Identificación polifásica de una colección bacteriana del género bacillus obtenida del subsuelo en zonas carboníferas de Colombia

Simple item page
dc.contributor.advisorFuentes Lorenzo, Jorge Luis
dc.contributor.authorRivera Giraldo, Catalina Lucero
dc.date.accessioned2024-03-03T20:46:47Z
dc.date.available2014
dc.date.available2024-03-03T20:46:47Z
dc.date.created2014
dc.date.issued2014
dc.description.abstractEn este estudio se caracterizaron e identificaron 102 aislados de una colección bacteriana del género Bacillus obtenida del subsuelo profundo de zonas carboníferas de Colombia (Guajira y Cucunubá) mediante taxonomía polifásica. Como descriptores genotípicos se usaron el análisis de homología de secuencias del gen ARNr 16S y un Análisis de Restricción del ADN Ribosomal Amplificado (ARDRA) con las enzimas AluI, DdeI, HaeIII, TaqI y XbaI; y como descriptores fenotípicos se utilizaron 12 pruebas morfológicas, fisiológicas y metabólicas. El análisis de homología de secuencias del gen ARNr 16S resultó poco efectivo en la distinción de especies dentro de la colección. Por el contrario, los perfiles de bandas del ARDRA obtenidos con las enzimas AluI y DdeI resultaron los más informativos permitiendo identificar la mayoría de las especies encontradas en la colección; así como revelar la existencia de un posible híbrido entre las especies B. subtilis y B. licheniformis. De conjunto, los 12 descriptores fenotípicos y los 5 descriptores genotípicos ARDRA se usaron para construir una clave interactiva que permitió identificar de forma rápida y precisa siete especies de Bacillus altamente relacionadas: B. cereus, B. thuringiensis, B. licheniformis, B. subtilis, B. safensis, B, altitudinis y B. megaterium. En el trabajo se discute la utilidad de combinar métodos fenotípicos y genotípicos para la identificación de especies altamente relacionadas del género Bacillus que habitan el subsuelo profundo de zonas carboníferas de Colombia.
dc.description.abstractenglishIn this study we used a polyphasic taxonomy test to characterize and identify 102 isolated from bacterial collection of the genus Bacillus obtained from two deep subsoil carboniferous zones in Colombia (Guajira, department and Cucunubá, municipality). We used genotypic and phenotypic descriptors; for the first descriptor we evaluated the 16S rRNA gene sequences homology and an Amplified Ribosomal DNA Restriction Analysis (ARDRA) using the following enzymes Alul, Ddel, Haelll, Taql and Xbal. For the second descriptor we used 12 morphologic, physiologic and metabolic tests. We found that the 16S rRNA gene sequences homology was not sufficient in the distinction among the bacteria species from the collection. Nevertheless, the Alul and Ddel ARDRA profile bands allowed us not only a better taxonomic identification but the possible existence of and hybrid between B. subtilis and B. licheniformis. We also developed an interactive taxonomic key using the 12 phenotypic descriptors and 5 ARDRA genotypic descriptors; this taxonomic key allows precise and easy identification of 7 Bacillus species highly related such as: B. cereus, B. thuringiensis, B. licheniformis, B. subtilis, B. safensis, B, altitudinis y B. megaterium. Here we discuss the importance and usefulness of implement combine phenotypic and genotypic methods in the identification of species highly related of the Bacillus genus that inhabit subsurface deep in carboniferous zones of Colombia.
dc.description.degreelevelPregrado
dc.description.degreenameBiólogo
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.identifier.instnameUniversidad Industrial de Santander
dc.identifier.reponameUniversidad Industrial de Santander
dc.identifier.repourlhttps://noesis.uis.edu.co
dc.identifier.urihttps://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/30980
dc.language.isospa
dc.publisherUniversidad Industrial de Santander
dc.publisher.facultyFacultad de Ciencias
dc.publisher.programBiología
dc.publisher.schoolEscuela de Biología
dc.rightshttp://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.creativecommonsAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)
dc.rights.licenseAttribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0
dc.subjectBacillus
dc.subjectGen Arnr 16S
dc.subjectArdra
dc.subjectTaxonomía Polifásica.
dc.subject.keywordBacillus
dc.subject.keyword16S Rrna Gene
dc.subject.keywordArdra
dc.subject.keywordPolyphasic Taxonomy.
dc.titleIdentificación polifásica de una colección bacteriana del género bacillus obtenida del subsuelo en zonas carboníferas de Colombia
dc.title.englishPolyphasic identification of a bacterial collection of the genus bacillus obtained from subsurface deep in carboniferous zones of Colombia
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
dc.type.hasversionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.localTesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado
Files
Original bundle
Now showing 1 - 3 of 3
No Thumbnail Available
Name:
Carta de autorización.pdf
Size:
100.52 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Download
No Thumbnail Available
Name:
Documento.pdf
Size:
3.19 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Download
No Thumbnail Available
Name:
Nota de proyecto.pdf
Size:
257.74 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Download
Collections
Biología