Análisis de la diversidad genética a partir de secuencias del gen ND2 de euphonia laniirostris en tres localidades de Santander, Colombia

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dc.contributor.advisorRondon Gonzalez, Fernando
dc.contributor.authorGarcia Barrios, Bianeth
dc.date.accessioned2024-03-03T23:57:39Z
dc.date.available2018
dc.date.available2024-03-03T23:57:39Z
dc.date.created2018
dc.date.issued2018
dc.description.abstractEuphonia laniirostris es una especie de ave de amplia distribución y menor preocupación según la IUCN, con diferentes estudios relacionados con su biología, pero ninguno con su diversidad genética y por ende con su conservación; motivada, por lo general, por el descenso en el tamaño poblacional. Pocos estudios se centran en especies cosmopolitas, desconociendo sus dinámicas poblacionales y grado de amenaza, los cuales a futuro pueden ser importantes en la implementación de programas de conservación que involucren estas especies. Con base en lo anterior, el objetivo del presente trabajo fue estimar la diversidad y el grado de estructura genética de E. laniirostris a partir del uso de secuencias del gen ND2 del ADNmt. Para esto se amplificó y secuenció el gen ND2 en 39 muestras de E. laniirostris recolectadas en tres localidades del departamento de Santander, Colombia. Las secuencias fueron editadas con BioEdit v.7.0.5 (1999) y ensambladas en Mega v.7.0. (2016). Distintos parámetros genéticos poblacionales y de estructura genética fueron estimados con Arlequin v.3.5 (2010). Producto de esta investigación se caracterizaron 36 haplotipos en E. laniirostris entre las posiciones 17 a 964 del gen ND2, entre las que se encontraron 21,4% de sitios polimórficos. San Benito presentó mayor número de haplotipos (15), La Hacienda el Roble mayor diversidad nucleotídica 236) y menor flujo génico (Nm=26,295 Roble-Diviso y Nm=13,180 Roble-San Benito). Adicionalmente, se encontró poca diferenciación genética pero altamente significativa entre las localidades consideradas (=0,02909, p=0,00587), 9/947 sitios polimórficos estarían contribuyendo a la poca diferenciación. A partir de las secuencias ND2 analizadas en E. laniirostris se concluye que esta especie de jilguero constituye una metapoblación, con ligera diferenciación genética en las localidades estudiadas, debido a la falta de haplotipos compartidos, distintos sitios privados y nueve sitios polimórficos que aportan a la misma. Además, el presente estudio brinda evidencia que soporta la importancia de conservar los bosques asociados a cafetales de la Hacienda El Roble, dado que en estos se detectó el mayor número de haplotipos distintivos de esta especie de jilguero aparentemente cosmopolita.
dc.description.abstractenglishEuphonia laniirostris is a species of bird of wide distribution and less concern according to the IUCN, has different studies of its biology, but none of genetic diversity. Few studies focus on cosmopolitan species, ignoring their population dynamics and degree of threat, which in the future may be important in the implementation of conservation programs involving these species. On that basis, the objective consisted in estimating the diversity and the degree of genetic structure of E. Laniirostris from sequences present in MtDNA. For this amplified and sequenced the gene ND2 in 39 samples collected in three locations in the Department of Santander, Colombia. The sequences were edited with BioEdit v. 7.0.5 and assembled in Mega v. 7.0. Different population genetic parameters and genetic structure were estimated with Arlequin v. 3.5. 36 haplotypes were typified between the positions 17 to 964 of the ND2 gene, detecting 21.4% of polymorphic sites among them. San Benito presented a greater number of haplotypes (15), while the Hacienda El Roble greater diversity nucleotide ( = 0,0236) and lower gene flow (Nm=26,295 Roble-Diviso y Nm=13,180 Roble-San Benito). In addition, little genetic differentiation was found but highly significant among the locations considered ( = 0,02909, p = 0,00587), where 9 polymorphic sites would be contributing to this differentiation. From the sequences ND2 analyzed in E. laniirostris concludes that this goldfinch species constitutes a metapopulation, with light genetic differentiation in the studied localities, due to the absence of shared haplotipos, different private places and nine polymorphic sites that contribute the same one. In addition, the present study provides evidence that supports the importance of preserving the forests associated with coffee plantation of the Hacienda El Roble, since this locality detected the largest number of distinctive haplotypes of this species of goldfinch apparently cosmopolitan.
dc.description.degreelevelPregrado
dc.description.degreenameBiólogo
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.identifier.instnameUniversidad Industrial de Santander
dc.identifier.reponameUniversidad Industrial de Santander
dc.identifier.repourlhttps://noesis.uis.edu.co
dc.identifier.urihttps://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/37897
dc.language.isospa
dc.publisherUniversidad Industrial de Santander
dc.publisher.facultyFacultad de Ciencias
dc.publisher.programBiología
dc.publisher.schoolEscuela de Biología
dc.rightshttp://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.creativecommonsAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)
dc.rights.licenseAttribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0
dc.subjectDiversidad Genética
dc.subjectAdnmt
dc.subjectHaplotipos.
dc.subject.keywordGenetic Diversity
dc.subject.keywordMtdna
dc.subject.keywordHaplotypes.
dc.titleAnálisis de la diversidad genética a partir de secuencias del gen ND2 de euphonia laniirostris en tres localidades de Santander, Colombia
dc.title.englishAnalysis of genetic diversity from sequences of the gene nd2 of euphonia laniirostris in three locations in santander, colombia*
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
dc.type.hasversionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.localTesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado
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