Tic110, involved in chloroplast protein translocation contains highly divergent heat like repeated motifs, as revealed by hydrophobic cluster analysis

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dc.contributor.advisorHernandez Torres, Jorge
dc.contributor.advisorChomilier, Jacques
dc.contributor.authorJaimes Becerra, Adrián José
dc.date.accessioned2024-03-03T17:35:12Z
dc.date.available2009
dc.date.available2024-03-03T17:35:12Z
dc.date.created2009
dc.date.issued2009
dc.description.abstractLa teoría endosimbiotica admite que los plastidios se originaron a partir de una bacteria fotosintética tragada por una célula eucariótica primitiva. En consecuencia, el genoma del cloroplasto permanece como una reminiscencia de este evento ancestral, aunque reducido en tamaño y número de genes. La mayoría de los genes en el plastidio fueron transferidos al genoma nuclear de la célula huésped y desde entonces, estos son codificados en el núcleo. Así, las proteínas del cloroplasto son sintetizadas en citósol con extensiones N-terminales llamadas péptidos transito y la maquinaria de importe fue requerida que apareciera en la evolución para transferir estas proteínas al estroma. Hasta ahora, dos complejos de proteínas han sido encontrado que median el proceso de importe: los translocones de la envoltura de la membrana Toc (externa) y Tic (interna). El origen evolutivo de muchas de las proteínas de los complejos Toc y tic han sido establecidos, pero esto no es aún el caso para la subunidad Tic110. Tic110 enlaza péptidos señal y sirve como un andamio molecular para el reclutamiento de componentes estromales. En este estudio después de un análisis de agregados hidrofóbicos (HCA) y reconocimiento de pliegue de las proteínas, nosotros concluimos que Tic110 esta compuesto de un seria de motifs repetidos relacionados a las repeticiones HEAT. La explicación para la presencia de tales repeticiones en Tic110 y su función más probable en el proceso de importe del cloroplasto es discutida.
dc.description.abstractenglishThe endosymbiotic theory admits that plastids originated from a photosynthetic bacterium engulfed by a primitive eukaryotic cell. In consequence, the chloroplast genome remains as reminiscences of this ancestral event, although reduced in size and number of genes. Most part of the plastid genes were transferred to the host cell nuclear genome and since then, they are nuclear-encoded. Thus, chloroplast proteins are synthesized in the cytosol as precursors with Nterminal extensions called transit peptides and import machinery was required to appear in evolution to transfer those proteins to the stroma. Until the present time, two protein complexes have been found to mediate the import process: the Toc (outer) and Tic (inner) envelope membrane translocons. The evolutionary origin of many of Tic and Toc proteins have been established, but this is not yet the case for the Tic110 subunit. Tic110 binds signal peptides and serves as a scaffold for the recruitment of stromal components. In this study, after a keen analysis of hydrophobic clusters (HCA) and protein fold recognition, we concluded that Tic110 is composed of a series of repeated motifs related to HEATrepeats. The explanation for the presence of such repeats in Tic110 and its probable function in the chloroplast import process is discussed.
dc.description.degreelevelPregrado
dc.description.degreenameBiólogo
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.identifier.instnameUniversidad Industrial de Santander
dc.identifier.reponameUniversidad Industrial de Santander
dc.identifier.repourlhttps://noesis.uis.edu.co
dc.identifier.urihttps://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/22601
dc.language.isospa
dc.publisherUniversidad Industrial de Santander
dc.publisher.facultyFacultad de Ciencias
dc.publisher.programBiología
dc.publisher.schoolEscuela de Biología
dc.rightshttp://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.creativecommonsAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)
dc.rights.licenseAttribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0
dc.subjectTic110
dc.subjectHCA
dc.subjectRepetición HEAT
dc.subjectTranslocon del cloroplasto
dc.subjectTransporte de membrana.
dc.subject.keywordTic110; HCA; HEAT-repeat; chloroplast translocon; membrane transport.
dc.titleTic110, involved in chloroplast protein translocation contains highly divergent heat like repeated motifs, as revealed by hydrophobic cluster analysis
dc.title.englishTic110, involved in chloroplast protein translocation, contains highly divergent HEAT-like repeated motifs, as revealed by Hydrophobic Cluster Analysis.
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
dc.type.hasversionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.localTesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado
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