Genotipificación de cacao criollo colombiano usando marcadores de ADN tipo microsatélites ssr

Simple item page
dc.contributor.advisorCano Calle, Herminsul de Jesús
dc.contributor.advisorCoronado, Roberto
dc.contributor.authorHernández García, Jessika Andrea
dc.date.accessioned2024-03-03T20:08:05Z
dc.date.available2013
dc.date.available2024-03-03T20:08:05Z
dc.date.created2013
dc.date.issued2013
dc.description.abstractLos cacaos criollos son una de las variedades de Theobroma cacao que proporcionan chocolates finos altamente cotizados en la industria. En Colombia el cacao criollo está en proceso de extinción, debido principalmente a la introducción sucesiva de germoplasma cuyos descendientes híbridos presentan una mayor resistencia a plagas y enfermedades. La caracterización actual de los cacaos criollos colombianos se hace utilizando metodologías tradicionales basadas en la combinación de aspectos morfoagronómicos que han sido cuestionados por basarse en características influenciadas por factores externos que pueden confundir la identificación de esta variedad. En el presente estudio se realizó la genotipificación de 51 accesiones de Cacao Criollo recolectadas de 3 regiones diferentes de Colombia (Guajira, Cesar, Magdalena) más una muestra de cacao forastero y otra de cacao trinitario conservadas en el banco nacional de germoplasma en la estación experimental la suiza de la Corporación Colombiana de Investigaciones Agropecuarias CORPOICA. Se usaron 14 microsatélites (SSR) empleando las técnicas de PCR y electroforesis capilar. Se evaluó la variabilidad genética interpoblacional mediante análisis estadísticos. Los resultados obtenidos concluyen que las poblaciones de cacao criollo de los departamentos de Magdalena, Cesar y Guajira están estrechamente relacionados en su componente genético, mediante el cálculo de los índices de Wright se encontró que la población es altamente endogamica y presenta valores moderados de estructura genética. De los 14 sistemas SSR empleados, los microsatelitesMIcCIR60, MIcCIR12, MIcCIR37, MIcCIR8 y MIcCIR33 confirmaron su informatividad y utilidad para la realización de estudios relacionados con cacao criollo colombiano, según los estándares internacionales, finalmente el patrón molecular de cada clon o individuo obtenido en este estudio sirve como base para establecer una metodología de certificación genotípica de árboles fuente de material de siembra como apoyo a la conformación de jardines clónales.
dc.description.abstractenglishThe criollo is one of the Theobroma cacao varieties of fine chocolates that highly valued in the industry. Criollo cacao in Colombia is in the process of extinction, mainly due to the successive introduction of germplasm whose hybrid offspring are more resistant to pests and diseases. The actual Characterization of Colombian criollocacao is done by using traditional methods based on the combination of morpho-agronomic aspects that have been questioned based on characteristics influenced by external factors that may confound the identification of this variety.The present study was performed on 51 accessións of criollo cacao collected from 3 different regións of Colombia (Guajira, Cesar, Magdalena) plus a sample of trinitarian cocoa and another of forastero cocoa preserved in national germplasm bank at the experimental station "La suiza" affiliated to the Colombian Corporation of Agricultural Research CORPOICA. We used 14 microsatellite (SSR) using the PCR and capillary electrophoresis. Genetic variability was evaluated by statistical analysis interpopulational. The results conclude that criollo cacao populations from the departments of Magdalena, Cesar and Guajira are closely related in their genetic composition, by calculating indices Wright it is found that the population is highly inbreeding and presents moderate values of genetic structure. Out of the 14 SSR microsatellites used, the MIcCIR60, MIcCIR12, MIcCIR37, MIcCIR33 MIcCIR8 confirmed their informativenes and usefulness in studies related to Colombian criollo cocoa, by international standards, finally the molecular pattern of each clone obtained in This study serves as a basis for establishing a certification methodology genotypic source tree planting material to support the formation of clonal gardens.Investigation Work.Faculty of Sciencies, Shool of Chemistry. Program of Chemistry. Dir. Herminsul de Jesus Cano. Calle PhD. Roberto Coronado, Ing.
dc.description.degreelevelMaestría
dc.description.degreenameMagíster en Química
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.identifier.instnameUniversidad Industrial de Santander
dc.identifier.reponameUniversidad Industrial de Santander
dc.identifier.repourlhttps://noesis.uis.edu.co
dc.identifier.urihttps://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/29168
dc.language.isospa
dc.publisherUniversidad Industrial de Santander
dc.publisher.facultyFacultad de Ciencias
dc.publisher.programMaestría en Química
dc.publisher.schoolEscuela de Química
dc.rightshttp://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.creativecommonsAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)
dc.rights.licenseAttribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0
dc.subjectTheobroma Cacao
dc.subjectMarcadores Moleculares
dc.subjectMicrosatélites
dc.subjectAnálisis De Poblaciones
dc.subjectVariabilidad Genética.
dc.subject.keywordTheobroma Cacao
dc.subject.keywordMolecular Markers
dc.subject.keywordMicrosatellites
dc.subject.keywordPopulation Analysis
dc.subject.keywordGenetic Variability.
dc.titleGenotipificación de cacao criollo colombiano usando marcadores de ADN tipo microsatélites ssr
dc.title.englishCriollo cocoa genotyping Colombian dna markers using type microsatellite (ssr)
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
dc.type.hasversionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_bdcc
dc.type.localTesis/Trabajo de grado - Monografía - Maestria
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
No Thumbnail Available
Name:
Carta de autorización.pdf
Size:
249.2 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Download
No Thumbnail Available
Name:
Documento.pdf
Size:
1.95 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Download
No Thumbnail Available
Name:
Nota de proyecto.pdf
Size:
304.19 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Download
Collections
Maestría en Química