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Ensamblaje de novo y anotación funcional in silico de las toxinas encontradas en la glándula de Duvernoy de las serpientes Boiruna sertaneja y Erythrolamprus aesculapii

Resumen

Durante más de un siglo, los venenos de serpiente se han sometido a análisis mediante técnicas de primera generación, que incluyen la química de proteínas, la farmacología comparativa y los métodos cladísticos generados de la biología evolutiva. Además, los avances en biología molecular, particularmente en las llamadas técnicas de secuenciación “ómicas” (Genómica, Transcriptómica y Proteómica) ampliaron la comprensión de la composición y catalogación de los venenos. En la actualidad, los métodos de nueva generación, en los cuales se incluyen la secuenciación transcriptómica (RNA-seq), la secuenciación genómica y la espectrometría de masas de alta resolución, han acelerado la obtención de secuencias y los análisis composicionales, sentando las bases para la exploración biotecnológica a gran escala de los venenos de serpiente. Debido a que la mayoria de información importante de las familias y superfamilias de toxinas reportadas, ha sido a partir de venenos de serpientes que principalmente representan un riesgo para la salud humana (Viperidae, Elapidae y Atractaspididae), la diversidad de toxinas en serpientes productoras de veneno no se ha evaluado de forma homogénea en todos los grupos, dejando un enorme vacío en el conocimiento del repertorio de toxinas en especies pertenecientes a la familia Colubridae. En la presente pasantía se ensamblaron de novo los transcriptomas de la glándula de Duvernoy de Boiruna sertaneja y Erythrolamprus aesculapii utilizando diferentes tipos de software en el proceso de ensamblaje (enfoque híbrido), identificando un total de 20 familias de toxinas, siendo las SVMP-PIII, CRISPs y CTLs las familias de toxinas predominantes en la gándula de Duvernoy de los individuos estudiados de estas dos especies. Además, se identificaron dos familias de toxinas (MMPs y PLA2-IIE) que han sido poco reportadas en los venenos de serpientes.