Relación evolutiva de los intrones con base en el Modelo de Pérdida de ADN para las familias de neuropéptidos LWamida, APGWamida, Hormona Concentradora de Pigmentos Rojos, Hormona Adipocinética, Corazonina y Hormona Liberadora de Gonadotropina

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dc.contributor.advisorMartínez Pérez, Francisco José
dc.contributor.advisorJiménez Gutiérrez, Laura Rebeca
dc.contributor.authorReyes Tarazona, María Alejandra
dc.contributor.evaluatorGarzón Gutiérrez, Luz Nayibe
dc.date.accessioned2022-11-14T23:37:23Z
dc.date.available2022-11-14T23:37:23Z
dc.date.created2022-11-14
dc.date.issued2022-11-14
dc.description.abstractLos mecanismos celulares que regulan la pérdida y ganancia de intrones son ampliamente estudiados, ya que dan indicios de cómo se generó la diversidad de la vida. Así, diversos modelos evolutivos han planteado el origen de genes y sus posibles causas. Ejemplo de esto, son las hipótesis de intrones o los supuestos formulados para la evolución de la Hormona Adipocinética (AKH), Corazonina (CRZ), Hormona Liberadora de Gonadotropina (GnRH) y precursores híbridos como la Hormona Adipocinética/Corazonina (ACP). Sin embargo, solo el Modelo de Pérdida de ADN (DNA-LM), describe el origen de genes neuroendocrinos a partir de perdida de nucleótidos y movimiento de intrones. Aquí determinamos in silico con los principios del DNA-LM, las posiciones, fases intrónicas y sitios de Proto-empalme (Protosplice) de los genes de las familias de neuropéptidos antes mencionadas junto con la LWamida (LW), APGWamida (APGW), Hormona Concentradora de Pigmentos Rojos (RPCH) y el precursor híbrido APGW/AKH, para establecer sus relaciones filogenéticas por medio de la conservación de intrones ortólogos y su evolución por pérdida y/o ganancia de intrones. Los resultados presentaron un intrón ortólogo en casi todas las secuencias, para la LW se cree que lo perdió en su desarrollo. Por otro lado, se encontró un patrón de distribución de las fases, los intrones fase 1 y 2 se ubican mayormente en el extremo 5’, donde se determinaron nuevos intrones, mientras los de fase 0 que fueron predominantes, se asentaban en el extremo 3’, en el intrón conservado; lo que sugirió que los nuevos intrones no se integran aleatoriamente. Finalmente, se logró establecer la relación ancestral de estas familias neuropéptidicas por medio del intrón ortólogo. Los intrones recientes y los sitios remanentes de proto-empalme en ORF que no poseen intrones, fueron evidencia de la evolución independiente de cada linaje, lo que contribuyó a corroborar el DNA-LM.
dc.description.abstractenglishThe cellular mechanisms that regulate the loss and gain of introns are widely studied, since they provide clues about how the diversity of life. Thus, various evolutionary models have been proposed on the origin of genes and their possible causes. An example of the above are the different hypotheses of introns or the assumptions made for the evolution of Adipokinetic Hormone (AKH), Corazonin (CRZ), Gonadotropin-Releasing Hormone (GnRH) and hybrid precursors such as Adipokinetic Hormone/Corazonin (ACP). However, only the DNA Loss Model (DNA-LM) describes the origin of neuroendocrine genes from nucleotide loss and intron movement. By in silico analysis with the principles of DNA-LM, we determined the positions, intronic phases and protosplices sites of the genes encoding the neuropeptide families together with LWamide (LW), APGWamide (APGW), Red Pigment Concentrating Hormone (RPCH) and the hybrid precursor APGW/AKH, to establish their phylogenetic relationships through the conservation of orthologous introns and their evolution by loss and/or gain of introns. The results presented an orthologous intron in almost all the sequences, for LW it was considered that it was lost in its development. On the other hand, a distribution pattern of the phases was displayed; phase 1 and 2 introns were located mostly at the 5' end, where new introns were observed. Meanwhile the predominant phase 0 introns were found at the 3’ end in the conserved intron, which suggested that new introns do not integrate randomly. Finally, it is possible to establish the ancestral relationship of these neuropeptide families through the orthologous intron. The recent introns and the remnant sites of proto splicing in ORFs that did not possess introns, was evidence of the independent evolution of each lineage, which contributed to the DNA-LM corroboration.
dc.description.degreelevelPregrado
dc.description.degreenameBiólogo
dc.description.orcidhttps://orcid.org/0000-0001-9677-3371
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.identifier.instnameUniversidad Industrial de Santander
dc.identifier.reponameUniversidad Industrial de Santander
dc.identifier.repourlhttps://noesis.uis.edu.co
dc.identifier.urihttps://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/12043
dc.language.isospa
dc.publisherUniversidad Industrial de Santander
dc.publisher.facultyFacultad de Ciencias
dc.publisher.programBiología
dc.publisher.schoolEscuela de Biología
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.coarhttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.creativecommonsAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)
dc.rights.licenseAttribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.subjectIntrones
dc.subjectEvolución de intrones
dc.subjectFase intrón
dc.subjectSitios proto-empalme
dc.subjectEvolución de neuropéptidos
dc.subjectDNA-LM
dc.subject.keywordIntrons
dc.subject.keywordIntron Evolution
dc.subject.keywordIntronic Phase
dc.subject.keywordProtosplice Sites
dc.subject.keywordNeuropeptide Evolution
dc.subject.keywordDNA-LM
dc.titleRelación evolutiva de los intrones con base en el Modelo de Pérdida de ADN para las familias de neuropéptidos LWamida, APGWamida, Hormona Concentradora de Pigmentos Rojos, Hormona Adipocinética, Corazonina y Hormona Liberadora de Gonadotropina
dc.title.englishEvolutionary relationship of introns based on the DNA Loss Model for the neuropeptide families LWamide, APGWamide, Red Pigment Concentrating Hormone, Adipokinetic Hormone, Corazonin and Gonadotropin Releasing Hormone
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.hasversionhttp://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
dc.type.localTesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado
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Biología