc.subject.keyword	MM region
dc.subject.keyword	QTAIM
dc.subject.keyword	hydrogen bonds
dc.subject.keyword	CalB
dc.title	Efecto electrostático de la inclusión de la región MM de la proteína sobre las interacciones entre (R,S)-propranolol y lipasa B de Candida antarctica
dc.title.english	Electrostatic effect of the inclusion of the MM region of the protein on the interactions between (R,S)-propranolol and Candida antarctica lipase B
dc.type.coar	http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.hasversion	http://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
dc.type.local	Tesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado
dspace.entity.type