Análisis de homología estructural de las regiones carboxilo terminal de los criptocromos en diferentes especies

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dc.contributor.advisorDaza Espinosa, Martha Cecilia
dc.contributor.authorOsorio Isaza, Carlos Arturo
dc.date.accessioned2024-03-03T17:04:15Z
dc.date.available2008
dc.date.available2024-03-03T17:04:15Z
dc.date.created2008
dc.date.issued2008
dc.description.abstractLos criptocromos son proteínas fotorreceptoras de luz azul que se encuentran en todos los reinos de la naturaleza y son componentes esenciales de los ritmos circadianos. Comparten homología de estructura primaria con las fotoliasas (proteínas reparadoras de ADN) y conforman la familia de proteínas reparadoras de ADN/fotorreceptores de luz azul. Los criptocromos poseen una extensión carboxilo terminal adicional que no está presente en las fotoliasas, varía en longitud de aminoácidos según la especie, donde las plantas poseen la extensión más larga y los insectos la más corta. Estas regiones carboxilo terminal no presentan homología de estructura primaria entre ellas y no se conoce organización estructural secundaria o superior de las mismas, a excepción de tres de ellas donde se utilizaron métodos de predicción basados en alineamientos unidimensionales. En este trabajo se seleccionaron 76 secuencias de criptocromos, a las cuales se determinaron su extensión carboxilo terminal. Luego por medio del principio de homología secundaria de HCA se clasificaron las regiones con similitud estructural. A continuación se le hallaron sus elementos de estructura secundaria y por último, se hizo un modelamiento de la homología detectada. Como resultado se clasificaron las regiones carboxilo terminal en 14 tipos diferentes de ordenamiento estructural por HCA que al ser comparados con otros autores muestran diferencias en el arreglo conformacional secundario. En el modelamiento de la homología solo pequeños fragmentos de las regiones sometidas a predicción fueron obtenidas, regiones que no muestran relación funcional detectada hasta el momento.
dc.description.abstractenglishThe cryptochromes are photoreceptor proteins of blue light that they find in all the kingdoms of the nature and are essential components of the circadian rhythm. They share homology of primary structure with the photolyases (proteins repairs of DNA) and shape the family of proteins repairs of ADN/photoreceptors of blue light. The cryptochromes possess an extension carboxy terminal additional that is not present in the photolyases, it changes in length of amino acids according to the species, where the plants possess the longest extension and the insects the shortest. These regions carboxy terminal do not present homology of primary structure between them and there is not known structural secondary or top organization of the same ones, with the exception of three of them where there were in use methods of prediction based on alignments one-dimensional. In this work 76 sequences were selected of cryptochromes, to which they determined your extension carboxy terminal. Based on of the principle of homology secondary of HCA the regions qualified with structural similarity. Later he was located by your elements of secondary structure and finally, he became a homology modeling detected. As result the regions qualified carboxy terminal in 14 different types from structural classification for HCA that on have been compared by other authors show differences in the arrangement conformational secondary. In the homology modeling alone small fragments of the regions submitted to prediction were obtained, regions that do not show functional relation detected up to the moment.
dc.description.degreelevelPregrado
dc.description.degreenameQuímico
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.identifier.instnameUniversidad Industrial de Santander
dc.identifier.reponameUniversidad Industrial de Santander
dc.identifier.repourlhttps://noesis.uis.edu.co
dc.identifier.urihttps://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/21124
dc.language.isospa
dc.publisherUniversidad Industrial de Santander
dc.publisher.facultyFacultad de Ciencias
dc.publisher.programQuímica
dc.publisher.schoolEscuela de Química
dc.rightshttp://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.creativecommonsAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)
dc.rights.licenseAttribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0
dc.subjectCriptocromo
dc.subjectRegión carboxilo terminal
dc.subjectHomología estructural
dc.subjectEstructura secundaria
dc.subjectHCA
dc.subjectmodelamiento de homología.
dc.subject.keywordCryptochrome
dc.subject.keywordCarboxy terminal region
dc.subject.keywordStructural homology
dc.subject.keywordSecondary structure
dc.subject.keywordHCA
dc.subject.keywordHomology modelling.
dc.titleAnálisis de homología estructural de las regiones carboxilo terminal de los criptocromos en diferentes especies
dc.title.englishAnalysis of structural homology of the regions carboxy terminal of the cryptochromes in different species
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
dc.type.hasversionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.localTesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado
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