Efecto electrostático de la inclusión de la región MM de la proteína sobre las interacciones entre (R,S)-propranolol y lipasa B de Candida antarctica

dc.contributor.advisorDoerr, Markus Hans Oliver
dc.contributor.advisorRincón Daza, David Alejandro
dc.contributor.authorAmado Tavera, Luisa Fernanda
dc.contributor.evaluatorBlanco Tirado, Cristian
dc.contributor.evaluatorPérez Torres, Jhon Fredy
dc.date.accessioned2022-04-19T16:41:39Z
dc.date.available2022-04-19T16:41:39Z
dc.date.created2022-03-30
dc.date.issued2022-03-30
dc.description.abstractEn este trabajo se continuó con el estudio del mecanismo de reacción de la acetilación catalizada por lipasa B de Candida antárctica, la cual permite la resolución cinética de los enantiómeros del (R,S)-propranolol, un compuesto de interés farmacéutico. Para esto, se realizó un estudio computacional empleando métodos teóricos como: cálculos combinados de mecánica cuántica (QM) y mecánica molecular (MM), que permiten dividir la región activa de la proteína en una región QM y una región MM; y la teoría cuántica de átomos en moléculas (QTAIM), que permite evaluar las interacciones intermoleculares del sistema. El proyecto consistió en realizar un análisis QTAIM de los complejos de interés presentes en la reacción para determinar las propiedades químicas y topológicas de estos cuando se incluye la región MM y cuando no es incluida. Se evaluó el efecto de la región MM sobre las cargas atómicas, las energías de la región QM y los enlaces de hidrógenos más relevantes para la reacción. La inclusión de la región MM afecta las cargas atómicas de los átomos de hidrógeno ubicados en la frontera con la región QM e incrementa la carga de la histidina catalítica 224. Además, el efecto de la inclusión de la región MM sobre los perfiles de energía QM produce cambios menores que 8 kcal/mol, mientras que, la inclusión de esta región no afecta las propiedades topológicas de los enlaces de hidrógeno relevantes en el proceso catalítico.
dc.description.abstractenglishThis work continued with the study of the reaction mechanism of acetylation catalyzed by Candida antarctica lipase B, which allows the kinetic resolution of the enantiomers of (R, S)-propranolol, a compound of pharmaceutical interest. For this, a computational study was carried out using theoretical methods such as combined calculations of quantum mechanics (QM) and molecular mechanics (MM), which allow dividing the active region of the protein into a QM region and a MM region; and the quantum theory of atoms in molecules (QTAIM), which allows evaluating the intermolecular interactions of the system. The project consisted of performing a QTAIM analysis of the complexes of interest present in the reaction to determine their chemical and topological properties when the MM region is included and when it is not. The effect of the MM region on the atomic charges, the energies of the QM region, and the most relevant hydrogen bonds for the reaction were evaluated. The inclusion of the MM region affects the atomic charges of the hydrogen atoms located on the border with the QM region and increases the charge of the catalytic histidine 224. In addition, the effect of the inclusion of the MM region on the QM energy profiles produces changes of less than 8 kcal/mol, while the inclusion of this region does not affect the topological properties of the relevant hydrogen bonds in the catalytic process.
dc.description.degreelevelPregrado
dc.description.degreenameQuímico
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.identifier.instnameUniversidad Industrial de Santander
dc.identifier.reponameUniversidad Industrial de Santander
dc.identifier.repourlhttps://noesis.uis.edu.co
dc.identifier.urihttps://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/10011
dc.language.isospa
dc.publisherUniversidad Industrial de Santander
dc.publisher.facultyFacultad de Ciencias
dc.publisher.programQuímica
dc.publisher.schoolEscuela de Química
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.coarhttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.creativecommonsAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)
dc.rights.licenseAttribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.subjectregión MM
dc.subjectQTAIM
dc.subjectenlaces de hidrógeno
dc.subjectCalB
dc.subject.keywordMM region
dc.subject.keywordQTAIM
dc.subject.keywordhydrogen bonds
dc.subject.keywordCalB
dc.titleEfecto electrostático de la inclusión de la región MM de la proteína sobre las interacciones entre (R,S)-propranolol y lipasa B de Candida antarctica
dc.title.englishElectrostatic effect of the inclusion of the MM region of the protein on the interactions between (R,S)-propranolol and Candida antarctica lipase B
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.hasversionhttp://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
dc.type.localTesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado
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