Estructura y características del bacterioma intestinal del gusano barrenador la caña Diatraea saccharalis (Lepidoptera: Crambidae)

Atehortúa Bueno, María de los Ángeles

Estructura y características del bacterioma intestinal del gusano barrenador la caña Diatraea saccharalis (Lepidoptera: Crambidae)

dc.contributor.advisor	Hernández Torres, Jorge
dc.contributor.advisor	Castillo Villamizar, Genis Andrés
dc.contributor.author	Atehortúa Bueno, María de los Ángeles
dc.contributor.evaluator	Marchant Rojas, Sergio Andrés
dc.date.accessioned	2022-11-11T17:20:38Z
dc.date.available	2022-11-11T17:20:38Z
dc.date.created	2022-11-04
dc.date.embargoEnd	2027-11-04
dc.date.issued	2022-11-04
dc.description.abstract	La caña de azúcar es un cultivo importante en la economía colombiana para la producción de azúcar y etanol, entre otros. El barrenador de la caña de azúcar, Diatraea saccharalis, causa pérdidas económicas sustanciales. Las larvas del insecto perforan galerías dentro de los tallos y además facilitan la infección con hongos y bacterias. En las plantas jóvenes ocasionan la muerte del tejido apical y al final de toda la planta. Las bacterias del tracto digestivo cumplen, entre otros, un rol activo en la asimilación de los nutrientes ingeridos por los insectos. El presente trabajo de grado tiene como objetivo caracterizar los bacteriomas del tracto digestivo de D. saccharalis en estado larval, en función de dos tipos de dieta, natural y artificial. Mediante caracterización metataxonómica se identificaron los grupos taxonómicos presentes en el intestino de las larvas tratadas con dichas dietas, revelando que los géneros Wolbachia y Microbacterium son comunes entre los tratamientos, además de cinco familias ya reportadas en el intestino de otros lepidópteros. Adicionalmente, se establecieron perfiles funcionales con HUMAnN2, evidenciándose discrepancia en la estructura de las comunidades tratadas con cada tipo de alimento. A partir de microbiología tradicional, se identificaron 12 cepas con características biotecnológicas relevantes para futuros proyectos. Se secuenció el genoma completo de aquella que presentó mayor actividad celulolítica según pruebas cualitativas (GCEP-101). El análisis del genoma cerrado reveló que GCEP-101 tiene identidades 16S rRNA y valores ANI y dDDH que lo ubican dentro del género Pseudomonas. La anotación del genoma de esta probable nueva especie reveló la aparición de genes asociados con la degradación de la celulosa, revelando el potencial de D. saccharalis como reservorio de microorganismos biotecnológicamente relevantes.
dc.description.abstractenglish	Sugarcane is an important crop in the Colombian economy for the production of sugar and ethanol, among others. The sugarcane borer, Diatraea saccharalis, causes substantial economic losses. The larvae of the insect perforate galleries inside the stems and also facilitate infection with fungi and bacteria. In young plants they cause the death of the apical tissue and at the end of the entire plant. The bacteria of the digestive tract fulfill, among others, an active role in the assimilation of the nutrients ingested by the insects. The objective of this degree work is to characterize the bacteriomas of the digestive tract of D. saccharalis in the larval stage, based on two types of diet, natural and artificial. Through metataxonomic characterization, the taxonomic groups present in the intestine of the larvae treated with these diets were identified, revealing that the genera Wolbachia and Microbacterium are common among the treatments, in addition to five families already reported in the intestine of other Lepidoptera. Additionally, functional profiles with HUMAnN2 were established, showing discrepancies in the structure of the communities treated with each type of food. Based on traditional microbiology, 12 strains with relevant biotechnological characteristics were identified for future projects. The complete genome of the one that presented the highest cellulolytic activity according to qualitative tests (GCEP-101) was sequenced. Closed genome analysis revealed that GCEP-101 has 16S rRNA identities and ANI and dDDH values that place it within the genus Pseudomonas. Annotation of the genome of this likely new species revealed the appearance of genes associated with cellulose degradation, revealing the potential of D. saccharalis as a reservoir of biotechnologically relevant microorganisms.
dc.description.degreelevel	Pregrado
dc.description.degreename	Biólogo
dc.format.mimetype	application/pdf
dc.identifier.instname	Universidad Industrial de Santander
dc.identifier.reponame	Universidad Industrial de Santander
dc.identifier.repourl	https://noesis.uis.edu.co
dc.identifier.uri	https://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/12023
dc.language.iso	spa
dc.publisher	Universidad Industrial de Santander
dc.publisher.faculty	Facultad de Ciencias
dc.publisher.program	Biología
dc.publisher.school	Escuela de Biología
dc.rights	info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.accessrights	info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.coar	http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.creativecommons	Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)
dc.rights.license	Attribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)
dc.rights.uri	http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.subject	Metagenómica
dc.subject	Diatraea
dc.subject	Bacterioma
dc.subject	Celulolítico
dc.subject	Enzimas
dc.subject.keyword	Metagenomics
dc.subject.keyword	Diatraea
dc.subject.keyword	Bacteriome
dc.subject.keyword	Cellulolytic
dc.subject.keyword	Enzymes
dc.title	Estructura y características del bacterioma intestinal del gusano barrenador la caña Diatraea saccharalis (Lepidoptera: Crambidae)
dc.title.english	Structure and characteristics of the intestinal bacteriome of the sugarcane borer Diatraea saccharalis (Lepidoptera: Crambidae)
dc.type.coar	http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.hasversion	http://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
dc.type.local	Tesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado
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