Efecto electrostático de la inclusión de la región MM de la proteína sobre las interacciones entre (R,S)-propranolol y lipasa B de Candida antarctica

dc.contributor.advisor Doerr, Markus Hans Oliver
dc.contributor.advisor Rincón Daza, David Alejandro
dc.contributor.author Amado Tavera, Luisa Fernanda
dc.contributor.evaluator Blanco Tirado, Cristian
dc.contributor.evaluator Pérez Torres, Jhon Fredy
dc.date.accessioned 2022-04-19T16:41:39Z
dc.date.available 2022-04-19T16:41:39Z
dc.date.created 2022-03-30
dc.date.issued 2022-03-30
dc.description.abstract En este trabajo se continuó con el estudio del mecanismo de reacción de la acetilación catalizada por lipasa B de Candida antárctica, la cual permite la resolución cinética de los enantiómeros del (R,S)-propranolol, un compuesto de interés farmacéutico. Para esto, se realizó un estudio computacional empleando métodos teóricos como: cálculos combinados de mecánica cuántica (QM) y mecánica molecular (MM), que permiten dividir la región activa de la proteína en una región QM y una región MM; y la teoría cuántica de átomos en moléculas (QTAIM), que permite evaluar las interacciones intermoleculares del sistema. El proyecto consistió en realizar un análisis QTAIM de los complejos de interés presentes en la reacción para determinar las propiedades químicas y topológicas de estos cuando se incluye la región MM y cuando no es incluida. Se evaluó el efecto de la región MM sobre las cargas atómicas, las energías de la región QM y los enlaces de hidrógenos más relevantes para la reacción. La inclusión de la región MM afecta las cargas atómicas de los átomos de hidrógeno ubicados en la frontera con la región QM e incrementa la carga de la histidina catalítica 224. Además, el efecto de la inclusión de la región MM sobre los perfiles de energía QM produce cambios menores que 8 kcal/mol, mientras que, la inclusión de esta región no afecta las propiedades topológicas de los enlaces de hidrógeno relevantes en el proceso catalítico.
dc.description.abstractenglish This work continued with the study of the reaction mechanism of acetylation catalyzed by Candida antarctica lipase B, which allows the kinetic resolution of the enantiomers of (R, S)-propranolol, a compound of pharmaceutical interest. For this, a computational study was carried out using theoretical methods such as combined calculations of quantum mechanics (QM) and molecular mechanics (MM), which allow dividing the active region of the protein into a QM region and a MM region; and the quantum theory of atoms in molecules (QTAIM), which allows evaluating the intermolecular interactions of the system. The project consisted of performing a QTAIM analysis of the complexes of interest present in the reaction to determine their chemical and topological properties when the MM region is included and when it is not. The effect of the MM region on the atomic charges, the energies of the QM region, and the most relevant hydrogen bonds for the reaction were evaluated. The inclusion of the MM region affects the atomic charges of the hydrogen atoms located on the border with the QM region and increases the charge of the catalytic histidine 224. In addition, the effect of the inclusion of the MM region on the QM energy profiles produces changes of less than 8 kcal/mol, while the inclusion of this region does not affect the topological properties of the relevant hydrogen bonds in the catalytic process.
dc.description.degreelevel Pregrado
dc.description.degreename Químico
dc.format.mimetype application/pdf
dc.identifier.instname Universidad Industrial de Santander
dc.identifier.reponame Universidad Industrial de Santander
dc.identifier.repourl https://noesis.uis.edu.co
dc.identifier.uri https://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/10011
dc.language.iso spa
dc.publisher Universidad Industrial de Santander
dc.publisher.faculty Facultad de Ciencias
dc.publisher.program Química
dc.publisher.school Escuela de Química
dc.rights http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.rights.license Atribución-NoComercial-SinDerivadas 2.5 Colombia (CC BY-NC-ND 2.5 CO)
dc.rights.uri http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/co/
dc.subject región MM
dc.subject QTAIM
dc.subject enlaces de hidrógeno
dc.subject CalB
dc.subject.keyword MM region
dc.subject.keyword QTAIM
dc.subject.keyword hydrogen bonds
dc.subject.keyword CalB
dc.title Efecto electrostático de la inclusión de la región MM de la proteína sobre las interacciones entre (R,S)-propranolol y lipasa B de Candida antarctica
dc.title.english Electrostatic effect of the inclusion of the MM region of the protein on the interactions between (R,S)-propranolol and Candida antarctica lipase B
dc.type.coar http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.hasversion http://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
dc.type.local Tesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado
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