Identificación de metabolitos secundarios de plantas como posibles agentes antivirales contra el virus del dengue teniendo como diana farmacológica la proteína NS2B/NS3pro

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dc.contributor.advisorMéndez Sánchez, Stelia Carolina
dc.contributor.advisorVesga Gamboa, Luis Carlos
dc.contributor.authorCárdenas Florez, Yilber Niyer
dc.contributor.evaluatorHidalgo Bucheli, William Fernando
dc.contributor.evaluatorMartinez Morales, Jairo Rene
dc.date.accessioned2023-05-29T21:27:17Z
dc.date.available2023-05-29T21:27:17Z
dc.date.created2023-05-28
dc.date.issued2023-05-28
dc.description.abstractEl dengue es una enfermedad tropical causado por la infección del virus del dengue (DENV). Se estima que anualmente se producen cerca de 390 millones de infecciones. A pesar de los esfuerzos para el desarrollo de compuestos antivirales contra el DENV, aún no existe un tratamiento antiviral o vacuna efectiva. Una de las dianas farmacológicas establecidas para el desarrollo de fármacos es el complejo proteico NS2B/NS3pro debido a su rol importante durante el proceso del ciclo viral. En la presente investigación, empleamos técnicas computacionales, tales como docking molecular y dinámica molecular, con el fin de evaluar la estabilidad de metabolitos secundarios de plantas al interaccionar con el complejo proteico NS2B/NS3pro para postularlos como posibles inhibidores. A partir de lo anterior, se determinó que la pelargonidina 3-arabinósido presenta interacciones tipo puente de hidrógeno con residuos de la triada catalítica His-51, Asp-75 y Ser-135, al igual que residuos claves para el procesamiento y reconcomiendo del sustrato tales como la Gly-133 y Gly-153. Adicionalmente, este compuesto logra tener una estabilidad en el sitio predicho por el docking molecular a lo largo de 200 ns de simulación. Lo anterior, junto con sus propiedades ADMET predichas y estudios de biodisponibilidad de sus derivados, se puede sugerir a la pelargonidina 3-arabinósido como compuesto que contribuye a la posible inhibición del complejo proteico NS2B/NS3pro.
dc.description.abstractenglishDengue is a tropical disease caused by dengue virus (DENV) infection. There are an estimated 390 million infections each year. Despite major efforts to develop anti-DENV compounds, there is still no antiviral treatment or effective vaccine. One of the main targets to develop new drugs is the NS2B/NS3pro complex due to its important role during the viral cycle. In this investigation, we used computational technics such as molecular docking and molecular dynamics simulations to test the stability of plant’s secondary metabolites after the interaction with the NS2B/NS3pro protein complex to suggest it as a lead compound. Based on the above, we determine that pelargonidin 3-arabinoside shows strong interactions with catalytic triad residues His-51, Asp-75, and Ser-135 as well as key amino acid residues for the correct processing and recognition of substrates like Gly-133 and Gly-153. Additionally, this compound reaches stabilities on the site predicted by molecular docking through the 200 nm simulation. These results, as well as the predicted ADMET properties and previous bioavailability studies of its derivate, we can suggest pelargonidin 3-arabinoside as a compound that contributes to possible inhibition of the NS2B/NS3pro protein complex.
dc.description.degreelevelPregrado
dc.description.degreenameQuímico
dc.description.orcidhttps://orcid.org/0000-0003-0217-8702
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.identifier.instnameUniversidad Industrial de Santander
dc.identifier.reponameUniversidad Industrial de Santander
dc.identifier.repourlhttps://noesis.uis.edu.co
dc.identifier.urihttps://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/14442
dc.language.isospa
dc.publisherUniversidad Industrial de Santander
dc.publisher.facultyFacultad de Ciencias
dc.publisher.programQuímica
dc.publisher.schoolEscuela de Química
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.coarhttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.creativecommonsAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)
dc.rights.licenseAttribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.subjectVirus del dengue
dc.subjectMetabolito secundario
dc.subjectPelargonidina 3-arabinósido
dc.subjectcomplejo proteico NS2B/NS3pro
dc.subject.keywordDengue virus
dc.subject.keywordsecondary metabolite
dc.subject.keywordPelargonidin 3-arabinoside
dc.subject.keywordNS2B/NS3pro protein complex
dc.titleIdentificación de metabolitos secundarios de plantas como posibles agentes antivirales contra el virus del dengue teniendo como diana farmacológica la proteína NS2B/NS3pro
dc.title.englishIdentification of plant’s secondary metabolites as potential antiviral agents against dengue virus targeting the NS2BNS3pro protein complex
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.hasversionhttp://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
dc.type.localTesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado
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