Caracterización estructural y funcional de genes candidatos de defensa en la interacción coffea arábica - roya del cafeto
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Date
2007
Authors
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Publisher
Universidad Industrial de Santander
Abstract
Diez fragmentos entre 110 y 600 pb, generados a partir de librerías sustractivas de hoja de Coffea arabica inducidas con la roya del café (Hemileia vastatrix) 24 horas pos-inoculación, fueron utilizados para caracterizar estructuralmente las secuencias aledañas 5´ y 3´ mediante la técnica de GenomeWalker. Con una tasa de extensión promedio de 3,5 bases nuevas por cada base conocida, se obtuvieron 15 unigenes con longitudes que variaron entre 510 y 2900 pb. Sólo tres unigenes presentaron homología con secuencias reportadas en GenBank: un retrotransposon, una proteína rica en Glicina y una proteína de función desconocida de Arabidopsis thaliana, impidiendo asignar una función putativa a alguno de ellos. Para validar si estos genes podían considerarse como candidatos a genes de defensa en la interacción C. arabica Œ H. vastatrix se realizó un análisis de expresión diferencial relativa para cada una de las secuencias por medio de qRT-PCR en los dos genotipos de café, susceptible y resistente (cultivar Caturra e Híbrido de Timor), en una serie de tiempos de 39, 63 y 87 horas pos-inoculación. Dos secuencias (48H21 y 48H37) presentaron una inducción en su expresión en el genotipo resistente, en el tiempo descrito para la aparición de las primeras células madres de haustorio del patógeno (hora 63). La formación de las células del haustorio desencadena en otras plantas una cascada de defensas que culmina en interacciones incompatibles. Estudios más detallados de la expresión y estructura de estos genes pueden ser útiles para proveer herramientas para el diseño de alternativas de control genético más eficientes y durables para el café y otros cultivos.
Description
Keywords
Coffea arabica, Hemileia vastratix, QRT-PCR, GenomeWalker, Expresión relativa, Defensa.