Análisis de la diversidad genética a partir de secuencias del gen ND2 de euphonia laniirostris en tres localidades de Santander, Colombia
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Date
2018
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Publisher
Universidad Industrial de Santander
Abstract
Euphonia laniirostris es una especie de ave de amplia distribución y menor preocupación según la IUCN, con diferentes estudios relacionados con su biología, pero ninguno con su diversidad genética y por ende con su conservación; motivada, por lo general, por el descenso en el tamaño poblacional. Pocos estudios se centran en especies cosmopolitas, desconociendo sus dinámicas poblacionales y grado de amenaza, los cuales a futuro pueden ser importantes en la implementación de programas de conservación que involucren estas especies. Con base en lo anterior, el objetivo del presente trabajo fue estimar la diversidad y el grado de estructura genética de E. laniirostris a partir del uso de secuencias del gen ND2 del ADNmt. Para esto se amplificó y secuenció el gen ND2 en 39 muestras de E. laniirostris recolectadas en tres localidades del departamento de Santander, Colombia. Las secuencias fueron editadas con BioEdit v.7.0.5 (1999) y ensambladas en Mega v.7.0. (2016). Distintos parámetros genéticos poblacionales y de estructura genética fueron estimados con Arlequin v.3.5 (2010). Producto de esta investigación se caracterizaron 36 haplotipos en E. laniirostris entre las posiciones 17 a 964 del gen ND2, entre las que se encontraron 21,4% de sitios polimórficos. San Benito presentó mayor número de haplotipos (15), La Hacienda el Roble mayor diversidad nucleotídica 236) y menor flujo génico (Nm=26,295 Roble-Diviso y Nm=13,180 Roble-San Benito). Adicionalmente, se encontró poca diferenciación genética pero altamente significativa entre las localidades consideradas (=0,02909, p=0,00587), 9/947 sitios polimórficos estarían contribuyendo a la poca diferenciación. A partir de las secuencias ND2 analizadas en E. laniirostris se concluye que esta especie de jilguero constituye una metapoblación, con ligera diferenciación genética en las localidades estudiadas, debido a la falta de haplotipos compartidos, distintos sitios privados y nueve sitios polimórficos que aportan a la misma. Además, el presente estudio brinda evidencia que soporta la importancia de conservar los bosques asociados a cafetales de la Hacienda El Roble, dado que en estos se detectó el mayor número de haplotipos distintivos de esta especie de jilguero aparentemente cosmopolita.
Description
Keywords
Diversidad Genética, Adnmt, Haplotipos.