Dinámica espacio-temporal del virus del dengue en Santander, un área endémica de Colombia
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Date
2017
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Publisher
Universidad Industrial de Santander
Abstract
Conocer la dinámica espacio temporal del Virus Dengue (DENV) es indispensable para comprender el patrón epidemiológico del dengue en Colombia. El objetivo de este trabajo fue inferir la diversidad genética, evolución, fitogeografía del virus del dengue en AMB- Santander y relacionar cambios en la diversidad genética con el patrón de prevalencia en Santander. Se incluyeron virus de 13 años (1998 2015). Se obtuvieron 76 secuencias del gen E y junto con secuencias representativas descargadas de GenBank. Se reconstruyó la historia evolutiva y de dispersión usando modelos coalescentes y filogeográficos discretos. Se estimó la diversidad genética de la población viral local y se relacionó con el patrón de prevalencia. Con cada serotipo han ocurrido varias introducciones de cepas pero solo una estableció transmisión. La frontera Colombo Venezolana y la región del Caribe se identificaron como orígenes geográficos de los cuatro serotipos. De DENV-1, -2, y -4 se recuperaron un linaje de un único genotipo que estableció transmisión, los cuales se introdujeron con mayor probabilidad en los años 80 y 90. La selección purificadora (Tajima < 1.0; dN/dS < 1.0) ha actuado sobre las cuatro poblaciones a tasas de evolución esperadas (1x10-3 9x10-4 s/s/a) y solo en DENV-4 se evidenció selección positiva en los codones 64 y 309 del gen. DENV-1 presentó incremento del tamaño de la población (Ne) y esto correlacionó (r-Sperman = 0.73, p < 0.05) con prevalencia. La introducción de otro linaje DENV-3 incremento Ne pero no se correlacionó con incremento de la prevalencia. DENV-2 y DENV-4 presento un leve incremento de Ne pero sin correlación con prevalencia del virus. El estudio muestra un constante intercambio de virus y una a alta y sostenida transmisión local en AMB- Santander de 1998 al 2015 por lo que es necesario una continua y efectiva vigilancia del DENV siendo critica para el control del dengue. i
Description
Keywords
Denv, Filogenia, Filodinamica, Diversidad Genética