Análisis de la diversidad genética de Potamotrygon magdalenae (Duméril, 1865) de ciénagas del Magdalena Medio empleando secuencias mitocondriales

Amado García, Carlos Arturo

Análisis de la diversidad genética de Potamotrygon magdalenae (Duméril, 1865) de ciénagas del Magdalena Medio empleando secuencias mitocondriales

dc.contributor.advisor	Rondón González, Fernando
dc.contributor.advisor	López Ardila, Iván Yesid
dc.contributor.author	Amado García, Carlos Arturo
dc.contributor.evaluator	Marchant Rojas, Sergio Andrés
dc.date.accessioned	2023-03-08T13:14:39Z
dc.date.available	2023-03-08T13:14:39Z
dc.date.created	2023-03-07
dc.date.embargoEnd	2028-11-10
dc.date.issued	2023-03-07
dc.description.abstract	La raya del Magdalena (Potamotrygon magdalenae) es la única especie endémica de elasmobranquio dulceacuícola presente en territorio colombiano. Las poblaciones de esta especie son vulnerables ante amenazas antropogénicas y naturales. Dado el desconocimiento de aspectos genéticos poblacionales, se evaluó la diversidad, flujo y estructura genética de P. magdalenae en tres ciénagas de la cuenca media del río Magdalena. Para esto, se obtuvieron secuencias parciales del gen mitocondrial Cyt b de 60 individuos. Se estimaron diferentes parámetros genéticos poblacionales, se construyeron redes de haplotipos y se realizaron análisis asociados a la historia demográfica de la especie. Secuencias de 693 pb, después de edición, permitieron identificar un total de 22 haplotipos. En promedio se evidenció alta diversidad haplotípica (hd = 0.83277) y baja nucleotídica (π = 0.00246), estimas que disminuyen latitudinalmente en sentido norte - sur. El valor φST = -0.0083 indica la inexistencia de estructura poblacional soportada por alto flujo de individuos efectivos por generación. Adicionalmente, se detectaron señales de elevada correlación positiva entre las distancias genéticas y geográficas y de expansión demográfica de la especie. El ingreso de elasmobranquios a territorio continental por el mar Caribe explicaría el patrón de diversidad genética encontrado. Asimismo, no se desvirtúa que tanto factores antropogénicos como variables ambientales de la cuenca del río Magdalena puedan influir en el elevado flujo genético que presenta P. magdalenae en cerca de 200 km de extensión considerados en el muestreo.
dc.description.abstractenglish	The Magdalena stingray (Potamotrygon magdalenae) is the only endemic species of freshwater elasmobranch present in Colombia. Populations of this species are vulnerable to anthropogenic and natural threats. Given the lack of knowledge of population genetic aspects, we evaluated the diversity, flow and genetic structure of P. magdalenae in three swamps located in the middle basin of the Magdalena River. For this purpose, partial sequences of the mitochondrial gene Cyt b were obtained from 60 individuals. Different population genetic parameters were estimated, haplotype networks were constructed and analyses associated with the demographic history of the species were performed. Sequences of 693 bp, after editing, allowed the identification of a total of 22 haplotypes. On average, high haplotypic diversity (hd = 0.83277) and low nucleotide diversity (π = 0.00246) were evident, estimates that decrease latitudinally in a north-south direction. The value φST = -0.0083 indicates the absence of population structure supported by a high flow of effective individuals per generation. Additionally, signs of high positive correlation between genetic and geographic distances and demographic expansion of the species were detected. The entry of elasmobranchs to continental territory through the Caribbean Sea would explain the pattern of genetic diversity found. Likewise, it is not refuted that both anthropogenic factors and environmental variables of the Magdalena River basin may influence the high gene flow that P. magdalenae presents in the nearly 200 km of extension considered in the sampling.
dc.description.degreelevel	Pregrado
dc.description.degreename	Biólogo
dc.format.mimetype	application/pdf
dc.identifier.instname	Universidad Industrial de Santander
dc.identifier.reponame	Universidad Industrial de Santander
dc.identifier.repourl	https://noesis.uis.edu.co
dc.identifier.uri	https://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/12444
dc.language.iso	spa
dc.publisher	Universidad Industrial de Santander
dc.publisher.faculty	Facultad de Ciencias
dc.publisher.program	Biología
dc.publisher.school	Escuela de Biología
dc.rights	info:eu-repo/semantics/embargoedAccess
dc.rights.accessrights	info:eu-repo/semantics/embargoedAccess
dc.rights.coar	http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.creativecommons	Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)
dc.rights.license	Attribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)
dc.rights.uri	http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.subject	ADN mitocondrial
dc.subject	Citocromo b
dc.subject	Elasmobranchii
dc.subject	Endémica
dc.subject	Haplotipos
dc.subject.keyword	Cytochrome b
dc.subject.keyword	Elasmobranchii
dc.subject.keyword	Endemic
dc.subject.keyword	Haplotypes
dc.subject.keyword	Mitochondrial DNA
dc.title	Análisis de la diversidad genética de Potamotrygon magdalenae (Duméril, 1865) de ciénagas del Magdalena Medio empleando secuencias mitocondriales
dc.title.english	Analysis of the Genetic Diversity of Potamotrygon magdalenae (Duméril, 1865) in the Magdalena Medio Region Swamps using Mithocondrial Sequences
dc.type.coar	http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.hasversion	http://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
dc.type.local	Tesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado
dspace.entity.type